基因页面:RHBDL3
总结吗?
| GeneID | 162494年 |
| 象征 | RHBDL3 |
| 同义词 | RHBDL4 | VRHO |
| 描述 | 菱形,veinlet-like 3(果蝇) |
| 参考 | HGNC: HGNC: 16502|运用:ENSG00000141314|HPRD: 07501|织女:OTTHUMG00000179568 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 q11.2 |
| 帕斯卡假定值 | 2.806 e-5 |
| 夏洛克假定值 | 0.717 |
| 胎儿β | -0.449 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg22976366 | 17 | 30608367 | RHBDL3 | 5.724的军医 | -0.278 | 0.049 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1860410 | 17 | 30628733 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 2.088 e - | 0 | 35538年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs60947667 | 17 | 30629365 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 2.574 e - | 0 | 36170年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16967266 | 17 | 30632274 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.495 e-8 | 0 | 39079年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8074594 | 17 | 30632998 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.463 e-8 | 0 | 39803年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4794915 | 17 | 30634363 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.685 e-8 | 0 | 41168年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11657299 | 17 | 30634951 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.738 e-8 | 0 | 41756年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11653974 | 17 | 30635002 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.685 e-8 | 0 | 41807年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs62064225 | 17 | 30635429 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.718 e-8 | 0 | 42234年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4794916 | 17 | 30635954 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.786 e-8 | 0 | 42759年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4794917 | 17 | 30636146 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 5.778 e-8 | 0 | 42951年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4795692 | 17 | 30636688 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 7.118 e-8 | 0 | 43493年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4795693 | 17 | 30636727 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 7.236 e-8 | 0 | 43532年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs57002890 | 17 | 30637371 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 9.868 e-8 | 0 | 44176年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202213910 | 17 | 30637730 | RHBDL3 | ENSG00000141314.8 | 7.02 e - | 0 | 44535年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004252 | serine-type肽链内切酶活性 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:7) | - - - - - - |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008233 | 肽酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 百度转移了 | 214年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTORIATI MDM4目标神经上皮DN | 164年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1 DN的目标 | 543年 | 317年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯DN TP53的目标 | 593年 | 372年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53目标DN | 591年 | 366年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王GSK3反应抑制剂SB216763 DN | 374年 | 217年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 124.1 | 3249年 | 3256年 | 1、m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-124/506 | 3249年 | 3255年 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| miR-31 | 3083年 | 3089年 | m8 | hsa-miR-31 | AGGCAAGAUGCUGGCAUAGCUG |