基因页:dnase1l2
概括?
基因 | 1775年 |
象征 | dnase1l2 |
同义词 | DNAS1L2 |
描述 | 脱氧核糖核酸酶I类2 |
参考 | MIM:602622|HGNC:HGNC:2958|ENSEMBL:ENSG00000167968|HPRD:04018|Vega:Otthumg00000177086 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p13.3 |
Pascal P值 | 0.436 |
胎儿β | 0.255 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
dnase1l2 | CHR16 | 2287532 | C | t | NM_001374 | p.158p> l | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SNP_A-2054853 | 0 | dnase1l2 | 1775年 | 0.1 | 反式 | |||
RS10026915 | CHR4 | 57857770 | dnase1l2 | 1775年 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DNASE1L2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF649 | 0.89 | 0.84 |
RBBP4 | 0.88 | 0.85 |
BBS9 | 0.87 | 0.86 |
MCPH1 | 0.87 | 0.85 |
ERCC8 | 0.87 | 0.86 |
XRCC5 | 0.86 | 0.85 |
G2E3 | 0.86 | 0.86 |
INTS7 | 0.86 | 0.84 |
PRPF40A | 0.86 | 0.85 |
PHF16 | 0.86 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
pth1r | -0.59 | -0.68 |
SLC9A3R2 | -0.58 | -0.57 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.73 |
HLA-F | -0.57 | -0.66 |
TNFSF12 | -0.57 | -0.61 |
MT-CO2 | -0.57 | -0.75 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.74 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.73 |
AIFM3 | -0.56 | -0.65 |
C5orf53 | -0.56 | -0.61 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
石匠食道癌发生 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞SCP2 QTL Trans | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应15 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |