基因页:DBI
Summary?
基因ID | 1622 |
Symbol | DBI |
同义词 | ACBD1 | ACBP | CCK-RP | EP |
描述 | 地西epa抑制剂(GABA受体调节剂,酰基-COA结合蛋白) |
参考 | MIM:125950|HGNC:HGNC:2690|ENSEMBL:ENSG00000155368|HPRD:08832|Vega:Otthumg00000131403 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2Q12-Q21 |
Pascal P值 | 0.395 |
胎儿β | -0.303 |
支持 | 细胞代谢 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | Psr: 0.023 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00755 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25899024 | 2 | 120125358 | C2orf76; DBI | 4.504E-4 | -0.41 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DBI_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CTSK | 0.63 | 0.63 |
OMD | 0.61 | 0.67 |
S100A11 | 0.58 | 0.67 |
CFI | 0.57 | 0.62 |
C1S | 0.57 | 0.64 |
fcgrt | 0.55 | 0.60 |
SLC6A13 | 0.55 | 0.60 |
LPAR6 | 0.54 | 0.69 |
OLFML1 | 0.54 | 0.60 |
C7 | 0.53 | 0.68 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AKAP8L | -0.43 | -0.48 |
UPF3A | -0.43 | -0.51 |
SFRS8 | -0.43 | -0.50 |
TCOF1 | -0.42 | -0.48 |
PABPN1 | -0.42 | -0.49 |
ZBTB17 | -0.42 | -0.47 |
sart1 | -0.41 | -0.49 |
SFRS16 | -0.41 | -0.45 |
PACS2 | -0.40 | -0.46 |
HIRIP3 | -0.40 | -0.48 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000062 | acyl-CoA binding | IEA | - | |
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0008289 | 脂质结合 | IEA | - | |
GO:0030156 | 苯二氮卓受体结合 | 塔斯 | 3020548 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006810 | transport | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-495 | 212 | 218 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |