概括
基因 1643年
象征 DDB2
同义词 ddbb | uv-ddb2 | xpe
描述 损害特异性DNA结合蛋白2
参考 MIM:600811|HGNC:HGNC:2718|ENSEMBL:ENSG00000134574|HPRD:02886|Vega:Otthumg00000187453
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P11.2
Pascal P值 0.012
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
DDB2 Chr11 47256457 G 一个 NM_000107 沉默的 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2070396 CHR21 30878751 DDB2 1643年 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HSF2 0.97 0.95
CEP57 0.97 0.96
arfgap3 0.97 0.94
MIO 0.97 0.96
polr2b 0.97 0.95
Tex10 0.96 0.93
XRN2 0.96 0.95
ZNF195 0.96 0.94
CNOT2 0.96 0.96
dync1i2 0.96 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.75 -0.92
AIFM3 -0.75 -0.82
AF347015.27 -0.75 -0.90
HLA-F -0.75 -0.80
MT-CO2 -0.74 -0.91
AF347015.33 -0.73 -0.89
TSC22D4 -0.73 -0.83
mt-cyb -0.73 -0.89
ifi27 -0.73 -0.89
pth1r -0.72 -0.78

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG核苷酸切除修复 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG P53信号通路 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组核苷酸切除修复 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA修复 112 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome全球基因组NER GG NER 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GG NER中切口复合物的反应组形成 23 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
加兹达钻石黑芬贫血髓样骨髓 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chow RASSF1目标DN 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤 45 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kerley对Cisplatin的反应 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson DNA损伤响应TP53 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson遗传毒性签名 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
曼恩对amifostine的反应 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 38 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对电离辐射的响应 149 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kannan TP53目标 58 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kang氟尿嘧啶抵抗 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移模型DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V1晚分化基因DN 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS对IR皮肤的反应 83 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS红外响应5GY 47 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因