基因页:DPEP1
概括?
基因 | 1800 |
象征 | DPEP1 |
同义词 | MBD1 | MDP | RDP |
描述 | 二肽酶1(肾) |
参考 | MIM:179780|HGNC:HGNC:3002|Ensembl:ENSG0000000015413|HPRD:01563|Vega:Otthumg00000138052 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q24.3 |
Pascal P值 | 4.491E-6 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | DPEP1 | 1800 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DPEP1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GPR6 | 0.91 | 0.71 |
CHRM4 | 0.89 | 0.80 |
drd2 | 0.88 | 0.58 |
Onecut2 | 0.87 | 0.53 |
Htr6 | 0.86 | 0.79 |
GPR149 | 0.85 | 0.64 |
SH3RF2 | 0.85 | 0.56 |
AC020658.1 | 0.84 | 0.66 |
PDE10A | 0.84 | 0.40 |
妈妈 | 0.84 | 0.49 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HEBP2 | -0.23 | -0.42 |
metrnl | -0.22 | -0.33 |
LGALS3 | -0.22 | -0.33 |
Sycp3 | -0.22 | -0.42 |
CCDC90A | -0.22 | -0.08 |
emid1 | -0.22 | -0.16 |
AP005482.2 | -0.21 | -0.26 |
CBS | -0.20 | -0.09 |
CDADC1 | -0.19 | 0.21 |
DBI | -0.19 | -0.39 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16189514 | |
GO:0016805 | 二肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0008239 | 二肽基肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008235 | 金属核糖肽酶活性 | 塔斯 | 2303490 | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon(GO术语级别:4) | - |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0016324 | 顶质膜 | IEA | - | |
GO:0031225 | 锚定在膜上 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis乳腺癌进展DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化cdc25 | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN | 149 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN | 51 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
糖尿病性肾病 | 86 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成4 | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yokoe Cancer testis抗原 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Baus TFF2靶向 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Schwannoma DN | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |