基因页:DPP6
概括?
基因 | 1804年 |
象征 | DPP6 |
同义词 | DPL1 | DPPX | MRD33 | VF2 |
描述 | 二肽基肽酶像6 |
参考 | MIM:126141|HGNC:HGNC:3010|Ensembl:ENSG00000130226|HPRD:00525|Vega:Otthumg00000151511 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q36.2 |
Pascal P值 | 0.007 |
Sherlock P值 | 0.898 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | RNA和蛋白质合成 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25228870 | 7 | 153759349 | DPP6 | 4.809E-4 | 0.2 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
CG18252309 | 7 | 153583867 | DPP6 | 1.09E-9 | -0.01 | 1.22E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12154602 | CHR7 | 154420512 | DPP6 | 1804年 | 0.06 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DPP6_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC7A4 | 0.81 | 0.88 |
rasal1 | 0.79 | 0.78 |
TMEM130 | 0.79 | 0.86 |
Prkcg | 0.77 | 0.84 |
rasgef1a | 0.76 | 0.85 |
AP001107.1 | 0.76 | 0.85 |
MAP2K1 | 0.76 | 0.83 |
SYN2 | 0.76 | 0.84 |
mtch1 | 0.75 | 0.81 |
prnp | 0.75 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBMX2 | -0.42 | -0.47 |
KIAA1949 | -0.39 | -0.28 |
EIF5B | -0.39 | -0.46 |
C21orf57 | -0.38 | -0.38 |
nasp | -0.38 | -0.29 |
ZNF300 | -0.37 | -0.13 |
pde9a | -0.37 | -0.34 |
exosc8 | -0.37 | -0.31 |
tubb2b | -0.37 | -0.37 |
AS3MT | -0.37 | -0.33 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008236 | 丝氨酸型肽酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:6) | - |
去:0008239 | 二肽基肽酶活性 | 塔斯 | 8103397 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄端癌DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约瑟夫对丁酸钠DN的反应 | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein神经元标记 | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |