Summary
基因ID 1815年
象征 DRD4
同义词 D4DR
描述 dopamine receptor D4
参考 MIM:126452|HGNC:HGNC:3025|Ensembl:ENSG0000000069696|HPRD:00541|Vega:Otthumg00000133312
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5
Pascal P值 0.357
Sherlock P值 0.764
胎儿β 0.027
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
ADT:SUN_2012 系统研究抗精神病药及其靶标 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 3 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:9
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:31

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16903386 CHR5 88159284 DRD4 1815年 0.11 反式
RS7503446 CHR17 37246066 DRD4 1815年 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TBR1 0.92 0.79
FAM59A 0.92 0.90
SLC35F2 0.91 0.81
PBX1 0.90 0.88
OSBPL10 0.90 0.85
stt3b 0.89 0.90
GPD1L 0.88 0.89
DAP 0.88 0.69
毒品 0.88 0.81
limch1 0.88 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
serpinb6 -0.56 -0.66
C5orf53 -0.53 -0.69
TNFSF12 -0.53 -0.58
HSD17B14 -0.53 -0.73
ifi27 -0.52 -0.80
FXYD1 -0.52 -0.82
AC018755.7 -0.51 -0.65
AC007405.8 -0.51 -0.60
pth1r -0.51 -0.68
AIFM3 -0.51 -0.70

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004952 多巴胺受体活性 IEA 神经递质,多巴胺(GO期限:8) -
去:0004952 多巴胺受体活性 nas 神经递质,多巴胺(GO期限:8) 8746407
去:0001593 多巴胺D4受体活性 IEA 多巴胺(GO期限:10) -
去:0001591 dopamine receptor coupled via Gi/Go 塔斯 神经递质,多巴胺(GO期限:9) 9457173
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0008144 药物结合 艾达 1840645
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0060080 调节抑制性突触后膜电位 IEA 神经元,突触(GO期限:10) -
去:0007268 突触传输 塔斯 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 8413587
去:0007195 多巴胺受体,腺苷酸环化酶抑制途径 IEA 多巴胺(GO期限:12) -
去:0007195 多巴胺受体,腺苷酸环化酶抑制途径 塔斯 多巴胺(GO期限:12) 9457173
GO:0042053 多巴胺代谢过程的调节 IEA 多巴胺(GO期限:9) -
去:0001975 对苯丙胺的反应 IEA -
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 IEA -
去:0007194 腺苷酸环化酶活性的阴性调节 塔斯 9457173
去:0008344 成人运动行为 IEA -
去:0006874 细胞钙离子稳态 我知道了 7921596
GO:0014075 对胺刺激的反应 艾达 16839358
GO:0042596 恐惧反应 IEA -
GO:0048148 对可卡因的行为反应 IEA -
GO:0050709 蛋白质分泌的阴性调节 艾达 16839358
GO:0051927 通过电压门控钙通道对钙离子转运的负调控 艾达 7921596
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016020 nas 8746407
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 塔斯 1319557
去:0005887 质膜的积分 塔斯 1319557

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的甲基化 56 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller AML融合DN的共同靶标 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇4的时间反应4 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因