基因页:DDX10
概括?
基因 | 1662年 |
象征 | DDX10 |
同义词 | HRH-J8 |
描述 | 死盒解旋酶10 |
参考 | MIM:601235|HGNC:HGNC:2735|ENSEMBL:ENSG00000178105|HPRD:03138|Vega:Otthumg00000166540 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q22-Q23 |
Pascal P值 | 0.104 |
Sherlock P值 | 0.704 |
胎儿β | -0.336 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 皮质 |
支持 | COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DDX10 | Chr11 | 108577470 | 一个 | G | NM_004398 NM_004398 |
。 p.410k> e |
拼接 错过 |
精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23074401 | 11 | 108535840 | DDX10 | 8.59e-9 | -0.01 | 3.99e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DDX10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CNN1 | 0.90 | 0.88 |
tagln | 0.88 | 0.83 |
ACTG2 | 0.81 | 0.72 |
myl9 | 0.80 | 0.82 |
acta2 | 0.77 | 0.79 |
ITIH3 | 0.77 | 0.67 |
MGP | 0.73 | 0.82 |
TPM2 | 0.62 | 0.52 |
CRIP1 | 0.58 | 0.64 |
LMOD1 | 0.57 | 0.76 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C16orf88 | -0.30 | -0.65 |
WDR6 | -0.29 | -0.64 |
ewsr1 | -0.29 | -0.64 |
FAM48A | -0.29 | -0.64 |
PHKA2 | -0.29 | -0.68 |
C17orf85 | -0.29 | -0.66 |
KIAA1949 | -0.29 | -0.66 |
setDB1 | -0.29 | -0.65 |
KCTD5 | -0.28 | -0.64 |
nkiras2 | -0.28 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
去:0003724 | RNA解旋酶活性 | 塔斯 | 8660968 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
去:0008026 | ATP依赖性解旋酶活性 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应红色 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤带有7Q删除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
myllykangas放大热点23 | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuhmacher MYC的目标 | 80 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haslinger B Cll,带有11q23删除 | 23 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan V2晚分化基因 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU对维甲酸和NSC682994 DN的响应 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin的反应 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gajate对Trabectedin DN的响应 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线低剂量DN | 67 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen ETV5靶标 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |