概括
基因 1618年
象征 达兹
同义词 dazh | dazl1 | dazla | spgyla
描述 在Azoospermia中删除
参考 MIM:601486|HGNC:HGNC:2685|Ensembl:ENSG0000000092345|HPRD:09029|Vega:Otthumg00000157050
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P24.3
Pascal P值 0.358
胎儿β -0.348
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG16639713 3 16646904 达兹 5.651E-4 0.368 0.049 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16869851 CHR4 20690056 达兹 1618年 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nfia 0.87 0.77
IGSF3 0.85 0.91
nfib 0.85 0.86
XPR1 0.85 0.92
Bcl11a 0.84 0.85
ITSN1 0.84 0.84
EPHB1 0.84 0.81
NFYA 0.84 0.90
vangl2 0.84 0.81
C10orf12 0.84 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TNFSF12 -0.52 -0.64
C5orf53 -0.52 -0.76
TMEM54 -0.51 -0.56
pth1r -0.50 -0.72
LHPP -0.50 -0.58
AIFM3 -0.50 -0.77
serpinb6 -0.50 -0.70
HLA-F -0.49 -0.72
hepn1 -0.49 -0.72
SLC9A3R2 -0.49 -0.47

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003676 核酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 塔斯 8968755
去:0003730 mRNA 3'-UTR结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 16001084
去:0008494 翻译激活剂活性 艾达 16001084
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006417 翻译调节 IEA -
去:0007283 精子发生 IEA -
去:0007281 生殖细胞发育 塔斯 9288969
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
GO:0045948 转化启动的积极调节 艾达 16001084
GO:0045836 减数分裂的阳性调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005844 多层 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 塔斯 9288969

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KIM对TSA和Decitabine的反应 129 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胶质母细胞瘤中甲基化的粘合剂 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管 83 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱因原发性积液淋巴瘤 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang被甲基化2沉默2 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su睾丸 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sato在胰腺癌中表观遗传沉默 49 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杰克逊DNMT1靶向 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen ETV5靶标 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN 42 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
精子中的韦伯甲基化的HCP 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk胚胎生殖细胞 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康拉德种系干细胞 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CXCR6和PTCH1 DN的SASAI目标 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染2小时 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wagschal EHMT2靶向 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Madan DPPA4目标 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-140 1000 1007 1A,M8 HSA-MIR-140 agugguuuuacccuaugguag
mir-21 719 725 M8 HSA-MIR-21 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-363 802 808 1a HSA-MIR-363 auugcacgguauccaucuguaa
mir-378* 561 567 1a HSA-MIR-422B cuggacuuggagagaaggcc
HSA-MIR-422A cuggacuagggucagaaggcc