基因页面:DDX5

总结吗?
GeneID 1655年
象征 DDX5
同义词 G17P1 | HLR1 | HUMP68 | 2
描述 出局区解旋酶5
参考 MIM: 180630|HGNC: HGNC: 2746|运用:ENSG00000108654|HPRD: 01615|织女:OTTHUMG00000178936
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 17岁的温度系数
帕斯卡假定值 0.452
夏洛克假定值 0.521
胎儿β 0.76
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.0876

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg23225508 17 62500377 DDX5 1.56 e-5 0.618 0.015 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs3217906 chr12 4405803 DDX5 1655年 0.17 反式
rs3217933 chr12 4412999 DDX5 1655年 0.19 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000166 核苷酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0003712 代数余子式转录活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0003723 核糖核酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0003724 RNA解旋酶的活动 NAS 1996094
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 17220478|17353931
去:0005524 ATP结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0016787 水解酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0016818 水解酶活性,作用于卤酸酐、酐 国际能源机构 - - - - - -
去:0008026 ATP-dependent解旋酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006397 信使rna加工 国际能源机构 - - - - - -
去:0008380 RNA拼接 国际能源机构 - - - - - -
去:0016049 细胞生长 NAS 2451786
去:0045941 积极的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 核 NAS 2451786
去:0005681 剪接体 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
AKAP8 AKAP95 | DKFZp586B1222 激酶(PRKA)锚蛋白8 - - - - - - HPRD, BioGRID 11279182
CDKN1A P21 CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1 (p21 Cip1) 2与p21启动子进行交互。 绑定 15660129
CREBBP 海关与边境保护局| KAT3A | rst 结合蛋白分子 - - - - - - HPRD, BioGRID 12527917
DDX17 DKFZp761H2016 | P72 | RH70 死(Asp-Glu-Ala-Asp)盒子多肽17 p72与2。 绑定 12595555
EP300 KAT3B | p300 E1A结合蛋白p300 亲和力Capture-Western BioGRID 12527917
ESR1 ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 雌激素受体1 亲和力Capture-Western
2台混合动力		 BioGRID 10409727
ESR1 ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 雌激素受体1 ESR1 (ER-alpha)与DDX5 (2)。之间的交互是仿照了交互ESR1从物种和DDX5不详不详的物种。 绑定 12738788
FBL FIB | FLRN | RNU3IP1 fibrillarin - - - - - - HPRD, BioGRID 10837141
HDAC1 DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 组蛋白脱乙酰酶1 亲和力Capture-Western BioGRID 15298701
MAP3K7 TAK1 | TGF1a 增殖蛋白激酶激酶激酶7 - - - - - - HPRD 14743216
STK24 MST-3 | MST3 | MST3B | STE20 | STK3 丝氨酸/苏氨酸激酶24 (STE20同族体、酵母) 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 2与p53交互。 绑定 15660129


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG剪接体 128年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA AKAP95通路 12 9 所有SZGR 2.0基因通路
PID P53下游通路 137年 94年 所有SZGR 2.0基因通路
WAMUNYOKOLI卵巢癌LMP DN 199年 124年 所有SZGR 2.0基因通路
OUELLET卵巢癌浸润性对LMP 117年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH NANOG目标 988年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SOX2目标 734年 436年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH MYC最大目标 775年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
NIKOLSKY乳腺癌17 Q25对方篮里扩增子 335年 181年 所有SZGR 2.0基因通路
祖奇转移DN 44 29日 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER PBL肾移植好的VS捐赠者DN 41 30. 所有SZGR 2.0基因通路
肯尼CTNNB1 DN的目标 52 34 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 555年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
FERRANDO T与MLL ENL融合起来 87年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
斯通内尔食管致癌作用了 39 25 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病早期布莱洛克的DN 165年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
李老化肌肉了 45 33 所有SZGR 2.0基因通路
西方肾上腺皮质肿瘤DN 546年 362年 所有SZGR 2.0基因通路
王肿瘤侵袭性了 374年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
萧管家基因 389年 245年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋触性了 518年 299年 所有SZGR 2.0基因通路
JISON镰状细胞病DN 181年 97年 所有SZGR 2.0基因通路
小野AML1目标了 24 14 所有SZGR 2.0基因通路
小野FOXP3目标了 23 15 所有SZGR 2.0基因通路
党由MYC DN 253年 192年 所有SZGR 2.0基因通路
党MYC目标了 143年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
党受MYC 1103年 714年 所有SZGR 2.0基因通路
MARTENS受PML RARA融合 456年 287年 所有SZGR 2.0基因通路
马顿斯维甲酸反应DN 841年 431年 所有SZGR 2.0基因通路
卡MIR302A目标 77年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
DN FEVR CTNNB1目标 553年 343年 所有SZGR 2.0基因通路
PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 344年 215年 所有SZGR 2.0基因通路
德拉克洛瓦RARG绑定MEF 367年 231年 所有SZGR 2.0基因通路
艾布拉姆森与问卷调查 45 33 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-1/206 163年 169年 m8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
miR-141/200a 211年 217年 m8 hsa - mir - 141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa - mir - 200 a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
mir - 142 - 5 - p 43 49 1 hsa - mir - 142 - 5 - p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d 129年 135年 m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
hsa-miR-20a大脑 UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 106 a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa - mir - 106 b深圳 UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20b深圳 CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 519 d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir - 205 257年 263年 m8 hsa - mir - 205 UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG
mir - 324 - 3 - p 209年 215年 m8 hsa - mir - 324 - 3 - p CCACUGCCCCAGGUGCUGCUGG
mir - 325 195年 201年 1 hsa - mir - 325 CCUAGUAGGUGUCCAGUAAGUGU
mir - 496 15 21 1 hsa - mir - 496 AUUACAUGGCCAAUCUC
mir - 539 155年 161年 m8 hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU
mir - 544 94年 101年 1、m8 hsa - mir - 544 AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU