基因页:CFD
概括?
基因 | 1675年 |
象征 | CFD |
同义词 | adipsin | adn | df | pfd |
描述 | 补体因子D(adipsin) |
参考 | MIM:134350|HGNC:HGNC:2771|Ensembl:ENSG00000197766|HPRD:00600|Vega:Otthumg00000181840 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.3 |
Pascal P值 | 0.509 |
胎儿β | -1.47 |
主持人 | 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS62132300 | 19 | 862355 | CFD | ENSG00000197766.3 | 8.04304E-7 | 0.01 | 2902 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62132301 | 19 | 862396 | CFD | ENSG00000197766.3 | 1.78544e-7 | 0.01 | 2943 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71743169 | 19 | 863435 | CFD | ENSG00000197766.3 | 4.94654E-7 | 0.01 | 3982 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12150957 | 19 | 863892 | CFD | ENSG00000197766.3 | 3.09358E-7 | 0.01 | 4439 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62132322 | 19 | 887226 | CFD | ENSG00000197766.3 | 3.74972E-7 | 0.01 | 27773 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62132323 | 19 | 887434 | CFD | ENSG00000197766.3 | 5.29429E-7 | 0.01 | 27981 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM40A | 0.92 | 0.92 |
EDC3 | 0.92 | 0.92 |
PABPC4 | 0.92 | 0.89 |
C7orf26 | 0.91 | 0.90 |
dem1 | 0.91 | 0.90 |
ythdf2 | 0.91 | 0.93 |
COPG2 | 0.91 | 0.91 |
阿克利 | 0.90 | 0.91 |
CHMP7 | 0.90 | 0.90 |
FDXACB1 | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.78 | -0.89 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.87 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.86 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.83 |
mt-cyb | -0.75 | -0.85 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.87 |
ifi27 | -0.74 | -0.85 |
FXYD1 | -0.74 | -0.85 |
HLA-F | -0.73 | -0.76 |
AF347015.15 | -0.72 | -0.84 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸(GO期限:7) | 1374388 |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | 塔斯 | 1374388 | |
去:0006957 | 补体激活,替代途径 | 经验 | 162484 | |
去:0006957 | 补体激活,替代途径 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 经验 | 6459901 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | IEA | - | |
GO:0031093 | 血小板α颗粒管腔 | 经验 | 6459901 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg补充和凝结级联 | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Comp Pathway | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome补充级联 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome初始触发补充 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与小叶正常DN | 69 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ginestier乳腺癌20q13扩增 | 119 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2向上 | 139 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cdx2靶向 | 36 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马良性皮肤肿瘤DN | 18 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马恶性皮肤肿瘤DN | 18 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合DN的Begum目标 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 | 87 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujiwara Park2肝细胞增殖DN | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与PML RARA FUSION | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病DN | 121 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up | 87 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Golub所有vs AML DN | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中岛嗜酸性粒细胞 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN | 63 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iglesias E2F目标 | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF DN的反应 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gajate对trabectedin的反应 | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙齿龋齿DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化的PPARG的LI脂肪生成 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng对H2O2的响应 | 71 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成6 | 189 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌腔 | 84 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng IL22发出信号 | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向 | 93 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集4 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集10 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
val aml与evi1 | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇6的时间反应6 | 75 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold对TZD DN的反应 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染2小时 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang PPARG的经典成脂靶 | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |