基因页：DCX

Summary？
基因 1641
象征 DCX
Synonyms dbcn | dc | lisx | sclh | xlis
Description Doublecortin
Reference MIM：300121|HGNC：HGNC：2714|Ensembl：ENSG00000077279|HPRD：02127|Vega：Otthumg00000022204
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ22.3-Q23
Sherlock p-value 0.249
胎儿β 4.044
支持 潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：5

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CUL2 0.90 0.88
HBS1L 0.90 0.89
PSMD1 0.89 0.86
RTCD1 0.89 0.86
Med6 0.89 0.85
SRP54 0.89 0.89
NRD1 0.89 0.85
VPS35 0.89 0.86
广告 0.89 0.86
immt 0.88 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.76 -0.63
AF347015.2 -0.75 -0.62
AF347015.8 -0.75 -0.63
mt-cyb -0.73 -0.62
AF347015.33 -0.73 -0.62
AF347015.21 -0.73 -0.59
AF347015.15 -0.72 -0.63
AF347015.31 -0.72 -0.64
AF347015.26 -0.72 -0.60
AF347015.27 -0.69 -0.61

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0008017 微管结合 TAS 11001923
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 IEA 大脑（GO期限：7） -
GO:0001764 神经元迁移 IEA 神经元（GO期限：8） -
GO:0048675 axon extension IEA axon (GO term level: 13) -
GO：0021952 中枢神经系统投影神经元轴突发生 IEA 神经元，轴突（GO术语级别：14） -
GO：0048813 树突形态发生 IEA 神经突，树突（GO期限：12） -
去：0007242 细胞内信号传导级联 IEA -
去：0007275 multicellular organismal development IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005856 细胞骨架 TAS 11001923
去：0005875 microtubule associated complex TAS 11001923
去：0005737 cytoplasm IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
PID LIS1途径 28 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME DEVELOPMENTAL BIOLOGY 396 292 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Axon指导 251 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome L1CAM相互作用 86 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni pax foxo1手臂签名 59 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP 255 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI RHABDOMYOSARCOMA PAX FOXO1 FUSION UP 64 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN 175 82 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EBAUER TARGETS OF PAX3 FOXO1 FUSION UP 207 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM DN 164 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS 988 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLI1融合DN的Rorie目标 30 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
牙槽横纹肌肉瘤 98 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TESAR ALK目标Episc 3D UP 7 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TESAR ALK目标Episc 4d Up 7 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tesar Alk和Jak靶向鼠标D4 5 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jepsen SMRT目标 33 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HANN对BCL2抑制剂的抗性 36 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础 648 398 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞向上 260 174 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VERHAAK GLIOBLASTOMA PRONEURAL 177 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 2756 2762 M8 hsa-let-7abrain ugagguaguaguauauaguu
hsa-let-7bbrain ugagguaguagguuguguguguu
hsa-let-7cbrain ugagguaguagguuguaugguu
hsa-let-7dbrain AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
hsa-let-7ebrain ugagguaggagguuauauagu
hsa-let-7fbrain ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98brain ugagguaaguuguauuguu
hsa-let-7gSZ ugagguaguuguuguacagu
hsa-let-7ibrain ugagguaguugugugugugcugu
miR-128 7744 7750 1a hsa-miR-128a ucacagugaaccggucuuuu
hsa-miR-128b ucacagugaaccggucuuc
hsa-miR-128a ucacagugaaccggucuuuu
hsa-miR-128b ucacagugaaccggucuuc
mir-129-5p 1054 1060 1a HSA-MIR-129brain cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
miR-151 7707 7713 1a HSA-MIR-151brain Acuagacugaagcucuugagg
miR-182 1108 1114 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
miR-183 6710 6716 M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
miR-200bc/429 2954 2960 1a hsa-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
hsa-miR-200c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa-miR-429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
mir-203.1 6917 6923 M8 hsa-miR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-25/32/92/363/367 6068 6074 1a hsa-miR-25brain Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-27 882 888 M8 HSA-MIR-27Abrain uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27Bbrain uucacaguggcuaaguucugc
HSA-MIR-27Abrain uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27Bbrain uucacaguggcuaaguucugc
mir-29 89 95 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-5p 354 361 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
hsa-miR-30cbrain UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30dSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30bSZ uguaaacauccuaccucucagcu
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir-329 7867 7873 1a HSA-MIR-329brain aacacaccugguaaccucuuu
mir-330 2931 2937 M8 hsa-miR-330brain GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
miR-34/449 1105 1112 1A，M8 hsa-miR-34abrain uggcaguguuaguguguuuu
hsa-miR-34c Aggcaguguaguagcugauugc
hsa-miR-449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-342 884 890 1a hsa-miR-342brain ucucacacagaaaucgcacccccguc
miR-362 2910 2916 1a HSA-MIR-362 aauccuuggaaccuaggugugugugugugagu
mir-504 3207 3214 1A，M8 HSA-MIR-504 agacccugucugcacucuau
mir-543 1251 1257 1a hsa-miR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-9 7785 7791 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-96 1108 1114 1a HSA-MIR-96brain uuuggcacuagcacauuuuugc