概括?
GeneID 183
Symbol AGT
同义词 ANHU|SERPINA8
描述 angiotensinogen
参考 MIM:106150|HGNC:HGNC:333|Ensembl:ENSG00000135744|HPRD:00106|Vega:Otthumg0000000037757
Gene type protein-coding
地图位置 1q42.2
Fetal beta -2.857
eGene 尾状基底神经节
小脑半球
Cerebellum
Cortex
Nucleus accumbens basal ganglia
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias Click to show details
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 4

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs1538974 chr1 231828595 AGT 183 0.17 cis
RS11583715 chr1 231829038 AGT 183 0.17 cis
rs16938766 chr8 74949940 AGT 183 0.19 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005179 hormone activity IC 1378723
GO:0005179 hormone activity ISS -
去:0004867 serine-type endopeptidase inhibitor activity 塔斯 3397061
去:0008083 growth factor activity 塔斯 10406457
GO:0031702 type 1 angiotensin receptor binding IEA -
GO:0031703 type 2 angiotensin receptor binding IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0008065 establishment of blood-nerve barrier IEA Brain (GO term level: 7) -
GO:0002035 brain renin-angiotensin system IEA Brain (GO term level: 12) -
GO:0048143 星形胶质细胞激活 IEA astrocyte (GO term level: 11) -
GO:0043524 神经元细胞凋亡的阴性调节 IEA neuron (GO term level: 9) -
去:0001568 血管发育 IEA -
去:0001558 regulation of cell growth NAS 17159080
去:0001543 ovarian follicle rupture IEA -
去:0001658 ureteric bud branching IEA -
去:0001998 angiotensin mediated vasoconstriction involved in regulation of systemic arterial blood pressure IEA -
去:0001999 renal response to blood flow during renin-angiotensin regulation of systemic arterial blood pressure IEA -
GO:0002018 renin-angiotensin regulation of aldosterone production IEA -
GO:0002019 regulation of renal output by angiotensin IEA -
GO:0003078 regulation of natriuresis NAS 17159080
GO:0001822 kidney development IEA -
去:0001974 blood vessel remodeling 塔斯 10406457
去:0001819 positive regulation of cytokine production 塔斯 17906677
GO:0007200 G-protein signaling, coupled to IP3 second messenger (phospholipase C activating) NAS 17159080
去:0007160 细胞 - 矩阵粘附 IEA -
去:0007199 G-protein signaling, coupled to cGMP nucleotide second messenger 塔斯 17159080
GO:0007267 cell-cell signaling 塔斯 8513325
GO:0007263 nitric oxide mediated signal transduction 塔斯 17159080
去:0010595 positive regulation of endothelial cell migration 艾达 15652490
去:0008285 细胞增殖的阴性调节 IEA -
GO:0009409 response to cold IEA -
GO:0010613 心肌肥大的阳性调节 ISS -
去:0006800 氧和活性氧代谢过程 塔斯 17159080|17906677
GO:0014068 positive regulation of phosphoinositide 3-kinase cascade 艾达 15652490
去:0043065 positive regulation of apoptosis 艾达 10406457
GO:0051092 positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity 塔斯 17906677
GO:0014873 response to muscle activity involved in regulation of muscle adaptation ISS -
GO:0030432 蠕动 IEA -
GO:0042445 hormone metabolic process IEA -
GO:0042756 drinking behavior IEA -
GO:0040018 多细胞生物生长的阳性调节 IEA -
GO:0019229 regulation of vasoconstriction NAS 17159080
GO:0033864 NAD(P)H氧化酶活性的阳性调节 塔斯 17159080
GO:0051145 平滑肌细胞分化 IEA -
GO:0043410 positive regulation of MAPKKK cascade IEA -
去:0030198 细胞外基质组织 IEA -
GO:0045742 positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway 艾达 15652490
GO:0045723 脂肪酸生物合成过程的阳性调节 IEA -
GO:0048146 成纤维细胞增殖的阳性调节 ISS -
GO:0050729 positive regulation of inflammatory response 塔斯 17159080|17906677
去:0050731 肽基 - 酪氨酸磷酸化的阳性调节 艾达 15652490
GO:0046622 positive regulation of organ growth IEA -
GO:0048659 平滑肌细胞增殖 IEA -
GO:0051387 negative regulation of nerve growth factor receptor signaling pathway 艾达 10406457
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region NAS 14718574
GO:0005615 extracellular space IEA -
GO:0005625 可溶性部分 塔斯 6089875
GO:0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG RENIN ANGIOTENSIN SYSTEM 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AT1R途径 36 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ACE2 PATHWAY 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BIOPEPTIDES PATHWAY 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NFAT途径 56 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CARDIACEGF PATHWAY 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PRL SIGNALING EVENTS PATHWAY 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1途径 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PPARA ACTIVATES GENE EXPRESSION 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Q SIGNALLING EVENTS 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPCR LIGAND BINDING 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME FATTY ACID TRIACYLGLYCEROL AND KETONE BODY METABOLISM 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ MITOTIC ARREST BY DOCETAXEL 1 UP 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAUER STAT3 TARGETS UP 49 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN 51 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zeilstra CD44靶向 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STOSSI RESPONSE TO ESTRADIOL 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NADLER OBESITY DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RADMACHER AML PROGNOSIS 78 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS ADIPOCYTE DIFFERENTIATION UP 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARCHINI TRABECTEDIN RESISTANCE UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期24小时 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING CEREBELLUM UP 84 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI ADIPOGENESIS BY ACTIVATED PPARG 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS UP 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN MIDBRAIN MARKERS 82 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHRAETS MLL TARGETS DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO LIVER DEVELOPMENT DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAYAMA SOFT TISSUE TUMORS PCA2 DN 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN NPC LCP WITH H3K4ME3 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD RESPONSE TO TZD DN 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERNOCHET ADIPOGENESIS 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG MLL TARGETS 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM REGULATORS 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因