概括
基因 1798年
象征 dpagt1
同义词 alg7 | cdg-ij | cdg1j | cms13 | cmsta2 | d11s366 | dgpt | dpagt | dpagt2 | g1pt | g1pt | gpt | gpt | uagt | ugat
描述 多甲基磷酸N-乙酰葡萄糖氨基转移酶1
参考 MIM:191350|HGNC:HGNC:2995|Ensembl:ENSG00000172269|HPRD:01879|Vega:Otthumg00000153533
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.3
Pascal P值 0.038
Sherlock P值 0.435
胎儿β -0.444
DMG 1(#研究)
主持人 海马
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG19507238 11 118973022 dpagt1 9.6e-8 -0.019 2.15e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1407513 CHR6 169152926 dpagt1 1798年 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Azin1 0.93 0.94
FYTTD1 0.93 0.94
STX7 0.92 0.93
BZW1 0.92 0.94
Rab10 0.92 0.92
DNAJA1 0.92 0.90
HSPA13 0.92 0.95
SNX4 0.91 0.90
CAND1 0.91 0.92
MATR3 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.68 -0.80
MT-CO2 -0.67 -0.78
AF347015.33 -0.67 -0.76
AC018755.7 -0.66 -0.74
AF347015.31 -0.65 -0.75
mt-cyb -0.65 -0.75
AF347015.8 -0.64 -0.76
AF347015.2 -0.64 -0.75
AF347015.26 -0.63 -0.74
higd1b -0.63 -0.75

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003975 UDP-N-乙酰葡萄糖胺 - 磷酸氨基氨基氨基氨基氨基氨基氨基转移酶活性 艾达 8179616
去:0003975 UDP-N-乙酰葡萄糖胺 - 磷酸氨基氨基氨基氨基氨基氨基氨基转移酶活性 小鬼 12872255
GO:0016757 转移酶活性,转移糖基团 IEA -
去:0008963 磷酸-N-乙酰氨基酰酰酰酰酰酰酰酰酰酰酰苷转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0051259 蛋白质寡聚 ISS -
GO:0019408 多利基醇生物合成过程 艾达 8179616
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005792 微型体 艾达 12872255
去:0005789 内质网膜 ISS -
去:0005624 膜分数 艾达 8179616
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 ISS -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg n glycan生物合成 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
N Glycan前体Dolichol脂质的寡糖LLO的Reactome生物合成并转移到新生蛋白 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cardoso对伽马辐射和3AB的反应 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 220 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因