概括
基因 1811
象征 SLC26A3
同义词 cld | dra
描述 Solute Carrier家族26成员3
参考 MIM:126650|HGNC:HGNC:3018|Ensembl:ENSG0000000091138|HPRD:00544|Vega:Otthumg00000154812
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q31
Pascal P值 0.506
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 0

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16869851 CHR4 20690056 SLC26A3 1811 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
cadps2 0.78 0.60
ZNF365 0.77 0.59
FBLN7 0.77 0.59
RGS4 0.77 0.69
SYT12 0.76 0.66
htr2a 0.76 0.54
KIAA0748 0.76 0.70
snap25 0.75 0.55
STEAP2 0.75 0.68
ETS2 0.75 0.59
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FADS2 -0.47 -0.51
Bcl7c -0.46 -0.60
PKN1 -0.43 -0.55
traf4 -0.43 -0.63
pde9a -0.42 -0.58
SH3BP2 -0.41 -0.59
tubb2b -0.41 -0.61
SLC25A1 -0.41 -0.55
KIAA1949 -0.41 -0.54
GPR125 -0.41 -0.41

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边结肠癌MSI与MSS DN 81 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌腔 84 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因