概括
基因 1778年
象征 Dync1H1
同义词 CMT2O | DHC1 | DHC1A | DNCH1 | DNCL | DNECL | DNECL | DYHC | DNCHC1 | HL-3 | SMALED1 | P22
描述 动力蛋白细胞质1重链1
参考 MIM:600112|HGNC:HGNC:2961|ENSEMBL:ENSG00000197102|HPRD:02524|Vega:Otthumg00000171644
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q32
Pascal P值 0.231
Sherlock P值 0.001
胎儿β -0.514
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞内贩运
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0114

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10252235 14 102508959 Dync1H1 6.64e-5 0.526 0.024 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17799628 Chr9 106442995 Dync1H1 1778年 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003777 微管运动活动 IEA -
去:0003777 微管运动活动 nas -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17043677|17353931
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004197 半胱氨酸型内肽酶活性 IEA -
GO:0042623 ATPase活动,耦合 nas -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0007052 有丝分裂主轴组织 nas 8227145
去:0007018 基于微管的运动 IEA -
去:0007018 基于微管的运动 nas -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 艾达 18029348
去:0005868 细胞质动力蛋白复合物 nas 8666668
去:0005874 微管 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
GO:0030286 动力蛋白复合物 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ARF6 DKFZP564M0264 ADP-核糖基化因子6 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
BICD2 KIAA0699 |BA526D8.1 Bicauaudal D同源2(果蝇) 亲和力捕获ms Biogrid 11483508
C20ORF24 PNAS-11 |RIP5 染色体20开放阅读框24 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
DCTN1 DAP-150 |DP-150 |HMN7B |P135 Dynactin 1(P150,胶合同源物,果蝇) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14600259
dynll1 DLC1 |DLC8 |DNCL1 |DNClc1 |LC8 |LC8A |MGC126137 |MGC126138 |PIN |HDLC1 Dynein,轻链,LC8型1 - HPRD 14760703
EPB41 4.1r |El1 |他 红细胞膜蛋白条带4.1(椭圆细胞增多症1,rh-c-链接) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10189366
NDEL1 DKFZP451M0318 |eopa |mitap1 |努德尔 裸核分布基因E同源物(A. nidulans)类似1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11163260
NME2 MGC111212 |NDPK-B |NDPKB |NM23-H2 |NM23B |puf 非转移细胞2,蛋白质(NM23B)在 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
pafah1b1 lis1 |lis2 |MDCR |MDS |帕法 血小板激活因子乙酰水合酶,同工型IB,α亚基45KDA 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 11889140
SNRPB 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b 小核核糖核蛋白多肽B和B1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
tor1a DQ2 |dyt1 Torsin家族1,成员A(Torsin A) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
TSC22D1 DKFZP686O19206 |MGC17597 |RP11-269C23.2 |TGFB1I4 |TSC22 TSC22域家庭,成员1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG加压素调节的水重吸收 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LIS1途径 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MHC II类抗原表现 91 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 81 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heidenblad Amplicon 8Q24 UP 40 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystroem与IL5 UP相关 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Medina Smarca4目标 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江口大脑皮层DN 54 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1致癌特征 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因