基因页:DDIT3
概括?
GeneID | 1649年 |
年代ymbol | DDIT3 |
同义词 | Cebpz | Chop | Chop-10 | Chop10 | Gadd153 |
描述 | DNA损伤诱导笔录3 |
参考 | MIM:126337|HGNC:HGNC:2726|Ensembl:ENSG00000175197|HPRD:00529|Vega:OTTHUMG00000170046 |
Gene type | protein-coding |
地图位置 | 12Q13.1-Q13.2 |
Pascal P值 | 0.482 |
Sherlock P值 | 0.655 |
Fetal beta | -1.405 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
Gene set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
DMG:Jaffe_2016 | Genome-wide DNA methylation analysis | This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | 年代ystematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Differentially methylated gene
探测 | Chromosome | Position | Nearest gene | P (dis) | beta(dis) | FDR (dis) | 年代tudy |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg11557658 | 12 | 57914033 | DDIT3 | 1.64E-8 | -0.017 | 6.04E-6 | DMG:Jaffe_2016 |
EQTL注释
年代NP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs3765543 | chr9 | 134458323 | DDIT3 | 1649年 | 0.13 | trans | ||
rs1344796 | chr12 | 76397104 | DDIT3 | 1649年 | 0.02 | trans |
年代ection II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DDIT3_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
年代C: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
年代T1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ATF3 | - | 激活转录因子3 | - | HPRD,Biogrid | 8622660 |
BATF | B-ATF | BATF1 | SFA-2 | 基本亮氨酸拉链转录因子,类似ATF | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
C10orf119 | FLJ13081 | FLJ36756 | MCM-BP | MCMBP | chromosome 10 open reading frame 119 | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β | DDIT3 (CHOP) interacts with CEBPB (NF-IL6). | BIND | 15775988 |
CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β | - | HPRD | 1547942 |
CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 8662954|12706815 |
CEBPE | C/EBP-epsilon | CRP1 | CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), epsilon | C/EBP-EPSILON与CHOP相互作用。 | BIND | 15588942 |
CEBPG | GPE1BP | IG/EBP-1 | CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), gamma | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
CSNK2A1 | CK2A1 |CKII | casein kinase 2, alpha 1 polypeptide | - | HPRD,Biogrid | 12876286 |
FOS | AP-1 | C-FOS | v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog | - | HPRD,Biogrid | 10523647 |
HSD17B14 | DHRS10 |RETSDR3 | hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 14 | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
JUN | AP-1 | AP1 | c-Jun | Jun Oncogene | - | HPRD,Biogrid | 10523647 |
JUND | AP-1 | jun D proto-oncogene | - | HPRD,Biogrid | 10523647 |
MAPK14 | CSBP1 | CSBP2 | CSPB1 | EXIP | Mxi2 | PRKM14 | PRKM15 | RK | SAPK2A | p38 | p38ALPHA | mitogen-activated protein kinase 14 | - | HPRD,Biogrid | 8650547 |
皮基 | 冷静|Clth |圈 | phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein | - | HPRD,Biogrid | 1547942 |
RPS3A | fte1 |mftl |MGC23240 | 核糖体蛋白S3A | - | HPRD,Biogrid | 10713066 |
年代POP | tef2 | speckle-type POZ protein | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
TRIB3 | C20orf97 | NIPK | SINK | SKIP3 | TRB3 | tribbles homolog 3 (Drosophila) | TRIB3 (TRB3) interacts with DDIT3 (CHOP). | BIND | 15775988 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA P38MAPK PATHWAY | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ATF2途径 | 59 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID p38 alpha beta下游途径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid myc抑制道路 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME DIABETES PATHWAYS | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PERK REGULATED GENE EXPRESSION | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ATF6 Alpha对伴侣的反应组激活 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ATF4对基因激活的反应组激活 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome展开的蛋白质反应 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ATF6α对伴侣基因的反应组激活 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS BLUE UP | 136 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Scibetta KDM5B靶向 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NAGASHIMA NRG1 SIGNALING UP | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PACHER TARGETS OF IGF1 AND IGF2 UP | 35 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR DN | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR DN | 75 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARKEY RB1 ACUTE LOF UP | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER UP | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RAMJAUN APOPTOSIS BY TGFB1 VIA MAPK1 DN | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TURJANSKI MAPK14 TARGETS | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahadevan对MP470 DN的响应 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYLLYKANGAS AMPLIFICATION HOT SPOT 21 | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP | 81 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shi Sparc靶向 | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAN从Anoikis逃脱 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TSAI对电离辐射的响应 | 149 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
年代HETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SUH与ID1和ID2共同表达 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERY CEBP目标 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marciniak ER应力响应通过CHOP | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MOREAUX B LYMPHOCYTE MATURATION BY TACI UP | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NATSUME RESPONSE TO INTERFERON BETA UP | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HARRIS HYPOXIA | 81 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod目标DN | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHUANG OXIDATIVE STRESS RESPONSE UP | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEONARD HYPOXIA | 47 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D5 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE CALORIE RESTRICTION MUSCLE UP | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张增殖与静止 | 51 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE AGING NEOCORTEX UP | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 0HR | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BURTON ADIPOGENESIS 11 | 57 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向 | 113 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YIH RESPONSE TO ARSENITE C1 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERHOLD ADIPOGENESIS UP | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRIGE AMINO ACID DEPRIVATION | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
抗原表现中的Pellicciotta HDAC | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HELLER SILENCED BY METHYLATION DN | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHO NR4A1目标 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHATI G2M ARREST BY 2METHOXYESTRADIOL DN | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PODAR RESPONSE TO ADAPHOSTIN UP | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WINTER HYPOXIA METAGENE | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRESHOCK CANCER COPY NUMBER UP | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WANG NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY CCND1 MYC | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D | 89 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FERRARI RESPONSE TO FENRETINIDE UP | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG TLX TARGETS 36HR UP | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG TLX TARGETS UP | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
年代HAFFER IRF4 TARGETS IN MYELOMA VS MATURE B LYMPHOCYTE | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
年代HAFFER IRF4 TARGETS IN PLASMA CELL VS MATURE B LYMPHOCYTE | 67 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JISON SICKLE CELL DISEASE UP | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WOO LIVER CANCER RECURRENCE UP | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG REGULATED BY MYC DN | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LU EZH2 TARGETS UP | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应中间 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PLASARI TGFB1 TARGETS 1HR DN | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DELACROIX RARG BOUND MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DELACROIX RAR BOUND ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |