概括
基因 1650
象征 ddost
同义词 ager1 | cdg1r | okswcl45 | ost | ost48 | wbp1
描述 多甲基 - 二磷酸糖 - 蛋白质糖基转移酶非催化亚基
参考 MIM:602202|HGNC:HGNC:2728|ENSEMBL:ENSG00000244038|HPRD:03728|Vega:Otthumg00000002844
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.1
Pascal P值 0.926
Sherlock P值 0.633
胎儿β -0.073
DMG 1(#研究)
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.043

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14519150 1 20985249 ddost 3.291E-4 0.474 0.041 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Cul3 0.92 0.92
SNAPC3 0.90 0.90
PRPF18 0.89 0.88
yme1l1 0.89 0.90
SKIV2L2 0.89 0.89
MSH2 0.89 0.89
GPBP1 0.88 0.87
GGNBP2 0.88 0.89
fip1l1 0.88 0.85
SMNDC1 0.88 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.73 -0.76
MT-CO2 -0.72 -0.74
higd1b -0.72 -0.77
AF347015.33 -0.71 -0.72
AF347015.2 -0.70 -0.71
AF347015.8 -0.70 -0.72
mt-cyb -0.70 -0.72
ifi27 -0.70 -0.77
FXYD1 -0.70 -0.74
AF347015.15 -0.68 -0.71

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004579 多甲基 - 二磷酸糖蛋白 - 糖蛋白糖苷转移酶活性 艾达 9642163
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006496 蛋白氨基酸末端N-糖基化 艾达 9642163
GO:0034097 对细胞因子刺激的反应 艾达 9642163
GO:0018279 蛋白氨基酸N连接糖基化通过天冬酰胺 我知道了 15835887
GO:0042110 T细胞激活 艾达 9642163
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005792 微型体 艾达 9642163
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0008250 寡核酸转移酶复合酶 塔斯 15835887

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg n glycan生物合成 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SRP依赖性共透明蛋白靶向膜 179 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome晚期糖基化终产受体信号传导 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mayburd对L663536 DN的反应 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘鼻咽癌 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori浆细胞向上 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 128 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma dn 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nutt GBM与AO胶质瘤 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因