基因页面:DLX1

总结吗?
GeneID 1745年
象征 DLX1
同义词 - - - - - -
描述 distal-less同源框1
参考 MIM: 600029|HGNC: HGNC: 2914|运用:ENSG00000144355|HPRD: 08961|织女:OTTHUMG00000073951
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 2问
帕斯卡假定值 2.554 e-5
夏洛克假定值 0.613
胎儿β 0.729
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg13372879 2 172948073 DLX1 4.04平台以及 -0.012 7.69 e - DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs1387353 chr1 164414740 DLX1 1745年 0.07 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC44A2 0.70 0.71
KIAA1161 0.68 0.75
GPT2 0.68 0.74
LTBP3 0.66 0.66
PCDHGC3 0.65 0.71
PPAP2B 0.64 0.65
SOX21 0.64 0.65
PEX10 0.64 0.65
TTC38 0.64 0.68
PLXNB1 0.63 0.64
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL050337.1 -0.32 -0.29
AF347015.21 -0.30 -0.24
SYCP3 -0.30 -0.24
FAM159B -0.29 -0.30
NOX1 -0.28 -0.24
AC021914.1 -0.26 -0.14
ZBTB8OS -0.25 -0.23
SEC62 -0.25 -0.30
C17orf84 -0.25 -0.06
AC093616.2 -0.24 -0.21

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0003682 染色质绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0003700 转录因子的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0043565 sequence-specific DNA结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0043524 负调节神经元细胞凋亡 国际能源机构 神经元(术语层面:9) - - - - - -
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0007275 多细胞有机体的发展 NAS - - - - - -
去:0030154 细胞分化 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 核 国际能源机构 - - - - - -
去:0005634 核 NAS - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
PID SMAD2 3核通路 82年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
王LMO4目标了 372年 227年 所有SZGR 2.0基因通路
金赛的目标EWSR1 FLII融合DN 329年 219年 所有SZGR 2.0基因通路
COLDREN吉非替尼耐药了 85年 57 所有SZGR 2.0基因通路
MARKEY RB1急性LOF DN 228年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼头颈癌 One hundred. 63年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
谢泼德BMYB吗啉代DN 200年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
马森FOXP3如果绑定 1229年 713年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1目标了 673年 430年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯DN TP53的目标 593年 372年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53目标DN 591年 366年 所有SZGR 2.0基因通路
MASSARWEH他莫昔芬耐了 578年 341年 所有SZGR 2.0基因通路
阿塞维多甲基化在肝癌DN 940年 425年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
王GSK3反应抑制剂SB216763 DN 374年 217年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-19 1163年 1169年 1 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
miR-23 1262年 1268年 m8 hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
mir - 323 1262年 1268年 1 hsa - mir - 323大脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir - 330 1340年 1346年 m8 hsa - mir - 330大脑 GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
hsa - mir - 330大脑 GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
mir - 376 c 1298年 1304年 m8 hsa - mir - 376 c AACAUAGAGGAAAUUCCACG
mir - 378 317年 323年 1 hsa - mir - 378 CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU
mir - 543 1326年 1333年 1、m8 hsa - mir - 543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU