基因页:Dync1H1
概括?
基因 | 1778年 |
象征 | Dync1H1 |
同义词 | CMT2O | DHC1 | DHC1A | DNCH1 | DNCL | DNECL | DNECL | DYHC | DNCHC1 | HL-3 | SMALED1 | P22 |
描述 | 动力蛋白细胞质1重链1 |
参考 | MIM:600112|HGNC:HGNC:2961|ENSEMBL:ENSG00000197102|HPRD:02524|Vega:Otthumg00000171644 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q32 |
Pascal P值 | 0.231 |
Sherlock P值 | 0.001 |
胎儿β | -0.514 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 细胞内贩运 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0114 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG10252235 | 14 | 102508959 | Dync1H1 | 6.64e-5 | 0.526 | 0.024 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17799628 | Chr9 | 106442995 | Dync1H1 | 1778年 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DYNC1H1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003777 | 微管运动活动 | IEA | - | |
去:0003777 | 微管运动活动 | nas | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17043677|17353931 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004197 | 半胱氨酸型内肽酶活性 | IEA | - | |
GO:0042623 | ATPase活动,耦合 | nas | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
去:0007052 | 有丝分裂主轴组织 | nas | 8227145 | |
去:0007018 | 基于微管的运动 | IEA | - | |
去:0007018 | 基于微管的运动 | nas | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005868 | 细胞质动力蛋白复合物 | nas | 8666668 | |
去:0005874 | 微管 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0030286 | 动力蛋白复合物 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ARF6 | DKFZP564M0264 | ADP-核糖基化因子6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
BICD2 | KIAA0699 |BA526D8.1 | Bicauaudal D同源2(果蝇) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 11483508 |
C20ORF24 | PNAS-11 |RIP5 | 染色体20开放阅读框24 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
DCTN1 | DAP-150 |DP-150 |HMN7B |P135 | Dynactin 1(P150,胶合同源物,果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14600259 |
dynll1 | DLC1 |DLC8 |DNCL1 |DNClc1 |LC8 |LC8A |MGC126137 |MGC126138 |PIN |HDLC1 | Dynein,轻链,LC8型1 | - | HPRD | 14760703 |
EPB41 | 4.1r |El1 |他 | 红细胞膜蛋白条带4.1(椭圆细胞增多症1,rh-c-链接) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10189366 |
NDEL1 | DKFZP451M0318 |eopa |mitap1 |努德尔 | 裸核分布基因E同源物(A. nidulans)类似1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11163260 |
NME2 | MGC111212 |NDPK-B |NDPKB |NM23-H2 |NM23B |puf | 非转移细胞2,蛋白质(NM23B)在 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
pafah1b1 | lis1 |lis2 |MDCR |MDS |帕法 | 血小板激活因子乙酰水合酶,同工型IB,α亚基45KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 11889140 |
SNRPB | 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b | 小核核糖核蛋白多肽B和B1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
tor1a | DQ2 |dyt1 | Torsin家族1,成员A(Torsin A) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
TSC22D1 | DKFZP686O19206 |MGC17597 |RP11-269C23.2 |TGFB1I4 |TSC22 | TSC22域家庭,成员1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG加压素调节的水重吸收 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID LIS1途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome MHC II类抗原表现 | 91 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 | 81 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 8Q24 UP | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystroem与IL5 UP相关 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Medina Smarca4目标 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江口大脑皮层DN | 54 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BILD CTNNB1致癌特征 | 82 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |