基因页：科克

Summary？
GeneID 1690
象征 科克
同义词 COCH-5B2 | COCH5B2 | DFNA9
描述 科克林
参考 MIM：603196|HGNC：HGNC：2180|Ensembl：ENSG00000100473|HPRD：04431|Vega：Otthumg0000000029432
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14q11.2-q13
Pascal P值 0.837
DEG P值 DEG：SANDERS_2014：DS1_P = -0.148：DS1_BETA = 0.039400：DS2_P = 1.09E-02：DS2_BETA = -0.128：DS2_FDR = 7.78E-02
主持人 额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别
元

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG：Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS596985 CHR1 64277034 科克 1690 0 反式
RS17131472 CHR1 91962966 科克 1690 0.07 反式
RS6693444 CHR1 98690213 科克 1690 0 反式
RS16838771 CHR1 157511227 科克 1690 0.02 反式
RS3770675 CHR2 39480214 科克 1690 0.1 反式
RS10865148 CHR2 39488831 科克 1690 0.04 反式
RS2302749 CHR2 39494196 科克 1690 0.04 反式
RS10865150 CHR2 39529875 科克 1690 0.16 反式
RS6712274 CHR2 39627454 科克 1690 0.14 反式
rs16823058 CHR2 170317903 科克 1690 0.02 反式
RS12466062 CHR2 188137037 科克 1690 0.1 反式
RS17044102 CHR3 17889838 科克 1690 0.19 反式
RS6793457 CHR3 62053678 科克 1690 0.02 反式
RS10937395 CHR3 189336369 科克 1690 0.19 反式
RS491989 CHR5 31452998 科克 1690 0.02 反式
RS6893045 CHR5 31473728 科克 1690 0.15 反式
RS620498 CHR5 133869269 科克 1690 0.07 反式
RS17101786 CHR5 143702446 科克 1690 0.04 反式
RS10055809 CHR5 143766245 科克 1690 0.02 反式
RS283063 CHR6 118621313 科克 1690 4.68e-5 反式
RS283058 CHR6 118625224 科克 1690 0.15 反式
RS1411442 Chr9 72210550 科克 1690 0.08 反式
RS1411441 Chr9 72210608 科克 1690 0.07 反式
RS17143455 Chr10 8368252 科克 1690 0 反式
rs7081986 Chr10 90807242 科克 1690 0.04 反式
RS7969972 CHR12 15763898 科克 1690 0.12 反式
RS4644683 CHR12 15780762 科克 1690 0.1 反式
RS4764219 CHR12 15812187 科克 1690 0.01 反式
RS7295589 CHR12 15816182 科克 1690 0.1 反式
RS16945668 CHR12 115934729 科克 1690 0.19 反式
RS10047895 CHR14 57512171 科克 1690 0.15 反式
RS1953844 CHR14 82453917 科克 1690 0.1 反式
RS7177212 CHR15 34425413 科克 1690 0.02 反式
RS284907 CHR15 76741568 科克 1690 0.13 反式
RS284898 CHR15 76750694 科克 1690 0.06 反式
RS16959711 CHR16 56597605 科克 1690 0.1 反式
RS8056861 CHR16 56921039 科克 1690 0.08 反式
RS443222 CHR16 83889679 科克 1690 0.15 反式
RS824575 CHR16 83891459 科克 1690 0.15 反式
RS7503018 CHR17 37931219 科克 1690 0.18 反式
RS11873703 CHR18 61448702 科克 1690 0.03 反式
RS1883665 Chrx 17650382 科克 1690 3.018e-8 反式
RS7062071 Chrx 17724830 科克 1690 9.796E-5 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007605 sensory perception of sound 塔斯 9806553
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
去：0005578 proteinaceous extracellular matrix IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KHSV miRNA的Samols目标 8 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gal白血病干细胞DN 244 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
korkola蛋黄囊肿瘤 62 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RICKMAN HEAD AND NECK CANCER B 48 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath ES 1 379 235 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
安倍的内耳 48 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 473 224 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 469 239 All SZGR 2.0 genes in this pathway
替代转移 14 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础 648 398 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bochkis foxa2目标 425 261 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 All SZGR 2.0 genes in this pathway
figueroa aml甲基化簇3 170 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
figueroa aml甲基化簇4 112 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
figueroa aml甲基化簇6 140 81 All SZGR 2.0 genes in this pathway
figueroa aml甲基化簇7 118 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wierenga Stat5A靶向 217 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wierenga Stat5a Targets Group2 60 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组C的UVC响应 92 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM糖蛋白 196 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA核心母质 275 148 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-137 797 804 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
miR-378 234 240 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu