基因页:DLX6
概括?
基因 | 1750年 |
象征 | DLX6 |
同义词 | - |
描述 | 无远端同源物6 |
参考 | MIM:600030|HGNC:HGNC:2919|Ensembl:ENSG00000006377|HPRD:02493|Vega:Otthumg00000154201 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q22 |
Pascal P值 | 0.102 |
胎儿β | -0.504 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03774463 | 7 | 96636616 | dlx6as; dlx6 | 9.27E-7 | -0.398 | 0.007 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DLX6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
JPH4 | 0.90 | 0.90 |
numbl | 0.89 | 0.89 |
DUSP8 | 0.89 | 0.89 |
MAPK8IP1 | 0.88 | 0.88 |
MAPK8IP2 | 0.88 | 0.89 |
SEMA6B | 0.88 | 0.89 |
git1 | 0.88 | 0.87 |
EPN1 | 0.88 | 0.88 |
C19orf26 | 0.87 | 0.90 |
STMN3 | 0.87 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.60 | -0.46 |
MT-CO2 | -0.58 | -0.45 |
AP002478.3 | -0.57 | -0.52 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.45 |
鼻孔 | -0.57 | -0.49 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.44 |
AL139819.3 | -0.57 | -0.54 |
AF347015.33 | -0.55 | -0.42 |
mt-cyb | -0.55 | -0.43 |
AF347015.2 | -0.55 | -0.40 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 7907794 | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 7907794 |
去:0001501 | 骨骼系统开发 | 塔斯 | 7907794 | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030326 | 胚胎肢体发生 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID Delta NP63途径 | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON | 76 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康(Kang)由tert dn永生 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇9的时间反应9 | 76 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-145 | 784 | 791 | 1A,M8 | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
mir-203.1 | 900 | 906 | M8 | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-33 | 701 | 707 | 1a | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
HSA-MIR-33B | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
mir-330 | 832 | 839 | 1A,M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
mir-505 | 916 | 922 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |