概括
GeneID 1739年
Symbol DLG1
同义词 DLGH1 | SAP-97 | SAP97 | DJ1061C18.1.1 | HDLG
描述 圆盘大同源物1,涂鸦细胞极性复合物分量
参考 MIM:601014|HGNC:HGNC:2900|Ensembl:ENSG00000075711|HPRD:03007|Vega:OTTHUMG00000047972
基因类型 蛋白质编码
Map location 3Q29
Pascal p-value 0.017
胎儿β -1.399
主持人 Cerebellar Hemisphere
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
Support 蛋白质聚类
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2Cdb.human_PocklingtonH1
G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核
G2Cdb.humanNRC
COMPOSITESET
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set 描述 信息
CNV:YES Copy number variation studies 手动策划
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DNM:Fromer_2014 Whole Exome Sequencing analysis 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
GO_Annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1
Network 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:1.2622

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

Gene 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA change Mutation type Sift CG46 特征 学习
DLG1 CHR3 196863463 C t NM_001098424
NM_001204386
NM_001204387
NM_001204388
NM_004087
p.357G>S
p.324G>S
p.241g> s
p.241g> s
p.357G>S
错过
错过
错过
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@eQTL annotation

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID pvalue QVALUE TSS距离 eQTL type
RS17015843 CHR2 79141922 DLG1 1739年 0.01 反式
RS17015845 CHR2 79142386 DLG1 1739年 0 反式
RS17015849 CHR2 79142711 DLG1 1739年 0 反式
RS17015851 CHR2 79143328 DLG1 1739年 0 反式
RS17015854 CHR2 79143361 DLG1 1739年 0 反式
rs17015885 CHR2 79151081 DLG1 1739年 0.08 反式
RS10219790 chr13 55281771 DLG1 1739年 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0004721 磷酸蛋白磷酸酶活性 塔斯 15302935
去:0004385 鸟苷酸激酶活性 塔斯 7937897
GO:0019902 phosphatase binding IPI 10646847
去:0008092 cytoskeletal protein binding 塔斯 8825652
GO:0008022 protein C-terminus binding IPI 11274188
GO:0015459 potassium channel regulator activity nas 10779557
GO:0019901 蛋白激酶结合 IPI 9341123|10779557|14699157
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0001935 内皮细胞增殖 IDA 14699157
GO:0007163 细胞极性的建立或维护 塔斯 12766944
GO:0007015 actin filament organization IDA 14699157
GO:0016337 cell-cell adhesion IDA 14699157
GO:0031575 G1/s过渡检查点 nas 10656683
GO:0030866 皮质肌动蛋白细胞骨架组织 IDA 14699157
去:0045930 有丝分裂细胞周期的负调控 小鬼 10656683
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045211 postsynaptic membrane IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 synapse IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
去:0005911 cell-cell junction 塔斯 7937897
去:0005886 plasma membrane 塔斯 10859302
GO:0016323 基底外侧质膜 IDA 8922391

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ACTN2 CMD1AA 肌动蛋白,alpha 2 - HPRD,Biogrid 12860415
ADAM17 CD156B |MGC71942 |tace |CSVP ADAM metallopeptidase domain 17 SAP97的PDZ结构域与TACE的C末端尾部相互作用。 绑定 12668732
ADAM17 CD156B |MGC71942 |tace |CSVP ADAM metallopeptidase domain 17 - HPRD,Biogrid 12668732
AKAP5 AKAP75 |AKAP79 |H21 A kinase (PRKA) anchor protein 5 - HPRD 10939335
APBA1 D9S411E |mint1 |x11 |x11a |x11alpha amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14960569
ATP2B2 PMCA2 |PMCA2A |PMCA2I ATPase,Ca ++运输,质膜2 PMCA2B与SAP97相互作用。 绑定 11274188
ATP2B2 PMCA2 |PMCA2A |PMCA2I ATPase,Ca ++运输,质膜2 - HPRD,Biogrid 11274188
ATP2B4 ATP2B2|DKFZp686G08106 | DKFZp686M088 | MXRA1 | PMCA4 | PMCA4b | PMCA4x ATPase,Ca ++运输,质膜4 重构的复合物 Biogrid 12511555
ATP2B4 ATP2B2|DKFZp686G08106 | DKFZp686M088 | MXRA1 | PMCA4 | PMCA4b | PMCA4x ATPase,Ca ++运输,质膜4 - HPRD 11274188
ATP2B4 ATP2B2|DKFZp686G08106 | DKFZp686M088 | MXRA1 | PMCA4 | PMCA4b | PMCA4x ATPase,Ca ++运输,质膜4 PMCA4b interacts with SAP97. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human PMCA4b and rat SAP97. 绑定 11274188
BEGAIN KIAA1446 富含脑添加的鸟苷酸激酶相关同源物(大鼠) - HPRD 9756850
BTRC beta-trcp |fbw1a |fbxw1 |fbxw1a |FWD1 |MGC4643 |BTRCP |BTRCP1 |betatrcp beta-transducin重复含有 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 12902344
CACNG2 MGC138502 | MGC138504 钙通道,电压依赖性,伽马亚基2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11140673
CAMK2A CAMKA |KIAA0968 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα - HPRD,Biogrid 12933808
CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase (MAGUK family) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
体外
in vivo
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 10993877|12151521
|12351654|14960569
CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase (MAGUK family) CASK与DLG1相互作用(SAP97)。 绑定 15729360
CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase (MAGUK family) - HPRD 10993877|12351654
CDH1 Arc-1 | CD324 | CDHE | ECAD | LCAM | UVO cadherin 1, type 1, E-cadherin (epithelial) - HPRD 9512503
CRIPT HSPC139 富含半胱氨酸的PDZ结合蛋白 - HPRD,Biogrid 12070168
CtNNA1 CAP102 |FLJ36832 catenin (cadherin-associated protein), alpha 1, 102kDa - HPRD,Biogrid 9512503
CtNNB1 CtNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA - HPRD 9512503
DLG2 DKFZP781D1854 |DKFZP781E0954 |FLJ37266 |MGC131811 |PSD-93 圆盘,大型同源物2,Chapsyn-1110(果蝇) - HPRD,Biogrid 12351654
DLG3 KIAA1232 |MRX |MRX90 |NE-DLG |nedlg |SAP102 圆盘,大型同源物3(果蝇神经内分泌-DLG,果蝇) - HPRD,Biogrid 12351654
DLG4 FLJ97752 | FLJ98574 | PSD95 | SAP90 圆盘,大型同源物4(果蝇) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9286858
DLGAP1 DAP-1 | DAP-1-ALPHA | DAP-1-BETA | GKAP | MGC88156 | SAPAP1 | hGKAP 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 - HPRD,Biogrid 9286858
DLGAP1 DAP-1 | DAP-1-ALPHA | DAP-1-BETA | GKAP | MGC88156 | SAPAP1 | hGKAP 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 HDLG与DAP-1Alpha相互作用。 绑定 9286858
DLGAP1 DAP-1 | DAP-1-ALPHA | DAP-1-BETA | GKAP | MGC88156 | SAPAP1 | hGKAP 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 DLGAP1(GKAP)与DLG1(SAP97)相互作用。 绑定 15729360
DLGAP1 DAP-1 | DAP-1-ALPHA | DAP-1-BETA | GKAP | MGC88156 | SAPAP1 | hGKAP 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 hDLG interacts with DAP-1beta. 绑定 9286858
DLGAP2 DAP2 | SAPAP2 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白2 HDLG与DAP-2相互作用。 绑定 9286858
DLGAP4 DAP4 |KIAA0964 |MGC131862 |RP5-977B1.6 |SAPAP4 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白4 - HPRD 9115257
EPB41 4.1r |El1 |他 红细胞膜蛋白条带4.1(椭圆细胞增多症1,rh-c-链接) - HPRD,Biogrid 7937897
ERBB4 他R4 | MGC138404 | p180erbB4 v-erb-a erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 4 (avian) - HPRD,Biogrid 12175853
EZR CVIL | CVL | DKFZp762H157 | FLJ26216 | MGC1584 | VIL2 埃兹林 - HPRD,Biogrid 11726633
GDA CYPIN | GUANASE | KIAA1258 | MGC9982 | NEDASIN 鸟嘌呤脱氨酶 - HPRD 10595517
GPR124 DKFZP434C211 |DKFZP434J0911 |FLJ14390 |KIAA1531 |tem5 G蛋白偶联受体124 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 15021905
GPR125 pgr21 |tem5l G蛋白偶联受体125 - HPRD 15021905
gria1 GLUH1 | GLUR1 | GLURA | HBGR1 | MGC133252 glutamate receptor, ionotropic, AMPA 1 - HPRD,Biogrid 9677374|11567040
GRIK2 EAA4 |Glr6 |Gluk6 |glur6 |MGC74427 |MRT6 glutamate receptor, ionotropic, kainate 2 - HPRD,Biogrid 11279111
grin2a nmdar2a |NR2A 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2A - HPRD,Biogrid 12933808
grin2b MGC142178 |MGC142180 |NMDAR2B |NR2B |HNR3 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2B 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11997254
gucy1a2 GC-SA2 |GUC1A2 可溶性鸟苷酸环化酶1日,α2 - HPRD,Biogrid 11572861
KCNA4 HBK4 |HK1 |HPCN2 |Hukii |kcna4l |kcna8 |KV1.4 |PCN2 potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 4 - HPRD,Biogrid 12860415
KCNA5 ATFB7 |HCK1 |HK2 |HPCN1 |KV1.5 |MGC117058 |MGC117059 |PCN1 potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 5 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12970345
KCNAB1 AKR6A3 | KCNA1B | KV-BETA-1 | Kvb1.3 | hKvBeta3 | hKvb3 potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 1 - HPRD,Biogrid 9341123
KCNJ10 Birk-10 |kcnj13-pen |Kir1.2 |Kir4.1 potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 - HPRD 9148889
KCNJ12 FLJ14167 |irk2 |kcnjn1 |Kir2.2 |Kir2.2V |Hirk |hirk1 |HKIR2.2X |kcnj12x potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12 - HPRD,Biogrid 5024025|11181181
|14960569
KCNJ2 hhbirk1 |hhirk1 |irk1 |Kir2.1 |LQT7 |SQT3 potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2 - HPRD,Biogrid 11181181
KCNJ4 HIR | HIRK2 | HRK1 | IRK3 | Kir2.3 | MGC142066 | MGC142068 potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 11181181|14960569
|15024025
KCNJ6 Bir1 |girk2 |katp2 |kcnj7 |Kir3.2 |MGC126596 |higirk2 potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 6 重构的复合物 Biogrid 10619846
KIF13B 加金|KIAA0639 kinesin family member 13B - HPRD,Biogrid 10859302
KIF1B CMT2 | CMT2A | CMT2A1 | FLJ23699 | HMSNII | KIAA0591 | KIAA1448 | KLP | MGC134844 kinesin family member 1B - HPRD 12097473
LCK YT16 | p56lck | pp58lck lymphocyte-specific protein tyrosine kinase - HPRD,Biogrid 9341123
lin7a lin-7a |lin7 |mals-1 |MGC148143 |提示-33 |veli1 lin-7 homolog A (C. elegans) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14960569
lin7c FLJ11215 | LIN-7-C | LIN-7C | MALS-3 | MALS3 | VELI3 LIN-7同源物C(秀丽隐杆线虫) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14960569
LRP2 DBS |GP330 low density lipoprotein-related protein 2 - HPRD 12713445
LRRC1 FLJ10775 |FLJ11834 |拉诺|DJ523E19.1 亮氨酸富含1 两个杂交 Biogrid 11440998
MAP1A FLJ77111 | MAP1L | MTAP1A 微管相关蛋白1a - HPRD 9786987
MRPS34 MGC2616 |MRP-S12 |MRP-S34 |MRPS12 mitochondrial ribosomal protein S34 DLG1(HDLG)与MRPS34(MRP-S34)相互作用。 绑定 12507520
myo6 DFNA22 | DFNB37 | KIAA0389 肌球蛋白VI - HPRD 12050163
PBK FLJ14385 |Nori-3 |spk |TOPK PDZ结合激酶 PBKinteracts with DLG1 (SAP97). This interaction was modelled on a demonstrated interaction between PBK from an unspecified species and human DLG1 (SAP97). 绑定 15729360
PBK FLJ14385 |Nori-3 |spk |TOPK PDZ结合激酶 - HPRD 10779557
SEMA4C FLJ20369 | KIAA1739 | M-SEMA-F | MGC126382 | MGC126383 | SEMACL1 | SEMAF | SEMAI SEMA结构域,免疫球蛋白结构域(IG),跨膜结构域(TM)和短细胞质结构域,(Semaphorin)4C - HPRD 11134026
tanc1 KIAA1728 | ROLSB | TANC 四肽重复,arnkyrin重复和包含1 - HPRD 15673434
TJAP1 DKFZp686F06131 | PILT | TJP4 tight junction associated protein 1 (peripheral) - HPRD,Biogrid 11602598


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG T CELL RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42途径 70 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ECADHERIN NASCENT AJ PATHWAY 39 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMISSION ACROSS CHEMICAL SYNAPSES 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEURONAL SYSTEM 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRAFFICKING OF AMPA RECEPTORS 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
谷氨酸结合上海藻酸盐受体的反应组激活 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海藻酸盐受体的反应组离子型活性 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME L1CAM INTERACTIONS 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU CMYB TARGETS UP 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DITTMER PTHLH TARGETS UP 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHOW RASSF1 TARGETS UP 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 8HR UP 105 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APRELIKOVA BRCA1 TARGETS 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的新皮层 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 12HR UP 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE BY GAMMA AND UV RADIATION 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bohn原发性免疫缺陷综合症 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GABRIELY MIR21 TARGETS 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因