基因页:达兹
概括?
基因 | 1618年 |
象征 | 达兹 |
同义词 | dazh | dazl1 | dazla | spgyla |
描述 | 在Azoospermia中删除 |
参考 | MIM:601486|HGNC:HGNC:2685|Ensembl:ENSG0000000092345|HPRD:09029|Vega:Otthumg00000157050 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P24.3 |
Pascal P值 | 0.358 |
胎儿β | -0.348 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG16639713 | 3 | 16646904 | 达兹 | 5.651E-4 | 0.368 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16869851 | CHR4 | 20690056 | 达兹 | 1618年 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DAZL_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nfia | 0.87 | 0.77 |
IGSF3 | 0.85 | 0.91 |
nfib | 0.85 | 0.86 |
XPR1 | 0.85 | 0.92 |
Bcl11a | 0.84 | 0.85 |
ITSN1 | 0.84 | 0.84 |
EPHB1 | 0.84 | 0.81 |
NFYA | 0.84 | 0.90 |
vangl2 | 0.84 | 0.81 |
C10orf12 | 0.84 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TNFSF12 | -0.52 | -0.64 |
C5orf53 | -0.52 | -0.76 |
TMEM54 | -0.51 | -0.56 |
pth1r | -0.50 | -0.72 |
LHPP | -0.50 | -0.58 |
AIFM3 | -0.50 | -0.77 |
serpinb6 | -0.50 | -0.70 |
HLA-F | -0.49 | -0.72 |
hepn1 | -0.49 | -0.72 |
SLC9A3R2 | -0.49 | -0.47 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
去:0003723 | RNA结合 | 塔斯 | 8968755 | |
去:0003730 | mRNA 3'-UTR结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16001084 | |
去:0008494 | 翻译激活剂活性 | 艾达 | 16001084 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006417 | 翻译调节 | IEA | - | |
去:0007283 | 精子发生 | IEA | - | |
去:0007281 | 生殖细胞发育 | 塔斯 | 9288969 | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
GO:0045948 | 转化启动的积极调节 | 艾达 | 16001084 | |
GO:0045836 | 减数分裂的阳性调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005844 | 多层 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 9288969 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KIM对TSA和Decitabine的反应 | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胶质母细胞瘤中甲基化的粘合剂 | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
留置权乳腺癌化生型与导管 | 83 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱因原发性积液淋巴瘤 | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang被甲基化2沉默2 | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sato在胰腺癌中表观遗传沉默 | 49 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杰克逊DNMT1靶向 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen ETV5靶标 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN | 42 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
精子中的韦伯甲基化的HCP | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk胚胎生殖细胞 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康拉德种系干细胞 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CXCR6和PTCH1 DN的SASAI目标 | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染2小时 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wagschal EHMT2靶向 | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Madan DPPA4目标 | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-140 | 1000 | 1007 | 1A,M8 | HSA-MIR-140脑 | agugguuuuacccuaugguag |
mir-21 | 719 | 725 | M8 | HSA-MIR-21脑 | uagcuuaucagacugauguuga |
HSA-MIR-590 | gagcuuauucauaaaaagugcag | ||||
mir-363 | 802 | 808 | 1a | HSA-MIR-363 | auugcacgguauccaucuguaa |
mir-378* | 561 | 567 | 1a | HSA-MIR-422B | cuggacuuggagagaaggcc |
HSA-MIR-422A | cuggacuagggucagaaggcc |