基因页面:DLG2

总结吗?
GeneID 1740年
象征 DLG2
同义词 PPP1R58 | psd - 93 | PSD93 | chapsyn - 110
描述 光盘大同族体2
参考 MIM: 603583|HGNC: HGNC: 2901|运用:ENSG00000150672|HPRD: 04663|HPRD: 08220|织女:OTTHUMG00000134309
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 11 q14.1
这样假定值 0.002
胎儿β -0.096
DMG 1(#研究)
支持 蛋白质聚类
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_clathrin
G2Cdb.human_PocklingtonH1
G2Cdb.human_Synaptosome
g2cdb.human_tap psd - 95核心
G2Cdb.humanNRC
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP
CompositeSet
达内尔FMRP目标
潜在的突触基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 2
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.2135

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
DLG2 chr11 83194295 C T NM_001142699
NM_001142700
NM_001142700
NM_001142702
NM_001142702
NM_001206769
NM_001364		 。
。
。
。
。
。
。		 intronic
intronic
splice-donor-in2
intronic
splice-donor-in2
intronic
intronic		 精神分裂症 认为:Fromer_2014

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg16986720 11 84634735 DLG2 3.415的军医 0.434 0.041 DMG: Wockner_2014
cg10901805 11 84634620 DLG2 4.157的军医 0.675 0.044 DMG: Wockner_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 15304517|16192269
去:0004385 鸟苷激酶活性 助教 8755482
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0045211 突触后膜 国际能源机构 Synap,神经递质(术语层面:5) - - - - - -
去:0045202 突触 国际能源机构 Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 助教 8755482
去:0030054 细胞结 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
ATP2B2 PMCA2 | PMCA2a | PMCA2i atp酶、钙+ +运输、质膜2 PMCA2b与SAP93交互。这种交互是仿照人类PMCA2b证明之间的交互和SAP93鼠和一个未指明的来源。 绑定 11274188
ATP2B2 PMCA2 | PMCA2a | PMCA2i atp酶、钙+ +运输、质膜2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11274188
ATP2B4 ATP2B2 | DKFZp686G08106 | DKFZp686M088 | MXRA1 | PMCA4 | PMCA4b | PMCA4x atp酶、钙+ +运输、质膜4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11274188
ATP2B4 ATP2B2 | DKFZp686G08106 | DKFZp686M088 | MXRA1 | PMCA4 | PMCA4b | PMCA4x atp酶、钙+ +运输、质膜4 PMCA4b与SAP93交互。这种交互是仿照人类PMCA4b证明之间的交互和SAP93鼠和一个未指明的来源。 绑定 11274188
图书馆的 HSPC139 cysteine-rich PDZ-binding蛋白质 - - - - - - HPRD 9581762|12070168
DLG1 DKFZp761P0818 | DKFZp781B0426 | DLGH1 | SAP97 | dJ1061C18.1.1 |处理 光盘、大型同族体1(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 12351654
DLG4 FLJ97752 | FLJ98574 | PSD95 | SAP90 光盘、大型同族体4(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 9182804
DLGAP1 DAP-1 | DAP-1-ALPHA | DAP-1-BETA | GKAP | MGC88156 | SAPAP1 | hGKAP 光盘、大型(果蝇)homolog-associated蛋白质1 DAP-1与chapsyn - 110。 绑定 11122378
DLGAP1 DAP-1 | DAP-1-ALPHA | DAP-1-BETA | GKAP | MGC88156 | SAPAP1 | hGKAP 光盘、大型(果蝇)homolog-associated蛋白质1 亲和力Capture-Western BioGRID 10844022
DYNLL1 DLC1 | DLC8 | DNCL1 | DNCLC1 | LC8 | LC8a | MGC126137 | MGC126138 |销| hdlc1 动力蛋白轻链,LC8-type 1 亲和力Capture-Western BioGRID 10844022
DYNLL2 DNCL1B | Dlc2 | MGC17810 动力蛋白轻链,LC8-type 2 亲和力Capture-Western BioGRID 10844022
ERBB4 HER4 | MGC138404 | p180erbB4 v-erb-a erythroblastic白血病病毒致癌基因同族体4(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 10725395
ERBB4 HER4 | MGC138404 | p180erbB4 v-erb-a erythroblastic白血病病毒致癌基因同族体4(禽流感) ErbB-4与chapsyn - 110。 绑定 10725395
GRIN1 NMDA1 | NMDAR1 | NR1 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 1 - - - - - - HPRD 10862698
GRIN2A NMDAR2A | NR2A 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 2 a - - - - - - HPRD 10648730
GRIN2A NMDAR2A | NR2A 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 2 a 2台混合动力 BioGRID 9278515
GRIN2B MGC142178 | MGC142180 | NMDAR2B | NR2B | hNR3 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 2 b 亲和力Capture-Western
2台混合动力		 BioGRID 9278515|11997254
GRIN2B MGC142178 | MGC142180 | NMDAR2B | NR2B | hNR3 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 2 b - - - - - - HPRD 9806853|11997254
GUCY1A2 GC-SA2 | GUC1A2 可溶性鸟苷酸环化酶1日,α2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11572861
KCNA4 HBK4 | HK1 | HPCN2 | HUKII | KCNA4L | KCNA8 | KV1.4 | PCN2 电压门控钾通道,shaker-related亚科,4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11997254
KCNJ12 FLJ14167 | IRK2 | KCNJN1 | Kir2.2 | Kir2.2v | hIRK | hIRK1 | hkir2.2x | kcnj12x 整流钾通道,亚J, 12个成员 - - - - - - HPRD, BioGRID 15024025
KCNJ4 HIR | HIRK2 | HRK1 | IRK3 | Kir2.3 | MGC142066 | MGC142068 整流钾通道,4亚科J,成员 亲和力Capture-Western BioGRID 11997254
LIN7A LIN-7A | LIN7 | MALS-1 | MGC148143 | TIP-33 | VELI1 lin-7同族体(秀丽隐杆线虫) - - - - - - HPRD, BioGRID 9753324
LRP2 DBS | gp330 低密度lipoprotein-related蛋白2 - - - - - - HPRD, BioGRID 12713445
MAP1A FLJ77111 | MAP1L | MTAP1A microtubule-associated蛋白1 - - - - - - HPRD 9786987
NLGN1 KIAA1070 | MGC45115 neuroligin 1 2台混合动力 BioGRID 9278515
NLGN2 KIAA1366 neuroligin 2 2台混合动力 BioGRID 9278515
NLGN3 ASPGX1 | AUTSX1 | HNL3 | KIAA1480 neuroligin 3 - - - - - - HPRD, BioGRID 9278515
NOS1 IHPS1 |号| nNOS 一氧化氮合酶1(神经元) - - - - - - HPRD, BioGRID 8625413
SEMA4C FLJ20369 | KIAA1739 | M-SEMA-F | MGC126382 | MGC126383 | SEMACL1 | SEMAF | SEMAI 某领域,免疫球蛋白域(Ig),跨膜域(TM)和胞质域,(semaphorin) 4 c 2台混合动力 BioGRID 11134026


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
DELYS甲状腺癌DN 232年 154年 所有SZGR 2.0基因通路
SILIGAN EWS FLI1融合DN的目标 18 9 所有SZGR 2.0基因通路
帕蒂尔肝癌 747年 453年 所有SZGR 2.0基因通路
斯塔克HYPPOCAMPUS 22 q11删除 53 40 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
SAFFORD T淋巴细胞无力 87年 54 所有SZGR 2.0基因通路
里奇尤因肉瘤祖 430年 288年 所有SZGR 2.0基因通路
FIRESTEIN扩散 175年 125年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
TAVAZOIE转移 108年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和发票16易位 422年 277年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MEF和H3K27ME3 ICP 206年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 1839年 928年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-1/206 4600年 4606年 1 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
mir - 122 4567年 4573年 m8 hsa - mir - 122 a UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU
mir - 128 1712年 1718年 m8 hsa - mir - 128 a UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
hsa - mir - 128 b UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir - 133 1456年 1462年 1 hsa - mir - 133 a UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU
hsa - mir - 133 b UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA
mir - 134 1877年 1883年 m8 hsa - mir - 134大脑 UGUGACUGGUUGACCAGAGGG
mir - 135 3716年 3722年 m8 hsa - mir - 135 a UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA
hsa - mir - 135 b UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
hsa - mir - 135 a UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA
hsa - mir - 135 b UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
mir - 138 1725年 1731年 1 hsa - mir - 138大脑 AGCUGGUGUUGUGAAUC
mir - 142 - 5 - p 4794年 4800年 m8 hsa - mir - 142 - 5 - p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
miR-148/152 2362年 2369年 1、m8 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir - 153 433年 439年 m8 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir - 181 127年 133年 1 hsa - mir - 181 a大脑 AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 b深圳 AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa - mir - 181 c大脑 AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 d大脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
mir - 182 1939年 1945年 m8 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir - 185 2661年 2668年 1、m8 hsa - mir - 185大脑 UGGAGAGAAAGGCAGUUC
mir - 205 155年 162年 1、m8 hsa - mir - 205 UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG
mir - 218 4622年 4628年 m8 hsa - mir - 218大脑 UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
miR-221/222 2776年 2782年 1 hsa - mir - 221大脑 AGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC
hsa - mir - 222大脑 AGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUC
miR-23 112年 119年 1、m8 hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-29 2630年 2637年 1、m8 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
miR-30-3p 4177年 4183年 m8 hsa-miR-30a-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
miR-30-5p 4543年 4549年 1 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir - 320 634年 640年 1 hsa - mir - 320 AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA
mir - 323 112年 118年 1 hsa - mir - 323大脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir - 338 2708年 2714年 m8 hsa - mir - 338大脑 UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA
miR-34b 3883年 3889年 1 hsa-miR-34b UAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUG
mir - 363 2599年 2605年 1 hsa - mir - 363 AUUGCACGGUAUCCAUCUGUAA
mir - 374 4633年 4639年 1 hsa - mir - 374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
mir - 375 44 50 1 hsa - mir - 375 UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA
mir - 378 * 3400年 3406年 m8 hsa - mir - 422 b CUGGACUUGGAGUCAGAAGGCC
hsa - mir - 422 a CUGGACUUAGGGUCAGAAGGCC
mir - 380 - 5 - p 1420年 1426年 1 hsa - mir - 380 - 5 - p UGGUUGACCAUAGAACAUGCGC
hsa - mir - 563 AGGUUGACAUACGUUUCCC
mir - 410 2385年 2391年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir - 452 2642年 2648年 m8 hsa - mir - 452 UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC
mir - 493 - 5 - p 129年 136年 1、m8 hsa - mir - 493 - 5 - p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
mir - 500 2598年 2604年 1 hsa - mir - 500 AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG