基因页:AGT
概括?
GeneID | 183 |
Symbol | AGT |
同义词 | ANHU|SERPINA8 |
描述 | angiotensinogen |
参考 | MIM:106150|HGNC:HGNC:333|Ensembl:ENSG00000135744|HPRD:00106|Vega:Otthumg0000000037757 |
Gene type | protein-coding |
地图位置 | 1q42.2 |
Fetal beta | -2.857 |
eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 Cerebellum Cortex Nucleus accumbens basal ganglia 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
Gene set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias | Click to show details |
GO_Annotation | Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations | Hits with neuro-related keywords: 4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs1538974 | chr1 | 231828595 | AGT | 183 | 0.17 | cis | ||
RS11583715 | chr1 | 231829038 | AGT | 183 | 0.17 | cis | ||
rs16938766 | chr8 | 74949940 | AGT | 183 | 0.19 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AGT_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
大脑区域没有共表达基因
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0005179 | hormone activity | IC | 1378723 | |
GO:0005179 | hormone activity | ISS | - | |
去:0004867 | serine-type endopeptidase inhibitor activity | 塔斯 | 3397061 | |
去:0008083 | growth factor activity | 塔斯 | 10406457 | |
GO:0031702 | type 1 angiotensin receptor binding | IEA | - | |
GO:0031703 | type 2 angiotensin receptor binding | IEA | - | |
Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
去:0008065 | establishment of blood-nerve barrier | IEA | Brain (GO term level: 7) | - |
GO:0002035 | brain renin-angiotensin system | IEA | Brain (GO term level: 12) | - |
GO:0048143 | 星形胶质细胞激活 | IEA | astrocyte (GO term level: 11) | - |
GO:0043524 | 神经元细胞凋亡的阴性调节 | IEA | neuron (GO term level: 9) | - |
去:0001568 | 血管发育 | IEA | - | |
去:0001558 | regulation of cell growth | NAS | 17159080 | |
去:0001543 | ovarian follicle rupture | IEA | - | |
去:0001658 | ureteric bud branching | IEA | - | |
去:0001998 | angiotensin mediated vasoconstriction involved in regulation of systemic arterial blood pressure | IEA | - | |
去:0001999 | renal response to blood flow during renin-angiotensin regulation of systemic arterial blood pressure | IEA | - | |
GO:0002018 | renin-angiotensin regulation of aldosterone production | IEA | - | |
GO:0002019 | regulation of renal output by angiotensin | IEA | - | |
GO:0003078 | regulation of natriuresis | NAS | 17159080 | |
GO:0001822 | kidney development | IEA | - | |
去:0001974 | blood vessel remodeling | 塔斯 | 10406457 | |
去:0001819 | positive regulation of cytokine production | 塔斯 | 17906677 | |
GO:0007200 | G-protein signaling, coupled to IP3 second messenger (phospholipase C activating) | NAS | 17159080 | |
去:0007160 | 细胞 - 矩阵粘附 | IEA | - | |
去:0007199 | G-protein signaling, coupled to cGMP nucleotide second messenger | 塔斯 | 17159080 | |
GO:0007267 | cell-cell signaling | 塔斯 | 8513325 | |
GO:0007263 | nitric oxide mediated signal transduction | 塔斯 | 17159080 | |
去:0010595 | positive regulation of endothelial cell migration | 艾达 | 15652490 | |
去:0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | IEA | - | |
GO:0009409 | response to cold | IEA | - | |
GO:0010613 | 心肌肥大的阳性调节 | ISS | - | |
去:0006800 | 氧和活性氧代谢过程 | 塔斯 | 17159080|17906677 | |
GO:0014068 | positive regulation of phosphoinositide 3-kinase cascade | 艾达 | 15652490 | |
去:0043065 | positive regulation of apoptosis | 艾达 | 10406457 | |
GO:0051092 | positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity | 塔斯 | 17906677 | |
GO:0014873 | response to muscle activity involved in regulation of muscle adaptation | ISS | - | |
GO:0030432 | 蠕动 | IEA | - | |
GO:0042445 | hormone metabolic process | IEA | - | |
GO:0042756 | drinking behavior | IEA | - | |
GO:0040018 | 多细胞生物生长的阳性调节 | IEA | - | |
GO:0019229 | regulation of vasoconstriction | NAS | 17159080 | |
GO:0033864 | NAD(P)H氧化酶活性的阳性调节 | 塔斯 | 17159080 | |
GO:0051145 | 平滑肌细胞分化 | IEA | - | |
GO:0043410 | positive regulation of MAPKKK cascade | IEA | - | |
去:0030198 | 细胞外基质组织 | IEA | - | |
GO:0045742 | positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway | 艾达 | 15652490 | |
GO:0045723 | 脂肪酸生物合成过程的阳性调节 | IEA | - | |
GO:0048146 | 成纤维细胞增殖的阳性调节 | ISS | - | |
GO:0050729 | positive regulation of inflammatory response | 塔斯 | 17159080|17906677 | |
去:0050731 | 肽基 - 酪氨酸磷酸化的阳性调节 | 艾达 | 15652490 | |
GO:0046622 | positive regulation of organ growth | IEA | - | |
GO:0048659 | 平滑肌细胞增殖 | IEA | - | |
GO:0051387 | negative regulation of nerve growth factor receptor signaling pathway | 艾达 | 10406457 | |
细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0005576 | extracellular region | NAS | 14718574 | |
GO:0005615 | extracellular space | IEA | - | |
GO:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 6089875 | |
GO:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG RENIN ANGIOTENSIN SYSTEM | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta AT1R途径 | 36 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA ACE2 PATHWAY | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA BIOPEPTIDES PATHWAY | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NFAT途径 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA CARDIACEGF PATHWAY | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PRL SIGNALING EVENTS PATHWAY | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AP1途径 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PPARA ACTIVATES GENE EXPRESSION | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME G ALPHA Q SIGNALLING EVENTS | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GPCR LIGAND BINDING | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME FATTY ACID TRIACYLGLYCEROL AND KETONE BODY METABOLISM | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HERNANDEZ MITOTIC ARREST BY DOCETAXEL 1 UP | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP | 81 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DAUER STAT3 TARGETS UP | 49 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN | 51 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zeilstra CD44靶向 | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STOSSI RESPONSE TO ESTRADIOL | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NADLER OBESITY DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RADMACHER AML PROGNOSIS | 78 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
URS ADIPOCYTE DIFFERENTIATION UP | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARCHINI TRABECTEDIN RESISTANCE UP | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF DN的反应 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BURTON ADIPOGENESIS 5 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LU AGING BRAIN UP | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期24小时 | 43 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE AGING CEREBELLUM UP | 84 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI ADIPOGENESIS BY ACTIVATED PPARG | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERHOLD ADIPOGENESIS UP | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEIN MIDBRAIN MARKERS | 82 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ACEVEDO LIVER CANCER DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHRAETS MLL TARGETS DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CAIRO LIVER DEVELOPMENT DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NAKAYAMA SOFT TISSUE TUMORS PCA2 DN | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MIKKELSEN NPC LCP WITH H3K4ME3 | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERHOLD RESPONSE TO TZD DN | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VERNOCHET ADIPOGENESIS | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WANG MLL TARGETS | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM REGULATORS | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |