基因页:DR1
概括?
基因 | 1810 |
象征 | DR1 |
同义词 | nc2 | nc2-beta | nc2b |
描述 | 转录的下调1 |
参考 | MIM:601482|HGNC:HGNC:3017|HPRD:03284| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p22.1 |
Pascal P值 | 0.683 |
胎儿β | 0.626 |
主持人 | 尾状基底神经节 额叶皮质BA9 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DR1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATXN2L | 0.94 | 0.95 |
PTPN23 | 0.93 | 0.95 |
CIC | 0.93 | 0.95 |
Zmiz2 | 0.93 | 0.93 |
PCNXL3 | 0.93 | 0.93 |
BAT2 | 0.93 | 0.95 |
mgrn1 | 0.92 | 0.93 |
TSC2 | 0.91 | 0.92 |
ZNF142 | 0.91 | 0.92 |
ZC3H3 | 0.91 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.71 | -0.77 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.77 |
AF347015.21 | -0.69 | -0.84 |
GNG11 | -0.68 | -0.79 |
S100B | -0.67 | -0.74 |
C5orf53 | -0.67 | -0.69 |
C1orf54 | -0.67 | -0.83 |
higd1b | -0.66 | -0.75 |
AC021016.1 | -0.66 | -0.74 |
mt-cyb | -0.65 | -0.71 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003714 | 转录CorePressor活性 | 塔斯 | 8670811 | |
去:0008134 | 转录因子结合 | 塔斯 | 1339312 | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | 塔斯 | 8670811 | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES核心九相关 | 100 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MA垂体胎儿与成人DN | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C0的反应 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦响应集群D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 | 193 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-101 | 1724年 | 1731年 | 1A,M8 | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
mir-122 | 747 | 753 | 1a | HSA-MIR-122A | uggagugugacaaugguuuugu |
mir-137 | 1924年 | 1931年 | 1A,M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-141/200a | 282 | 289 | 1A,M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
mir-144 | 1725年 | 1731年 | 1a | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
mir-182 | 1366 | 1373 | 1A,M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-194 | 285 | 291 | 1a | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
mir-203.1 | 697 | 704 | 1A,M8 | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-224 | 1876年 | 1882年 | M8 | HSA-MIR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
mir-320 | 1067 | 1073 | 1a | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa | ||||
mir-369-3p | 1855年 | 1862年 | 1A,M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 1856年 | 1862年 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
mir-409-3p | 557 | 563 | 1a | HSA-MIR-409-3P | cgauauguugcucggugaaccccu |
mir-490 | 1826年 | 1832年 | 1a | HSA-MIR-490 | caaccuggaggacuaugcugcug |
mir-496 | 161 | 168 | 1A,M8 | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
mir-9 | 1668年 | 1674年 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |