概括
基因 1810
象征 DR1
同义词 nc2 | nc2-beta | nc2b
描述 转录的下调1
参考 MIM:601482|HGNC:HGNC:3017|HPRD:03284|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p22.1
Pascal P值 0.683
胎儿β 0.626
主持人 尾状基底神经节
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.996
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATXN2L 0.94 0.95
PTPN23 0.93 0.95
CIC 0.93 0.95
Zmiz2 0.93 0.93
PCNXL3 0.93 0.93
BAT2 0.93 0.95
mgrn1 0.92 0.93
TSC2 0.91 0.92
ZNF142 0.91 0.92
ZC3H3 0.91 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.71 -0.77
MT-CO2 -0.70 -0.77
AF347015.21 -0.69 -0.84
GNG11 -0.68 -0.79
S100B -0.67 -0.74
C5orf53 -0.67 -0.69
C1orf54 -0.67 -0.83
higd1b -0.66 -0.75
AC021016.1 -0.66 -0.74
mt-cyb -0.65 -0.71

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003714 转录CorePressor活性 塔斯 8670811
去:0008134 转录因子结合 塔斯 1339312
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000122 RNA聚合酶II启动子的转录负调控 塔斯 8670811
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关 100 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA垂体胎儿与成人DN 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C0的反应 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 193 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 1724年 1731年 1A,M8 HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-122 747 753 1a HSA-MIR-122A uggagugugacaaugguuuugu
mir-137 1924年 1931年 1A,M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-141/200a 282 289 1A,M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-144 1725年 1731年 1a HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-182 1366 1373 1A,M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-194 285 291 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-203.1 697 704 1A,M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-224 1876年 1882年 M8 HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-320 1067 1073 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-369-3p 1855年 1862年 1A,M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 1856年 1862年 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-409-3p 557 563 1a HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-490 1826年 1832年 1a HSA-MIR-490 caaccuggaggacuaugcugcug
mir-496 161 168 1A,M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-9 1668年 1674年 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga