基因页:DDB2
概括?
基因 | 1643年 |
象征 | DDB2 |
同义词 | ddbb | uv-ddb2 | xpe |
描述 | 损害特异性DNA结合蛋白2 |
参考 | MIM:600811|HGNC:HGNC:2718|ENSEMBL:ENSG00000134574|HPRD:02886|Vega:Otthumg00000187453 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P11.2 |
Pascal P值 | 0.012 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DDB2 | Chr11 | 47256457 | G | 一个 | NM_000107 | 。 | 沉默的 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2070396 | CHR21 | 30878751 | DDB2 | 1643年 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DDB2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HSF2 | 0.97 | 0.95 |
CEP57 | 0.97 | 0.96 |
arfgap3 | 0.97 | 0.94 |
MIO | 0.97 | 0.96 |
polr2b | 0.97 | 0.95 |
Tex10 | 0.96 | 0.93 |
XRN2 | 0.96 | 0.95 |
ZNF195 | 0.96 | 0.94 |
CNOT2 | 0.96 | 0.96 |
dync1i2 | 0.96 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.92 |
AIFM3 | -0.75 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.90 |
HLA-F | -0.75 | -0.80 |
MT-CO2 | -0.74 | -0.91 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.89 |
TSC22D4 | -0.73 | -0.83 |
mt-cyb | -0.73 | -0.89 |
ifi27 | -0.73 | -0.89 |
pth1r | -0.72 | -0.78 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG核苷酸切除修复 | 44 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG P53信号通路 | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组核苷酸切除修复 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome全球基因组NER GG NER | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GG NER中切口复合物的反应组形成 | 23 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
加兹达钻石黑芬贫血髓样骨髓 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee神经Crest干细胞DN | 118 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chow RASSF1目标DN | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤 | 45 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kerley对Cisplatin的反应 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson DNA损伤响应TP53 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
曼恩对amifostine的反应 | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 | 38 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TSAI对电离辐射的响应 | 149 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kannan TP53目标 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺 | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kang氟尿嘧啶抵抗 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chung水泡细胞毒性 | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村转移模型DN | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan V1晚分化基因DN | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WARTERS对IR皮肤的反应 | 83 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WARTERS红外响应5GY | 47 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |