概括
基因 1675年
象征 CFD
同义词 adipsin | adn | df | pfd
描述 补体因子D(adipsin)
参考 MIM:134350|HGNC:HGNC:2771|Ensembl:ENSG00000197766|HPRD:00600|Vega:Otthumg00000181840
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.3
Pascal P值 0.509
胎儿β -1.47
主持人 梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS62132300 19 862355 CFD ENSG00000197766.3 8.04304E-7 0.01 2902 gtex_brain_putamen_basal
RS62132301 19 862396 CFD ENSG00000197766.3 1.78544e-7 0.01 2943 gtex_brain_putamen_basal
RS71743169 19 863435 CFD ENSG00000197766.3 4.94654E-7 0.01 3982 gtex_brain_putamen_basal
RS12150957 19 863892 CFD ENSG00000197766.3 3.09358E-7 0.01 4439 gtex_brain_putamen_basal
RS62132322 19 887226 CFD ENSG00000197766.3 3.74972E-7 0.01 27773 gtex_brain_putamen_basal
RS62132323 19 887434 CFD ENSG00000197766.3 5.29429E-7 0.01 27981 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM40A 0.92 0.92
EDC3 0.92 0.92
PABPC4 0.92 0.89
C7orf26 0.91 0.90
dem1 0.91 0.90
ythdf2 0.91 0.93
COPG2 0.91 0.91
阿克利 0.90 0.91
CHMP7 0.90 0.90
FDXACB1 0.90 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.78 -0.89
AF347015.31 -0.77 -0.87
AF347015.27 -0.77 -0.86
AF347015.33 -0.75 -0.83
mt-cyb -0.75 -0.85
AF347015.8 -0.74 -0.87
ifi27 -0.74 -0.85
FXYD1 -0.74 -0.85
HLA-F -0.73 -0.76
AF347015.15 -0.72 -0.84

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 塔斯 谷氨酸(GO期限:7) 1374388
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 塔斯 1374388
去:0006957 补体激活,替代途径 经验 162484
去:0006957 补体激活,替代途径 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 经验 6459901
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 IEA -
GO:0031093 血小板α颗粒管腔 经验 6459901

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg补充和凝结级联 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Comp Pathway 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome补充级联 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome初始触发补充 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与小叶正常DN 69 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ginestier乳腺癌20q13扩增 119 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2向上 139 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cdx2靶向 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马良性皮肤肿瘤DN 18 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马恶性皮肤肿瘤DN 18 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合DN的Begum目标 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujiwara Park2肝细胞增殖DN 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病DN 121 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Golub所有vs AML DN 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中岛嗜酸性粒细胞 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iglesias E2F目标 151 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gajate对trabectedin的反应 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化的PPARG的LI脂肪生成 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng对H2O2的响应 71 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由KRAS DN 120 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌腔 84 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng IL22发出信号 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集4 31 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集10 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
val aml与evi1 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇6的时间反应6 75 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold对TZD DN的反应 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染2小时 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang PPARG的经典成脂靶 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因