概括
基因 1775年
象征 dnase1l2
同义词 DNAS1L2
描述 脱氧核糖核酸酶I类2
参考 MIM:602622|HGNC:HGNC:2958|ENSEMBL:ENSG00000167968|HPRD:04018|Vega:Otthumg00000177086
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p13.3
Pascal P值 0.436
胎儿β 0.255
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
dnase1l2 CHR16 2287532 C t NM_001374 p.158p> l 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
SNP_A-2054853 0 dnase1l2 1775年 0.1 反式
RS10026915 CHR4 57857770 dnase1l2 1775年 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF649 0.89 0.84
RBBP4 0.88 0.85
BBS9 0.87 0.86
MCPH1 0.87 0.85
ERCC8 0.87 0.86
XRCC5 0.86 0.85
G2E3 0.86 0.86
INTS7 0.86 0.84
PRPF40A 0.86 0.85
PHF16 0.86 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
pth1r -0.59 -0.68
SLC9A3R2 -0.58 -0.57
AF347015.27 -0.57 -0.73
HLA-F -0.57 -0.66
TNFSF12 -0.57 -0.61
MT-CO2 -0.57 -0.75
AF347015.31 -0.57 -0.74
AF347015.33 -0.56 -0.73
AIFM3 -0.56 -0.65
C5orf53 -0.56 -0.61

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
石匠食道癌发生 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞SCP2 QTL Trans 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应15 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因