概括
基因 1804年
象征 DPP6
同义词 DPL1 | DPPX | MRD33 | VF2
描述 二肽基肽酶像6
参考 MIM:126141|HGNC:HGNC:3010|Ensembl:ENSG00000130226|HPRD:00525|Vega:Otthumg00000151511
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q36.2
Pascal P值 0.007
Sherlock P值 0.898
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 RNA和蛋白质合成
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25228870 7 153759349 DPP6 4.809E-4 0.2 0.046 DMG:Wockner_2014
CG18252309 7 153583867 DPP6 1.09E-9 -0.01 1.22E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12154602 CHR7 154420512 DPP6 1804年 0.06 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC7A4 0.81 0.88
rasal1 0.79 0.78
TMEM130 0.79 0.86
Prkcg 0.77 0.84
rasgef1a 0.76 0.85
AP001107.1 0.76 0.85
MAP2K1 0.76 0.83
SYN2 0.76 0.84
mtch1 0.75 0.81
prnp 0.75 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RBMX2 -0.42 -0.47
KIAA1949 -0.39 -0.28
EIF5B -0.39 -0.46
C21orf57 -0.38 -0.38
nasp -0.38 -0.29
ZNF300 -0.37 -0.13
pde9a -0.37 -0.34
exosc8 -0.37 -0.31
tubb2b -0.37 -0.37
AS3MT -0.37 -0.33

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008236 丝氨酸型肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:6) -
去:0008239 二肽基肽酶活性 塔斯 8103397
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄端癌DN 82 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
约瑟夫对丁酸钠DN的反应 64 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein神经元标记 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因