基因页:DMRT1
概括?
基因 | 1761年 |
象征 | DMRT1 |
同义词 | CT154 | DMT1 |
描述 | Doublesex和MAB-3相关转录因子1 |
参考 | MIM:602424|HGNC:HGNC:2934|ENSEMBL:ENSG00000137090|HPRD:03885|Vega:Otthumg0000000019435 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p24.3 |
Pascal P值 | 0.058 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DMRT1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF512B | 0.87 | 0.88 |
ZNF785 | 0.86 | 0.88 |
ZNF710 | 0.86 | 0.83 |
Arhgef10l | 0.86 | 0.87 |
ZSCAN22 | 0.86 | 0.84 |
SLC35E2 | 0.86 | 0.85 |
dot1l | 0.86 | 0.88 |
TNRC18B | 0.86 | 0.85 |
RAI1 | 0.86 | 0.84 |
KLHL17 | 0.85 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.72 |
AF347015.27 | -0.59 | -0.72 |
MT-CO2 | -0.57 | -0.70 |
COPZ2 | -0.57 | -0.67 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.66 |
mt-cyb | -0.56 | -0.67 |
C5orf53 | -0.55 | -0.58 |
AF347015.8 | -0.55 | -0.69 |
B2M | -0.54 | -0.62 |
higd1b | -0.54 | -0.68 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
高田胃癌拷贝编号DN | 29 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES核心九相关 | 100 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
精子DN中的Weber甲基化HCP | 28 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk男性繁殖Sertoli | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK精子细胞 | 72 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |