基因页面:ADAMTS18
总结吗?
GeneID | 170692年 |
象征 | ADAMTS18 |
同义词 | ADAMTS21 | KNO2 | MMCAT |
描述 | 亚当metallopeptidase与血小板反应蛋白1型图案18 |
参考 | MIM: 607512|HGNC: HGNC: 17110|运用:ENSG00000140873|HPRD: 06333|织女:OTTHUMG00000137619 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q23处 |
帕斯卡假定值 | 0.75 |
胎儿β | -1.377 |
eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
认为:Gulsuner_2013 | 全外显子组测序分析 | 155认为被外显子组测序的四三个为一组,或精神分裂症的个人和他们的父母。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ADAMTS18 | chr16 | 77356337 | T | C | NM_199355 | p.687K > E | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Gulsuner_2013 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs17392743 | chr1 | 54764240 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.01 | 反式 | ||
rs17572651 | chr1 | 218943612 | ADAMTS18 | 170692年 | 0 | 反式 | ||
rs16829545 | chr2 | 151977407 | ADAMTS18 | 170692年 | 2.102 e - | 反式 | ||
rs3845734 | chr2 | 171125572 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.14 | 反式 | ||
rs7584986 | chr2 | 184111432 | ADAMTS18 | 170692年 | 1.76 e-8 | 反式 | ||
rs11934631 | chr4 | 54405096 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.12 | 反式 | ||
rs747592 | chr5 | 4883605 | ADAMTS18 | 170692年 | 0 | 反式 | ||
rs17762315 | chr5 | 76807576 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.06 | 反式 | ||
rs6892587 | chr5 | 133085407 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.08 | 反式 | ||
rs1368303 | chr5 | 147672388 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.01 | 反式 | ||
rs13191953 | chr6 | 24151042 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.13 | 反式 | ||
rs2393316 | chr10 | 59333070 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.02 | 反式 | ||
rs6574467 | chr14 | 79179744 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.08 | 反式 | ||
rs10146003 | chr14 | 79191170 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.08 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | ADAMTS18 | 170692年 | 7.751 e-19 | 反式 | ||
rs3743068 | chr15 | 79047284 | ADAMTS18 | 170692年 | 0.04 | 反式 | ||
rs1318021 | 16 | 77389088 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.681 e - | 0.02 | 79923年 | gtex_brain_ba24 |
rs866924 | 16 | 77389312 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 6.756 e - | 0.02 | 79699年 | gtex_brain_ba24 |
rs10514415 | 16 | 77390128 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.046 e - | 0.02 | 78883年 | gtex_brain_ba24 |
rs1392607 | 16 | 77390996 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 78015年 | gtex_brain_ba24 |
rs1392608 | 16 | 77391077 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 77934年 | gtex_brain_ba24 |
rs1392609 | 16 | 77391114 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 77897年 | gtex_brain_ba24 |
rs2562112 | 16 | 77391272 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 3.444 e - | 0.02 | 77739年 | gtex_brain_ba24 |
rs891133 | 16 | 77392867 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 76144年 | gtex_brain_ba24 |
rs891134 | 16 | 77393072 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.119 e - | 0.02 | 75939年 | gtex_brain_ba24 |
rs2650907 | 16 | 77393207 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 75804年 | gtex_brain_ba24 |
rs891136 | 16 | 77393811 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.248 e - | 0.02 | 75200年 | gtex_brain_ba24 |
rs2562114 | 16 | 77394134 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 74877年 | gtex_brain_ba24 |
rs57517352 | 16 | 77394478 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 3.601 e - | 0.02 | 74533年 | gtex_brain_ba24 |
rs2562115 | 16 | 77394592 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 74419年 | gtex_brain_ba24 |
rs937584 | 16 | 77395205 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 73806年 | gtex_brain_ba24 |
rs937585 | 16 | 77395259 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 73752年 | gtex_brain_ba24 |
rs1909802 | 16 | 77395948 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 73063年 | gtex_brain_ba24 |
rs2650905 | 16 | 77396431 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.033 e - | 0.02 | 72580年 | gtex_brain_ba24 |
rs2650906 | 16 | 77396454 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.033 e - | 0.02 | 72557年 | gtex_brain_ba24 |
rs4888622 | 16 | 77396849 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.051 e - | 0.02 | 72162年 | gtex_brain_ba24 |
rs2650908 | 16 | 77396961 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 3.444 e - | 0.02 | 72050年 | gtex_brain_ba24 |
rs2246607 | 16 | 77397167 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 6.586 e - | 0.02 | 71844年 | gtex_brain_ba24 |
rs2562117 | 16 | 77397273 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.052 e - | 0.02 | 71738年 | gtex_brain_ba24 |
rs2562118 | 16 | 77397321 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.052 e - | 0.02 | 71690年 | gtex_brain_ba24 |
rs1318021 | 16 | 77389088 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 4.035 e-16 | 0 | 79923年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs866924 | 16 | 77389312 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 4.237 e-16 | 0 | 79699年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs8058333 | 16 | 77389762 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 1.736 e - | 0 | 79249年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs10514415 | 16 | 77390128 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.83 e-17 | 0 | 78883年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs10514416 | 16 | 77390450 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.106 e-6 | 0 | 78561年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs60742096 | 16 | 77390525 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.106 e-6 | 0 | 78486年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2434898 | 16 | 77390751 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.106 e-6 | 0 | 78260年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1392607 | 16 | 77390996 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 78015年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1392608 | 16 | 77391077 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 77934年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1392609 | 16 | 77391114 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 77897年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2562112 | 16 | 77391272 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 77739年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1500483 | 16 | 77391376 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 1.239 e-6 | 0 | 77635年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2562111 | 16 | 77392052 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.105 e-6 | 0 | 76959年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2650890 | 16 | 77392060 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.105 e-6 | 0 | 76951年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs891133 | 16 | 77392867 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 76144年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs891134 | 16 | 77393072 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.371 e-17 | 0 | 75939年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2650907 | 16 | 77393207 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 75804年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs201159366 | 16 | 77393808 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 3.232 e-12 | 0 | 75203年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs891135 | 16 | 77393810 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 7.513 e-11 | 0 | 75201年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs891136 | 16 | 77393811 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.925 e-14 | 0 | 75200年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2562114 | 16 | 77394134 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 74877年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs57517352 | 16 | 77394478 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 9.035 e-17 | 0 | 74533年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2562115 | 16 | 77394592 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 74419年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2650903 | 16 | 77394939 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.111 e-6 | 0 | 74072年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs937584 | 16 | 77395205 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 73806年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs937585 | 16 | 77395259 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 73752年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1909802 | 16 | 77395948 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 73063年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2650904 | 16 | 77396307 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.105 e-6 | 0 | 72704年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2650905 | 16 | 77396431 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.852 e-17 | 0 | 72580年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2650906 | 16 | 77396454 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.852 e-17 | 0 | 72557年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs57471097 | 16 | 77396578 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 1.856 e-16 | 0 | 72433年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs4888621 | 16 | 77396712 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.105 e-6 | 0 | 72299年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs4888622 | 16 | 77396849 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 72162年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2650908 | 16 | 77396961 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 72050年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2246607 | 16 | 77397167 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.005 e-16 | 0 | 71844年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2562117 | 16 | 77397273 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 71738年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2562118 | 16 | 77397321 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 5.854 e-17 | 0 | 71690年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1948718 | 16 | 77397899 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.105 e-6 | 0 | 71112年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs8044321 | 16 | 77414815 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.822 e - | 0 | 54196年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs8058955 | 16 | 77414960 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 7.3 e-8 | 0 | 54051年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs8050785 | 16 | 77416119 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 3.305 e - | 0 | 52892年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13338248 | 16 | 77416830 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.668 e - | 0 | 52181年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13338254 | 16 | 77416858 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 7.424 e-8 | 0 | 52153年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs16945565 | 16 | 77417029 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.453 e - | 0 | 51982年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13332200 | 16 | 77417039 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.638 e - | 0 | 51972年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2454939 | 16 | 77417054 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 9.924 e-13 | 0 | 51957年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs6564442 | 16 | 77417735 | ADAMTS18 | ENSG00000140873.11 | 2.254 e-6 | 0 | 51276年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ADAMTS18_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
HORIUCHI WTAP目标了 | 306年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日MYC放大目标DN | 97年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MCGARVEY甲基化沉默的结肠癌 | 42 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4同种型 | 182年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA ECM监管机构 | 238年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME相关 | 753年 | 411年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME | 1028年 | 559年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |