基因页：DPP4
Summary？
| 基因 | 1803年 |
| 象征 | DPP4 |
| Synonyms | ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 |
| Description | 二肽基肽酶4 |
| Reference | MIM：102720|HGNC:HGNC:3009|ENSEMBL：ENSG00000197635|HPRD：02187|Vega：Otthumg00000132056 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 米ap location | 2q24.3 |
| 帕斯卡假定值 | 2.019E-6 |
| 胎儿β | 1.306 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 米ethod of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | Genome-wide Association Studies | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | High-throughput literature-search | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 | |
| Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | Gene | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2909457 | CHR2 | 162845855 | Ag | 4.375E-8 | 基因间 | SLC4A10，DPP4 | dist = 4069; dist = 2900 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DMPK | 0.60 | 0.69 |
| AC004410.1 | 0.57 | 0.67 |
| SLC12A9 | 0.57 | 0.67 |
| prx | 0.56 | 0.66 |
| AC006028.3 | 0.56 | 0.63 |
| CCDC37 | 0.54 | 0.48 |
| ZNF296 | 0.53 | 0.65 |
| Amigo3 | 0.53 | 0.68 |
| PCSK4 | 0.53 | 0.58 |
| AP006284.2 | 0.53 | 0.53 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KBTBD3 | -0.43 | -0.58 |
| UGP2 | -0.41 | -0.46 |
| ATP6V1E1 | -0.40 | -0.40 |
| FAM162A | -0.39 | -0.49 |
| HIGD1A | -0.39 | -0.49 |
| chn1 | -0.39 | -0.39 |
| MDH1 | -0.38 | -0.39 |
| C12ORF29 | -0.38 | -0.45 |
| TMEM70 | -0.38 | -0.41 |
| C1orf43 | -0.38 | -0.40 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004252 | serine-type endopeptidase activity | IEA | 谷氨酸（GO期限：7） | - |
| 去：0004177 | 氨基肽酶活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 7594462|14684150 | |
| 去：0008239 | 二肽基肽酶活性 | 艾达 | 14684150 | |
| 去：0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
| GO：0042803 | 蛋白质同构化活性 | IPI | 14684150 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0001666 | 对缺氧的反应 | 艾达 | 16670267 | |
| 去：0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
| GO：0042110 | T细胞激活 | 艾达 | 7594462 | |
| GO：0033632 | regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin | 艾达 | 11772392 | |
| Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 7594462|11772392 | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 16670267 | |
| GO:0046581 | 细胞间管 | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-140 | 602 | 609 | 1A，M8 | HSA-MIR-140brain | AgUGGUUUUACCCUAUGGUAG |
| mir-148/152 | 585 | 591 | 1a | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152brain | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| miR-153 | 577 | 583 | 1a | HSA-MIR-153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| mir-205 | 848 | 854 | 1a | hsa-miR-205 | UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG |
| mir-22 | 770 | 776 | M8 | hsa-miR-22brain | Aagcugccaguugaagaacugu |
| mir-29 | 686 | 692 | 1a | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| miR-378 | 564 | 570 | 1a | HSA-MIR-378 | CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU |
| mir-448 | 576 | 583 | 1A，M8 | hsa-miR-448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| mir-9 | 625 | 631 | 1a | HSA-MIR-9SZ | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |