基因页:AGL
概括?
基因 | 178 |
象征 | AGL |
同义词 | GDE |
描述 | 杏仁-1、6-葡萄糖苷酶,4-α-葡萄糖转移酶 |
参考 | MIM:610860|HGNC:HGNC:321|ENSEMBL:ENSG00000162688|HPRD:01984|Vega:Otthumg0000000010803 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p21 |
Pascal P值 | 0.813 |
胎儿β | 0.862 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13614946 | 1 | 100315421 | AGL | 3.37E-10 | -0.011 | 7.22E-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS111508077 | 1 | 100321898 | AGL | ENSG00000162688.11 | 5.3053E-6 | 0.05 | 6258 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AGL_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
A1bg | 0.49 | 0.24 |
HBQ1 | 0.48 | 0.25 |
Sult1a2 | 0.48 | 0.33 |
塞尔姆 | 0.48 | 0.33 |
C9orf16 | 0.48 | 0.23 |
FBP1 | 0.48 | 0.37 |
guk1 | 0.47 | 0.29 |
C17orf90 | 0.47 | 0.27 |
TMEM141 | 0.47 | 0.30 |
LSMD1 | 0.46 | 0.21 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF652 | -0.28 | -0.27 |
ZC3H13 | -0.27 | -0.26 |
MAP4K4 | -0.27 | -0.28 |
恩 | -0.27 | -0.31 |
RBM27 | -0.27 | -0.28 |
C6orf204 | -0.27 | -0.27 |
CRK | -0.26 | -0.29 |
Sestd1 | -0.26 | -0.26 |
KDM5A | -0.26 | -0.28 |
ZNF507 | -0.26 | -0.26 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg淀粉和蔗糖代谢 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖原分解糖原分解 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组葡萄糖代谢 | 69 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 | 151 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iizuka肝癌进展L1 G1 UP | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nutt GBM与AO胶质瘤 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha糖原代谢 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |