基因页：DNM1

概括?
基因 1759年
Symbol DNM1
同义词 DNM | EIEE31
描述 Dynamin 1
参考 MIM：602377|HGNC:HGNC:2972|Ensembl:ENSG00000106976|HPRD：03851|Vega:OTTHUMG00000020733
Gene type protein-coding
地图位置 9q34
Pascal P值 0.058
Sherlock P值 0.923
Fetal beta -2.426
支持 ENDOCYTOSIS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_clathrin
G2CDB.HUMAN_MGLUR5
G2Cdb.human_Synaptosome
G2CDB.HUMANNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
Darnell FMRP目标
Potential synaptic genes

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.3528

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
CG14409940 9 130967820 CIZ1; DNM1 2.485E-4 0.432 0.037 DMG:Wockner_2014


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0003774 运动活动 IEA -
去：0003924 GTPase活性 IEA -
去：0003924 GTPase活性 塔斯 10944110
GO:0005515 protein binding ISS -
GO:0005525 GTP结合 IEA -
GO:0016787 hydrolase activity IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006898 receptor-mediated endocytosis 塔斯 8101525
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005856 cytoskeleton IEA -
GO:0005874 微管 IEA -
GO:0005737 细胞质 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
Amph AMPH1 两亲动 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 9148966|9280305
|9341169|9348539
|11877424
Amph AMPH1 两亲动 - HPRD 9148966|9348539
|9694653|11877424 | 10899172
AP2A2 adtab |clapa2 |hip9 |催眠 adaptor-related蛋白复合物2,α2亚基 - HPRD 10430869
ASB13 FLJ13134 |MGC19879 Ankyrin重复和含Socs盒子的13 两个杂交 BioGRID 16169070
BIN1 Amph2 | AMPHL | DKFZp547F068 | MGC10367 | SH3P9 桥接整合器1 - HPRD，Biogrid 9195986|9280305
机舱1 该隐|KIAA0330 |ppp3in calcineurin binding protein 1 - HPRD，Biogrid 10931822
clic3 - 氯化细胞内通道3 - HPRD 11563969
clic4 clic4l |DKFZP566G223 |FLJ38640 |H1 |mtclic |huh1 |P64H1 氯化物内通道4 - HPRD 11563969
CLINT1 克林特|inth |EPN4 |EPNR |Epsinr |FLJ46753 |KIAA0171 clathrin interactor 1 Reconstituted Complex BioGRID 12429846
cttn EMS1 |FLJ34459 cortactin - HPRD 12419186
DNM1 DNM Dynamin 1 - HPRD，Biogrid 7634088
DNMBP KIAA1010 |图巴 dynamin binding protein - HPRD，Biogrid 14506234
DYRK1A DYRK | DYRK1 | HP86 | MNB | MNBH dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 1A Reconstituted Complex BioGRID 11877424
EPS15 AF-1P |AF1P |mllt5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 - HPRD 11483962
fer tyk3 fer (fps/fes related) tyrosine kinase Co-fractionation BioGRID 9722593
FNBP1 FBP17 |KIAA0554 |MGC126804 formin binding protein 1 - HPRD，Biogrid 15252009
GNB2L1 Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 - HPRD 12359736
GRB2 ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 Affinity Capture-Western
远西方
Reconstituted Complex		 BioGRID 8119878|9009162
GRB2 ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD 8119878|11877424
grin1 NMDA1 |NMDAR1 |NR1 glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 1 - HPRD 10862698
GRIN2D EB11 |NMDAR2D glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2D - HPRD 10862698
ITSN1 它的|MGC134948 |MGC134949 |SH3D1A |SH3P17 相交1（SH3结构蛋白） - HPRD 10373452
KIAA1377 - KIAA1377 两个杂交 BioGRID 16169070
MAP3K10 MLK2 |MST 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶10 Reconstituted Complex BioGRID 9742220
MED31 3110004H13rik |CGI-125 |FLJ27436 |FLJ36714 |SOH1 中介复合体亚基31 两个杂交 BioGRID 16169070
mobkl3 2C4D | CGI-95 | MGC12264 | MOB1 | MOB3 | PREI3 MOB1，MPS一个粘合激酶激活剂样3（酵母） - HPRD 11872741
NCK1 MGC12668 | NCK | NCKalpha NCK适配器蛋白1 - HPRD，Biogrid 10206341
NCK2 GRB4 | NCKbeta NCK适配器蛋白2 - HPRD 11557983
NME2 MGC111212 | NDPK-B | NDPKB | NM23-H2 | NM23B | puf 非转移细胞2，蛋白质（NM23B）在 - HPRD 11872741
Pacsin1 KIAA1379 | SDPI protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 - HPRD，Biogrid 11082044
Pacsin1 KIAA1379 | SDPI protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 - HPRD 9950691|11082044
pacsin2 SDPII protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2 Reconstituted Complex BioGRID 11082044
Pacsin3 SDPIII protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3 - HPRD，Biogrid 11082044
PFN2 D3S1319E | PFL profilin 2 - HPRD 9463375
PIAS1 DDXBP1 | GBP | GU/RH-II | MGC141878 | MGC141879 | ZMIZ3 活化统计的蛋白质抑制剂，1 - HPRD 15123615
PIN4 EPVH | MGC138486 | PAR14 | PAR17 蛋白质（肽基丙基顺式/反式异构酶）NIMA相互作用，4（parvulin） 两个杂交 BioGRID 16169070
prnp ascr |CD230 |CJD |GSS |MGC26679 |prip |prp |PRP27-30 |PRP33-35C |PRPC | prion prion蛋白 - HPRD 15146195
SH3GL1 CNSA1 | EEN | MGC111371 | SH3D2B | SH3P8 SH3域grb2状1 - HPRD，Biogrid 9238017|10764144
SH3GL2 CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 SH3域grb2样2 Reconstituted Complex BioGRID 9341169|12456676
SH3GL2 CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 SH3域grb2样2 - HPRD 11877424
SH3GL2 CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 SH3域grb2样2 - HPRD 9238017|11877424
SH3GL3 CNSA3 | EEN-2B-L3 | EEN-B2 | HsT19371 | SH3D2C | SH3P13 SH3域grb2状3 Endophilin A3 interacts with Dynamin. BIND 11894096
SH3GL3 CNSA3 | EEN-2B-L3 | EEN-B2 | HsT19371 | SH3D2C | SH3P13 SH3域grb2状3 - HPRD 9238017
SH3GLB1 BIF-1 |CGI-61 |KIAA0491 |DJ612B15.2 SH3域grb2样内粒蛋白B1 Reconstituted Complex BioGRID 12456676
SNAP25 FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 | SNAP | SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 突触小体相关蛋白，25KDA - HPRD 10373452


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG ENDOCYTOSIS 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FC GAMMA R MEDIATED PHAGOCYTOSIS 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ndkdynamin途径 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GABA PATHWAY 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BARR MAPK PATHWAY 12 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Barrestin SRC途径 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BARRESTIN PATHWAY 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Notch途径 59 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHB FWD PATHWAY 40 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2 Pathway 57 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR2途径 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1内部化途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR3途径 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID THROMBIN PAR1 PATHWAY 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR1途径 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Ephrinb Rev Pathway 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GAP JUNCTION DEGRADATION 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MHC II类抗原表现 91 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RETROGRADE NEUROTROPHIN SIGNALLING 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1的Reactome回收途径 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TOLL RECEPTOR CASCADES 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GAP JUNCTION TRAFFICKING 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA REVERSIBLY UP 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 CHRONIC LOF UP 115 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION DN 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND SERUM DEPRIVATION DN 84 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG IMMORTALIZED BY TERT DN 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING HYPOTHALAMUS DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6 SIGNALING SCAR UP 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 7 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX DN 54 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG CORE SERUM RESPONSE DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 11 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS INTERFERON DN 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC HCP WITH H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dasu IL6信号向上 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILANGES SERUM SENSITIVE GENES 90 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bilanges血清反应翻译 37 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA ISLET HNF1A TARGETS UP 163 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-224 107 114 1A,m8 HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua