基因页:DLG4
概括?
基因 | 1742年 |
象征 | DLG4 |
同义词 | PSD95 | SAP-90 | SAP90 |
描述 | 光盘大型同源物4 |
参考 | MIM:602887|HGNC:HGNC:2903|ENSEMBL:ENSG00000132535|HPRD:04199|Vega:Otthumg00000134327 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.1 |
Pascal P值 | 1.301E-4 |
胎儿β | -0.465 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
支持 | 蛋白质聚类 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN g2cdb.human_pocklingtonh1 g2cdb.human_synaptosom G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 G2CDB.HUMANNRC g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:7 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:7.5711 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04106389 | 17 | 7117241 | DLG4 | 2.334E-4 | 0.308 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DLG4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0008022 | 蛋白C末端结合 | IPI | 7477295 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016188 | 突触囊泡成熟 | IEA | 突触(GO期限:8) | - |
去:0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) | 9853749 |
GO:0048169 | 调节长期神经元突触可塑性 | IEA | 神经元,突触(GO期限:10) | - |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 9286702 |
去:0006461 | 蛋白质复合物组件 | 塔斯 | 7477295 | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 10364559 | |
去:0007612 | 学习 | 塔斯 | 9853749 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0014069 | 突触后密度 | IEA | 突触(GO期限:10) | - |
GO:0019717 | 突触体 | IEA | 突触,大脑(GO期限:7) | - |
GO:0045211 | 突触后膜 | 艾达 | 突触,神经递质(GO期限:5) | 12151521 |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - | |
GO:0031234 | 质膜内外侧的外侧 | IEA | - | |
去:0030863 | 皮质细胞骨架 | 艾达 | 12151521 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACCN3 | asic3 |Drasic |slnac1 |TNAC1 | Amiloride敏感阳离子通道3 | ASIC3与DLG4相互作用(PSD-95)。这种相互作用是在小鼠或大鼠ASIC3和大鼠DLG4(PSD-95)之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15317815 |
ACCN3 | asic3 |Drasic |slnac1 |TNAC1 | Amiloride敏感阳离子通道3 | - | HPRD,Biogrid | 15317815 |
ACTN2 | CMD1AA | 肌动蛋白,alpha 2 | - | HPRD,Biogrid | 12435606 |
ADAM22 | mdc2 |MGC149832 | 亚当金属肽酶结构域22 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 16990550 |
ADRB1 | ADRB1R |b1ar |beta1ar |Rhr | 肾上腺素能,β-1-受体 | - | HPRD,Biogrid | 10995758 |
AKAP5 | AKAP75 |AKAP79 |H21 | 激酶(PRKA)锚蛋白5 | - | HPRD | 10939335 |
ATP2B2 | PMCA2 |PMCA2A |PMCA2I | ATPase,Ca ++运输,质膜2 | - | HPRD | 11274188 |
ATP2B2 | PMCA2 |PMCA2A |PMCA2I | ATPase,Ca ++运输,质膜2 | PMCA2B与SAP90相互作用。这种相互作用是在人类PMCA2B和大鼠SAP90之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 11274188 |
ATP2B4 | ATP2B2 |DKFZP686G08106 |DKFZP686M088 |mxra1 |PMCA4 |PMCA4B |PMCA4X | ATPase,Ca ++运输,质膜4 | PMCA4B与PSD-95相互作用。 | 绑定 | 9430700 |
ATP2B4 | ATP2B2 |DKFZP686G08106 |DKFZP686M088 |mxra1 |PMCA4 |PMCA4B |PMCA4X | ATPase,Ca ++运输,质膜4 | - | HPRD | 11274188 |
bai1 | FLJ41988 | 脑特异性血管生成抑制剂1 | - | HPRD,Biogrid | 11937501 |
开始 | KIAA1446 | 富含脑添加的鸟苷酸激酶相关同源物(大鼠) | - | HPRD | 9756850 |
cacng2 | MGC138502 |MGC138504 | 钙通道,电压依赖性,伽马亚基2 | - | HPRD,Biogrid | 11805122 |
桶 | CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 | 钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶(Maguk家族) | - | HPRD,Biogrid | 12151521 |
CD46 | MCP |MGC26544 |MIC10 |TLX |Tra2.10 | CD46分子,补体调节蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 11714708 |
引用 | 克里克|KIAA0949 |STK21 | Citron(Rho Interacting,丝氨酸/苏氨酸激酶21) | 体内 两个杂交 |
Biogrid | 9870942 |
丝 | HSPC139 | 富含半胱氨酸的PDZ结合蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 9581762 |
DAP | MGC99796 | 与死亡相关的蛋白质 | - | HPRD | 9286858 |
DLG1 | DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG | 圆盘,大型同源物1(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9286858 |
DLG2 | DKFZP781D1854 |DKFZP781E0954 |FLJ37266 |MGC131811 |PSD-93 | 圆盘,大型同源物2,Chapsyn-1110(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 9182804 |
DLG3 | KIAA1232 |MRX |MRX90 |NE-DLG |nedlg |SAP102 | 圆盘,大型同源物3(果蝇神经内分泌-DLG,果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 10026200 |
DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘,大型同源物4(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9182804 |
DLGAP1 | DAP-1 |DAP-1-Alpha |DAP-1-beta |gkap |MGC88156 |SAPAP1 |HGKAP | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共同分级 远西方 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9024696|9115257 |9286858|10527873 |10844022|11060025 |
DLGAP1 | DAP-1 |DAP-1-Alpha |DAP-1-beta |gkap |MGC88156 |SAPAP1 |HGKAP | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 | - | HPRD | 9024696|9286858 |
DLGAP1 | DAP-1 |DAP-1-Alpha |DAP-1-beta |gkap |MGC88156 |SAPAP1 |HGKAP | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 | PSD-95与DAP-1Alpha相互作用。 | 绑定 | 9286858 |
DLGAP2 | DAP2 |SAPAP2 | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白2 | - | HPRD | 9286858 |
DLGAP2 | DAP2 |SAPAP2 | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白2 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9115257 |
DLGAP3 | DAP3 |SAPAP3 | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白3 | 两个杂交 | Biogrid | 9115257 |
DLGAP4 | DAP4 |KIAA0964 |MGC131862 |RP5-977B1.6 |SAPAP4 | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白4 | 两个杂交 | Biogrid | 9115257 |
dynll1 | DLC1 |DLC8 |DNCL1 |DNClc1 |LC8 |LC8A |MGC126137 |MGC126138 |PIN |HDLC1 | Dynein,轻链,LC8型1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 10844022 |
dynll1 | DLC1 |DLC8 |DNCL1 |DNClc1 |LC8 |LC8A |MGC126137 |MGC126138 |PIN |HDLC1 | Dynein,轻链,LC8型1 | - | HPRD | 14760703 |
dynll2 | dncl1b |DLC2 |MGC17810 | Dynein,轻链,LC8型2 | - | HPRD,Biogrid | 10844022 |
ERBB2 | CD340 |her-2 |her-2/neu |her2 |neu |ngl |TKR1 | V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2,神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 10839362 |
erbb2ip | Erbin |LAP2 | ERBB2相互作用蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 11279080 |
ERBB4 | her4 |MGC138404 |P180ERBB4 | V-ERB-A红细胞白血病病毒癌基因同源物4(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 10725395 |
ERBB4 | her4 |MGC138404 |P180ERBB4 | V-ERB-A红细胞白血病病毒癌基因同源物4(Avian) | ERBB-4与PSD-95相互作用。 | 绑定 | 10725395 |
exoc4 | MGC27170 |rec8 |sec8 |sec8l1 |Sec8p | 外囊复合体组件4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12675619|12738960 |
Fyn | MGC45350 |SLK |syn | Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 | - | HPRD,Biogrid | 12419528 |
FZD1 | DKFZP564G072 | 卷曲的同源物1(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 12067714 |
FZD2 | - | 卷曲的同源物2(果蝇) | 两个杂交 | Biogrid | 12067714 |
FZD4 | CD344 |evr1 |FEVR |fzd4s |FZ-4 |fze4 |GPCR |MGC34390 | 卷曲的同源物4(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 12067714 |
FZD7 | FZE3 | 卷曲的同源物7(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 12067714 |
GDA | cypin |鸟解|KIAA1258 |MGC9982 |内丹辛 | 鸟嘌呤脱氨酶 | - | HPRD | 10595517 |
gria2 | glur2 |Glurb |glur-k2 |HBGR2 | 谷氨酸受体,离子型,AMPA 2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16990550 |
gria3 | glur-c |glur-k3 |glur3 |glurc |MRX94 | 谷氨酸受体,离子营养,AMPA 3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16990550 |
grik1 | EAA3 |EEA3 |Glr5 |Glur5 | 谷氨酸受体,离子型,海藻酸盐1 | - | HPRD,Biogrid | 12597860 |
Grik2 | EAA4 |Glr6 |Gluk6 |glur6 |MGC74427 |MRT6 | 谷氨酸受体,离子型,海藻酸盐2 | - | HPRD | 9808460|11276111 |12597860 |
Grik2 | EAA4 |Glr6 |Gluk6 |glur6 |MGC74427 |MRT6 | 谷氨酸受体,离子型,海藻酸盐2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9808460|11279111 |12597860 |
Grik5 | EAA2 |grik2 |KA2 | 谷氨酸受体,离子型,海藻酸盐5 | - | HPRD,Biogrid | 9808460|11279111 |
grin1 | NMDA1 |NMDAR1 |NR1 | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸1 | - | HPRD | 9009191|9502803 |11506858|12068077 |14732708|15030493 |
grin2a | nmdar2a |NR2A | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2A | - | HPRD | 7569905|11937501 |12419528 |
grin2a | nmdar2a |NR2A | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2A | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体外 体内 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 7569905|9278515 |9286858|10648730 |11937501|12419528 |
grin2b | MGC142178 |MGC142180 |NMDAR2B |NR2B |HNR3 | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2B | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体外 体内 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 7569905|9278515 |9581762|11937501 |11997254|12738960 |
grin2b | MGC142178 |MGC142180 |NMDAR2B |NR2B |HNR3 | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2B | - | HPRD | 7569905|9581762 | 11937501 |
grin2c | NMDAR2C |NR2C | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2C | - | HPRD,Biogrid | 7569905|11937501 |
Grin2d | EB11 |NMDAR2D | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基D-天冬氨酸2D | - | HPRD,Biogrid | 7569905 |
格林3A | FLJ45414 |nmdar-l |NR3A | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基-D-天冬氨酸3A | 体外 体内 两个杂交 |
Biogrid | 7569905 |
grin3b | NR3B | 谷氨酸受体,离子型,N-甲基-D-天冬氨酸3B | 体外 体内 两个杂交 |
Biogrid | 7569905 |
gucy1a2 | GC-SA2 |GUC1A2 | 鸟苷酸环化酶1,可溶性,α2 | - | HPRD,Biogrid | 11572861 |
HGS | HRS |ZFYVE8 | 肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物 | - | HPRD,Biogrid | 12151521 |
htr2a | 5-HT2A |Htr2 | 5-羟色胺(5-羟色胺)受体2A | - | HPRD,Biogrid | 12682061 |
htr2c | 5-HT2C |5-HTR2C |htr1c | 5-羟色胺(5-羟色胺)受体2C | - | HPRD,Biogrid | 12006486 |
htt | 高清|IT15 | 亨廷顿 | Huntingtin与PSD-95相互作用。 | 绑定 | 11319238 |
IL13RA1 | CD213A1 |IL-13RA |NR4 | 白介素13受体,α1 | 体外 体内 两个杂交 |
Biogrid | 7569905 |
KCNA1 | aemk |EA1 |HBK1 |huk1 |KV1.1 |MBK1 |MGC126782 |MGC138385 |Mk1 |RBK1 | 钾电压门控通道,与振动器相关的亚家族,成员1(肌动物的情节性共济失调) | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12435606 |
KCNA2 | HBK5 |HK4 |Hukiv |KV1.2 |MGC50217 |Mk2 |ngk1 |RBK2 | 钾电压门控通道,与振动振动器相关的亚家族,成员2 | - | HPRD,Biogrid | 8938729|12435606 |
KCNA4 | HBK4 |HK1 |HPCN2 |Hukii |kcna4l |kcna8 |KV1.4 |PCN2 | 钾电压门控通道,与振动振动器相关的亚科,成员4 | - | HPRD | 8938729|9581762 |12435606 |
KCNA4 | HBK4 |HK1 |HPCN2 |Hukii |kcna4l |kcna8 |KV1.4 |PCN2 | 钾电压门控通道,与振动振动器相关的亚科,成员4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8938729|9581762 |11997254|12435606 |
KCNA5 | ATFB7 |HCK1 |HK2 |HPCN1 |KV1.5 |MGC117058 |MGC117059 |PCN1 | 钾电压门控通道,与振动筛相关的亚家族,成员5 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12435606|12860415 |
KCND2 | KIAA1044 |Kv4.2 |MGC119702 |MGC119703 |RK5 | 钾电压门控通道,与SHAL相关的亚科,成员2 | 两个杂交 | Biogrid | 12435606 |
KCNJ10 | Birk-10 |kcnj13-pen |Kir1.2 |Kir4.1 | 钾内切割通道,亚家族J,成员10 | - | HPRD | 9148889 |
KCNJ12 | FLJ14167 |irk2 |kcnjn1 |Kir2.2 |Kir2.2V |Hirk |hirk1 |HKIR2.2X |kcnj12x | 钾内切割通道,亚家族J,成员12 | - | HPRD,Biogrid | 15024025 |
KCNJ2 | hhbirk1 |hhirk1 |irk1 |Kir2.1 |LQT7 |SQT3 | 钾内切割通道,亚家族J,成员2 | - | HPRD,Biogrid | 10627592 |
KCNJ4 | hir |hirk2 |HRK1 |irk3 |Kir2.3 |MGC142066 |MGC142068 | 钾内切割通道,亚家族J,成员4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 10627592|11997254 |14960569 |
KIF13B | 加金|KIAA0639 | 动机家庭成员13B | - | HPRD,Biogrid | 10859302 |
kif1b | CMT2 |CMT2A |CMT2A1 |FLJ23699 |hmsnii |KIAA0591 |KIAA1448 |KLP |MGC134844 | 动机家庭成员1B | - | HPRD | 12097473 |
LGI1 | epitempin |EPT |ETL1 |IB1099 | 含亮氨酸,胶质瘤灭活1 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 16990550 |
lin7a | lin-7a |lin7 |mals-1 |MGC148143 |提示-33 |veli1 | LIN-7同源物A(秀丽隐杆线虫) | - | HPRD,Biogrid | 10341223 |
lin7b | lin-7b |mals-2 |mals2 |veli2 | LIN-7同源物B(秀丽隐杆线虫) | 体内 | Biogrid | 10341223 |
LRP1 | A2MR |apoer |APR |CD91 |FLJ16451 |IGFBP3R |LRP |MGC88725 |TGFBR5 | 低密度脂蛋白相关蛋白1(Alpha-2-巨球蛋白受体) | - | HPRD,Biogrid | 10827173 |
LRP2 | DBS |GP330 | 低密度脂蛋白相关蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 12713445 |
LRP8 | apoer2 |HSZ75190 |MCI1 | 低密度脂蛋白受体相关蛋白8,载脂蛋白E受体 | 两个杂交 | Biogrid | 10827173 |
LRRC1 | FLJ10775 |FLJ11834 |拉诺|DJ523E19.1 | 亮氨酸富含1 | - | HPRD,Biogrid | 11440998 |
LRRC7 | DKFZP686I1147 |KIAA1365 |MGC144918 | 含亮氨酸丰富的重复含有7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12390249 |
林恩 | FLJ26625 |JTK8 | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 | - | HPRD | 9892651 |
MAP1A | FLJ77111 |map1l |mtap1a | 微管相关蛋白1a | - | HPRD,Biogrid | 9786987|11925566 |
MAP3K10 | MLK2 |MST | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶10 | - | HPRD,Biogrid | 11152698 |
MAP3K11 | MGC17114 |MLK-3 |MLK3 |ptk1 |泉水 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶11 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11152698 |
ndor1 | MGC138148 |NR1 |BA350O14.9 | NADPH依赖性二线联氧化还原酶1 | - | HPRD,Biogrid | 7569905 |
NLGN1 | KIAA1070 |MGC45115 | 神经素1 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9278515 |
NLGN2 | KIAA1366 | 神经素2 | 两个杂交 | Biogrid | 9278515 |
NLGN3 | aspgx1 |autsx1 |HNL3 |KIAA1480 | 神经素3 | - | HPRD,Biogrid | 9278515 |
nlgn4x | aspgx2 |autsx2 |hlnx |hnlx |KIAA1260 |MGC22376 |nlgn |NLGN4 | 神经素4,X连接 | - | HPRD,Biogrid | 11368788 |
NOS1 | IHPS1 |nos |nnos | 一氧化氮合酶1(神经元) | - | HPRD,Biogrid | 8625413 |
NRG1 | 咏叹调|GGF |GGF2 |HGL |HRG |HRG1 |hrga |ndf |SMDF | 神经结合蛋白1 | NRG-1与PSD-95启动子相互作用。这种相互作用是基于未指定物种和人类PSD-95启动子的NRG-1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15494726 |
park2 | AR-JP |LPRS2 |PDJ |prkn | 帕金森病(常染色体隐性,少年)2,帕金 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11679592 |
prkca | AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca | 蛋白激酶C,α | - | HPRD,Biogrid | 11937501 |
ptk2b | Cadtk |cakb |fadk2 |fak2 |frnk |PKB |PTK |pyk2 |筏 | PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β | - | HPRD,Biogrid | 12576483 |
ptprg | HPTPG |PTPG |R-PTP-GAMMA |RPTPG | 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,G | - | HPRD,Biogrid | 10521598 |
RICS | GC-GAP |砂砾|KIAA0712 |MGC1892 |P200RHOGAP |P250GAP | Rho GTPase激活蛋白 | - | HPRD | 12531901 |
sema4c | FLJ20369 |KIAA1739 |M-Sema-f |MGC126382 |MGC126383 |semacl1 |Semaf |Semai | SEMA结构域,免疫球蛋白结构域(IG),跨膜结构域(TM)和短细胞质结构域,(Semaphorin)4C | - | HPRD,Biogrid | 11134026 |
sema4f | M-Sema |Pro2353 |Semam |Semaw |M-Sema-M | SEMA结构域,免疫球蛋白结构域(IG),跨膜结构域(TM)和短细胞质结构域,(Semaphorin)4F | - | HPRD,Biogrid | 11483650 |
Shank1 | SPANK-1 |SStrip |西南 | SH3和多个Ankyrin重复域1 | - | HPRD,Biogrid | 10433268 |
Shank2 | cortbp1 |cttnbp1 |Prosap1 |小腿|SPANK-3 | SH3和多个Ankyrin重复域2 | - | HPRD,Biogrid | 10527873 |
sipa1l1 | DKFZP686G1344 |E6TP1 |KIAA0440 | 信号诱导的增殖相关1像1 | - | HPRD,Biogrid | 11502259 |
syngap1 | DKFZP761G1421 |KIAA1938 |rasa1 |rasa5 |syngap | 突触Ras GTPase激活蛋白1同源物(大鼠) | 两个杂交 | Biogrid | 9581761 |
tanc1 | KIAA1728 |ROLSB |田 | 四肽重复,arnkyrin重复和包含1 | - | HPRD | 15673434 |
是的1 | HST441 |p61-yes |是|c-yes | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒癌基因同源1 | - | HPRD | 9892651 |
ZDHHC17 | HIP14 |hip3 |HSPC294 |Hyph |KIAA0946 | 锌指,含有17的DHHC型 | HIP14催化PSD-95的棕榈酰化。这种相互作用是基于未指定物种的人类HIP14和PSD-95之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15603740 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NOS1途径 | 24 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St GA12途径 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St GA13途径 | 37 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St Myocyte广告路径 | 27 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB4途径 | 38 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
瓦特自动甲状腺腺瘤 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江是衰老下丘脑DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
朗布浓缩学习环境迟到 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein位于远端和近端树突 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 | 152 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Abdelmohsen Elavl4目标 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 339 | 346 | 1A,M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-103/107 | 747 | 753 | M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-122 | 154 | 160 | M8 | HSA-MIR-122A | uggagugugacaaugguuuugu |
mir-149 | 728 | 734 | M8 | HSA-MIR-149脑 | Ucuggcuccucuucuucacuccc |