基因页面:SNX31
总结吗?
| GeneID | 169166年 |
| 象征 | SNX31 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 排序nexin 31 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 28605|运用:ENSG00000174226|HPRD: 17545|织女:OTTHUMG00000164725 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 q22.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.858 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Gulsuner_2013 | 全外显子组测序分析 | 155认为被外显子组测序的四三个为一组,或精神分裂症的个人和他们的父母。 | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SNX31 | chr8 | 101624302 | C | G | NM_152628 | p.179L F > | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Gulsuner_2013 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7370564 | 0 | SNX31 | 169166年 | 0.17 | 反式 | |||
| rs1786345 | 8 | 101674751 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 7.191 e - | 0 | 892年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1693551 | 8 | 101675584 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.183 e-8 | 0 | 59 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1786342 | 8 | 101676363 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.12 e-6 | 0 | -720年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7831859 | 8 | 101676642 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.422 e - | 0 | -999年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2978098 | 8 | 101676675 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 3.513 e - | 0 | -1032年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1693567 | 8 | 101677386 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.221 e-8 | 0 | -1743年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11357738 | 8 | 101677428 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 5.923 e-8 | 0 | -1785年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1693568 | 8 | 101677693 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.183 e-8 | 0 | -2050年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1693571 | 8 | 101678349 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.183 e-8 | 0 | -2706年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2978101 | 8 | 101679224 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.183 e-8 | 0 | -3581年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2978102 | 8 | 101679411 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.183 e-8 | 0 | -3768年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs35251069 | 8 | 101679888 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 2.935 e-6 | 0 | -4245年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1693560 | 8 | 101680292 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.183 e-8 | 0 | -4649年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1693562 | 8 | 101681102 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 3.218 e-6 | 0 | -5459年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1786341 | 8 | 101681104 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 8.111 e - | 0 | -5461年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs13271135 | 8 | 101681976 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 3.001 e-6 | 0 | -6333年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs28723022 | 8 | 101682073 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 2.358 e-6 | 0 | -6430年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1786340 | 8 | 101682471 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 3.007 e-6 | 0 | -6828年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs33986428 | 8 | 101685422 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 2.606 e-6 | 0 | -9779年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1786337 | 8 | 101685470 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.829 e-6 | 0 | -9827年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs879391 | 8 | 101685694 | SNX31 | ENSG00000174226.4 | 1.896 e-6 | 0 | -10051年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌8 q12如扩增子 | 132年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |