基因页：RCAN1
概括？
| 基因 | 1827年 |
| 象征 | RCAN1 |
| 同义词 | ADAPT78 | CSP1 | DSC1 | DSCR1 | MCIP1 | RCN1 |
| 描述 | 钙调蛋白1的调节剂1 |
| 参考 | MIM：602917|HGNC：HGNC：3040|Ensembl：ENSG00000159200|HPRD：04226|Vega：Otthumg00000086235 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 21q22.12 |
| Pascal P值 | 0.099 |
| Sherlock P值 | 0.655 |
| 胎儿β | 0.963 |
| 主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AP000926.2 | 0.80 | 0.75 |
| PTPRO | 0.77 | 0.73 |
| arl8a | 0.77 | 0.77 |
| MMP24 | 0.77 | 0.73 |
| WWP2 | 0.77 | 0.77 |
| DPYSL2 | 0.76 | 0.77 |
| C6orf134 | 0.76 | 0.73 |
| CRMP1 | 0.76 | 0.70 |
| COTL1 | 0.76 | 0.75 |
| SMAP1 | 0.76 | 0.71 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.61 | -0.65 |
| AF347015.31 | -0.61 | -0.71 |
| AF347015.27 | -0.59 | -0.69 |
| MT-CO2 | -0.59 | -0.70 |
| ifi27 | -0.57 | -0.66 |
| AF347015.33 | -0.55 | -0.65 |
| AIFM3 | -0.55 | -0.58 |
| FXYD1 | -0.55 | -0.64 |
| AF347015.21 | -0.55 | -0.72 |
| CA4 | -0.54 | -0.59 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 8595418 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15935327 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007417 | 中枢神经系统发展 | 塔斯 | 大脑（GO期限：6） | 8595418 |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 8595418 | |
| 去：0008015 | 血液循环 | 塔斯 | 8595418 | |
| GO：0019722 | 钙介导的信号传导 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | 塔斯 | 8595418 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID NFAT 3 Pathway | 54 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TCR钙途径 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid his hey pathway | 48 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房导管癌与小叶正常DN | 69 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gargalovic对氧化磷脂的反应绿色 | 23 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色 | 136 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲基化调节的米西亚利亚 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 瓦特自动甲状腺腺瘤DN | 55 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 156 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEI mir34a目标 | 148 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿米特血清反应60 mcf10a | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedvat Elf4靶向 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ABE VEGFA目标2小时 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ABE VEGFA目标 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ABE VEGFA目标30分钟 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bernard PPAPDC1B目标DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞DN | 216 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bredemeyer抹布发信号不是通过ATM提高 | 62 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Thum mir21靶向心脏病 | 17 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee早期T淋巴细胞向上 | 107 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Uzonyi对白三烯和凝血酶的反应 | 37 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应6小时DN | 91 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IRS1和IRS2的GUO目标 | 98 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Guillaumond KLF10靶向DN | 30 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Altemeier对LPS具有机械通气的反应 | 128 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 1167 | 1173 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-544 | 109 | 115 | 1a | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |