概括?
GeneID 1649年
年代ymbol DDIT3
同义词 Cebpz | Chop | Chop-10 | Chop10 | Gadd153
描述 DNA损伤诱导笔录3
参考 MIM:126337|HGNC:HGNC:2726|Ensembl:ENSG00000175197|HPRD:00529|Vega:OTTHUMG00000170046
Gene type protein-coding
地图位置 12Q13.1-Q13.2
Pascal P值 0.482
Sherlock P值 0.655
Fetal beta -1.405
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 年代ystematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta(dis) FDR (dis) 年代tudy
cg11557658 12 57914033 DDIT3 1.64E-8 -0.017 6.04E-6 DMG:Jaffe_2016

@EQTL注释

年代NP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs3765543 chr9 134458323 DDIT3 1649年 0.13 trans
rs1344796 chr12 76397104 DDIT3 1649年 0.02 trans

年代ection II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
年代C: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
年代T1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ATF3 - 激活转录因子3 - HPRD,Biogrid 8622660
BATF B-ATF | BATF1 | SFA-2 基本亮氨酸拉链转录因子,类似ATF 两个杂交 BioGRID 16189514
C10orf119 FLJ13081 | FLJ36756 | MCM-BP | MCMBP chromosome 10 open reading frame 119 两个杂交 BioGRID 16189514
CEBPB C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β DDIT3 (CHOP) interacts with CEBPB (NF-IL6). BIND 15775988
CEBPB C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β - HPRD 1547942
CEBPB C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 8662954|12706815
CEBPE C/EBP-epsilon | CRP1 CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), epsilon C/EBP-EPSILON与CHOP相互作用。 BIND 15588942
CEBPG GPE1BP | IG/EBP-1 CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), gamma 两个杂交 BioGRID 16189514
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide - HPRD,Biogrid 12876286
FOS AP-1 | C-FOS v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog - HPRD,Biogrid 10523647
HSD17B14 DHRS10 |RETSDR3 hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 14 两个杂交 BioGRID 16189514
JUN AP-1 | AP1 | c-Jun Jun Oncogene - HPRD,Biogrid 10523647
JUND AP-1 jun D proto-oncogene - HPRD,Biogrid 10523647
MAPK14 CSBP1 | CSBP2 | CSPB1 | EXIP | Mxi2 | PRKM14 | PRKM15 | RK | SAPK2A | p38 | p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 - HPRD,Biogrid 8650547
皮基 冷静|Clth |圈 phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein - HPRD,Biogrid 1547942
RPS3A fte1 |mftl |MGC23240 核糖体蛋白S3A - HPRD,Biogrid 10713066
年代POP tef2 speckle-type POZ protein 两个杂交 BioGRID 16189514
TRIB3 C20orf97 | NIPK | SINK | SKIP3 | TRB3 tribbles homolog 3 (Drosophila) TRIB3 (TRB3) interacts with DDIT3 (CHOP). BIND 15775988


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA P38MAPK PATHWAY 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATF2途径 59 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta下游途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid myc抑制道路 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DIABETES PATHWAYS 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PERK REGULATED GENE EXPRESSION 29 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATF6 Alpha对伴侣的反应组激活 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATF4对基因激活的反应组激活 26 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATF6α对伴侣基因的反应组激活 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS BLUE UP 136 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scibetta KDM5B靶向 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGASHIMA NRG1 SIGNALING UP 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PACHER TARGETS OF IGF1 AND IGF2 UP 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR DN 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR DN 75 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF UP 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER UP 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAMJAUN APOPTOSIS BY TGFB1 VIA MAPK1 DN 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURJANSKI MAPK14 TARGETS 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahadevan对MP470 DN的响应 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYLLYKANGAS AMPLIFICATION HOT SPOT 21 9 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shi Sparc靶向 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAN从Anoikis逃脱 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对电离辐射的响应 149 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代HETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUH与ID1和ID2共同表达 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERY CEBP目标 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marciniak ER应力响应通过CHOP 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOREAUX B LYMPHOCYTE MATURATION BY TACI UP 92 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NATSUME RESPONSE TO INTERFERON BETA UP 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS HYPOXIA 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delaserna Myod目标DN 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHUANG OXIDATIVE STRESS RESPONSE UP 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEONARD HYPOXIA 47 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D5 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE CALORIE RESTRICTION MUSCLE UP 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张增殖与静止 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING NEOCORTEX UP 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 0HR 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 11 57 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH RESPONSE TO ARSENITE C1 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS UP 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE AMINO ACID DEPRIVATION 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
抗原表现中的Pellicciotta HDAC 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION DN 105 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHO NR4A1目标 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATI G2M ARREST BY 2METHOXYESTRADIOL DN 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PODAR RESPONSE TO ADAPHOSTIN UP 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRESHOCK CANCER COPY NUMBER UP 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY CCND1 MYC 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D 89 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERRARI RESPONSE TO FENRETINIDE UP 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 36HR UP 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS UP 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代HAFFER IRF4 TARGETS IN MYELOMA VS MATURE B LYMPHOCYTE 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代HAFFER IRF4 TARGETS IN PLASMA CELL VS MATURE B LYMPHOCYTE 67 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JISON SICKLE CELL DISEASE UP 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOO LIVER CANCER RECURRENCE UP 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 1 68 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS UP 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应中间 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 1HR DN 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RARG BOUND MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RAR BOUND ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因