概括
基因 1727年
象征 CYB5R3
同义词 B5R | DIA1
描述 细胞色素B5还原酶3
参考 MIM:613213|HGNC:HGNC:2873|Ensembl:ENSG00000100243|HPRD:08942|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.2
Pascal P值 0.557
胎儿β 0.216
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10250355 22 43045158 CYB5R3 6.56E-9 -0.007 3.39e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16936324 Chr10 36060904 CYB5R3 1727年 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TACC1 0.91 0.85
FAM73A 0.89 0.88
DPP8 0.89 0.83
LRRK2 0.88 0.83
MBNL2 0.88 0.87
ARAP2 0.88 0.81
ENPP4 0.88 0.85
Rapgef5 0.88 0.80
GCC2 0.88 0.86
SLC4A10 0.88 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.58 -0.69
透明2 -0.49 -0.51
AC006276.2 -0.49 -0.49
TBC1D10A -0.48 -0.44
RPLP1 -0.47 -0.53
RPL36 -0.47 -0.55
SH2B2 -0.46 -0.48
sigirr -0.46 -0.52
NME4 -0.46 -0.57
RPL35 -0.46 -0.53

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氨基糖和核苷酸糖代谢 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维生素和辅因子的反应组代谢 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威廉姆斯ESR2瞄准 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN APC目标 77 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kayo卡路里限制肌肉 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质癌与腺瘤DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利伪虫 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足趋化趋化性 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Guillaumond KLF10靶向DN 30 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因