概括
基因 1662年
象征 DDX10
同义词 HRH-J8
描述 死盒解旋酶10
参考 MIM:601235|HGNC:HGNC:2735|ENSEMBL:ENSG00000178105|HPRD:03138|Vega:Otthumg00000166540
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q22-Q23
Pascal P值 0.104
Sherlock P值 0.704
胎儿β -0.336
DMG 1(#研究)
主持人 皮质
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
DDX10 Chr11 108577470 一个 G NM_004398
NM_004398

p.410k> e
拼接
错过
精神分裂症 DNM:XU_2012

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23074401 11 108535840 DDX10 8.59e-9 -0.01 3.99e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CNN1 0.90 0.88
tagln 0.88 0.83
ACTG2 0.81 0.72
myl9 0.80 0.82
acta2 0.77 0.79
ITIH3 0.77 0.67
MGP 0.73 0.82
TPM2 0.62 0.52
CRIP1 0.58 0.64
LMOD1 0.57 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C16orf88 -0.30 -0.65
WDR6 -0.29 -0.64
ewsr1 -0.29 -0.64
FAM48A -0.29 -0.64
PHKA2 -0.29 -0.68
C17orf85 -0.29 -0.66
KIAA1949 -0.29 -0.66
setDB1 -0.29 -0.65
KCTD5 -0.28 -0.64
nkiras2 -0.28 -0.60

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 IEA -
去:0003724 RNA解旋酶活性 塔斯 8660968
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
去:0008026 ATP依赖性解旋酶活性 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005886 质膜 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应红色 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤带有7Q删除 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
myllykangas放大热点23 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuhmacher MYC的目标 80 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haslinger B Cll,带有11q23删除 23 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V2晚分化基因 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU对维甲酸和NSC682994 DN的响应 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gajate对Trabectedin DN的响应 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线低剂量DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen ETV5靶标 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因