概括
基因 1749年
象征 DLX5
同义词 SHFM1D
描述 无远端同源物5
参考 MIM:600028|HGNC:HGNC:2918|ENSEMBL:ENSG00000105880|HPRD:02492|Vega:Otthumg00000154200
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q22
Pascal P值 0.045
胎儿β 0.854

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007409 轴突发生 IEA 神经元,轴突,神经突(GO期限:12) -
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 7907794
去:0001501 骨骼系统开发 塔斯 7907794
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
GO:0042472 内耳形态发生 IEA -
去:0030326 胚胎肢体发生 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005730 核仁 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID Delta NP63途径 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mayburd对L663536 DN的反应 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Castellano NRAS靶向 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化12小时 43 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON 76 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肥胖症的纳德勒高血糖 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Gist vs滑膜肉瘤 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su胎盘 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑中的Smid乳腺癌复发 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zaidi成骨细胞转录因子 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 211 217 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-203.1 145 151 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-376 222 228 M8 HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-496 131 137 M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-543 255 261 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu