基因页:AGRP
概括?
基因 | 181 |
象征 | AGRP |
同义词 | Agrt | Art | ASIP2 |
描述 | 与Agouti相关的神经肽 |
参考 | MIM:602311|HGNC:HGNC:330|Ensembl:ENSG00000159723|HPRD:09079|Vega:Otthumg00000137509 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q22 |
Pascal P值 | 3.782E-4 |
胎儿β | -0.346 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AGRP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005184 | 神经肽激素活性 | 塔斯 | 轴突,突触,大脑,神经递质(GO期限:6) | 9311920 |
去:0005102 | 受体结合 | 塔斯 | 神经递质(GO期限:4) | 10318826 |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007218 | 神经肽信号通路 | 塔斯 | 神经递质(GO期限:8) | 9311920 |
去:0009755 | 激素介导的信号传导 | IEA | - | |
去:0007631 | 喂养行为 | 塔斯 | 9751529 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG脂肪细胞信号传导途径 | 67 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 3途径 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |