基因页:DEDD2
概括?
基因 | 162989 |
象征 | DEDD2 |
同义词 | 火焰3 |
描述 | 死亡效应域包含2 |
参考 | HGNC:HGNC:24450|ENSEMBL:ENSG00000160570|HPRD:10868|Vega:Otthumg00000182763 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.2 |
Pascal P值 | 0.127 |
Sherlock P值 | 0.884 |
胎儿β | -0.449 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22968175 | 19 | 42721878 | DEDD2 | 1.41E-9 | -0.027 | 1.38e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG21126943 | 19 | 42259395 | DEDD2 | 5.1E-5 | -3.52 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17022908 | CHR2 | 38783057 | DEDD2 | 162989 | 0.2 | 反式 | ||
RS11884118 | CHR2 | 47268112 | DEDD2 | 162989 | 0.14 | 反式 | ||
RS12829851 | CHR12 | 53125144 | DEDD2 | 162989 | 0.13 | 反式 | ||
RS1053733 | CHR17 | 43183027 | DEDD2 | 162989 | 0.17 | 反式 | ||
RS7249844 | CHR19 | 29228262 | DEDD2 | 162989 | 0.1 | 反式 | ||
RS4805270 | CHR19 | 29309693 | DEDD2 | 162989 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DEDD2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NOJIMA SFRP2靶向 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色 | 136 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |