基因页:dpagt1
概括?
基因 | 1798年 |
象征 | dpagt1 |
同义词 | alg7 | cdg-ij | cdg1j | cms13 | cmsta2 | d11s366 | dgpt | dpagt | dpagt2 | g1pt | g1pt | gpt | gpt | uagt | ugat |
描述 | 多甲基磷酸N-乙酰葡萄糖氨基转移酶1 |
参考 | MIM:191350|HGNC:HGNC:2995|Ensembl:ENSG00000172269|HPRD:01879|Vega:Otthumg00000153533 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q23.3 |
Pascal P值 | 0.038 |
Sherlock P值 | 0.435 |
胎儿β | -0.444 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 海马 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG19507238 | 11 | 118973022 | dpagt1 | 9.6e-8 | -0.019 | 2.15e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1407513 | CHR6 | 169152926 | dpagt1 | 1798年 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DPAGT1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Azin1 | 0.93 | 0.94 |
FYTTD1 | 0.93 | 0.94 |
STX7 | 0.92 | 0.93 |
BZW1 | 0.92 | 0.94 |
Rab10 | 0.92 | 0.92 |
DNAJA1 | 0.92 | 0.90 |
HSPA13 | 0.92 | 0.95 |
SNX4 | 0.91 | 0.90 |
CAND1 | 0.91 | 0.92 |
MATR3 | 0.91 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.68 | -0.80 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.78 |
AF347015.33 | -0.67 | -0.76 |
AC018755.7 | -0.66 | -0.74 |
AF347015.31 | -0.65 | -0.75 |
mt-cyb | -0.65 | -0.75 |
AF347015.8 | -0.64 | -0.76 |
AF347015.2 | -0.64 | -0.75 |
AF347015.26 | -0.63 | -0.74 |
higd1b | -0.63 | -0.75 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003975 | UDP-N-乙酰葡萄糖胺 - 磷酸氨基氨基氨基氨基氨基氨基氨基转移酶活性 | 艾达 | 8179616 | |
去:0003975 | UDP-N-乙酰葡萄糖胺 - 磷酸氨基氨基氨基氨基氨基氨基氨基转移酶活性 | 小鬼 | 12872255 | |
GO:0016757 | 转移酶活性,转移糖基团 | IEA | - | |
去:0008963 | 磷酸-N-乙酰氨基酰酰酰酰酰酰酰酰酰酰酰苷转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0051259 | 蛋白质寡聚 | ISS | - | |
GO:0019408 | 多利基醇生物合成过程 | 艾达 | 8179616 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005792 | 微型体 | 艾达 | 12872255 | |
去:0005789 | 内质网膜 | ISS | - | |
去:0005624 | 膜分数 | 艾达 | 8179616 | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | ISS | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg n glycan生物合成 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
N Glycan前体Dolichol脂质的寡糖LLO的Reactome生物合成并转移到新生蛋白 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cardoso对伽马辐射和3AB的反应 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 | 220 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |