基因页:DLX5
概括?
基因 | 1749年 |
象征 | DLX5 |
同义词 | SHFM1D |
描述 | 无远端同源物5 |
参考 | MIM:600028|HGNC:HGNC:2918|ENSEMBL:ENSG00000105880|HPRD:02492|Vega:Otthumg00000154200 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q22 |
Pascal P值 | 0.045 |
胎儿β | 0.854 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DLX5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007409 | 轴突发生 | IEA | 神经元,轴突,神经突(GO期限:12) | - |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 7907794 |
去:0001501 | 骨骼系统开发 | 塔斯 | 7907794 | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
GO:0042472 | 内耳形态发生 | IEA | - | |
去:0030326 | 胚胎肢体发生 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID Delta NP63途径 | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mayburd对L663536 DN的反应 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Castellano NRAS靶向 | 68 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化12小时 | 43 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON | 76 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肥胖症的纳德勒高血糖 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Gist vs滑膜肉瘤 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su胎盘 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑中的Smid乳腺癌复发 | 39 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zaidi成骨细胞转录因子 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124/506 | 211 | 217 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-203.1 | 145 | 151 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-376 | 222 | 228 | M8 | HSA-MIR-376A | aucauagaaaaauccacgu |
HSA-MIR-376B | aucauagaaaaauccauguu | ||||
mir-496 | 131 | 137 | M8 | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
mir-543 | 255 | 261 | 1a | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |