SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	1832年
Symbol	DSP
同义词	DCWHKTA \| DP
描述	desmoplakin
参考	MIM:125647\|HGNC：HGNC：3052\|Ensembl:ENSG00000096696\|HPRD：00513\|Vega：Otthumg0000000014212
基因type	protein-coding
地图位置	6p24
Pascal P值	0.788
Fetal beta	0.343
DMG	1（＃研究）
eGene	Meta
支持	G2CDB.Humanarc G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG:Jaffe_2016	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05.	1
PMID:cooccur	高通量文献搜索	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
GSMA_I	基因组扫描荟萃分析	Psr: 0.0159
文学	高通量文献搜索	Co-occurancewith Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias	Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

Differentially methylated gene

探测	Chromosome	Position	Nearest gene	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
CG21068339	6	7542819	DSP	3.77E-10	-0.011	7.51E-7	DMG:Jaffe_2016

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
PEF1	0.80	0.81
Stoml1	0.77	0.81
ABHD14A	0.77	0.80
SH3GLB2	0.76	0.83
ABHD8	0.76	0.79
MTCH1	0.76	0.81
rpusd3	0.76	0.79
C6orf154	0.75	0.79
DNAJC30	0.75	0.78
SH3BP1	0.75	0.80

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
NSBP1	-0.52	-0.59
EIF5B	-0.51	-0.56
AF347015.18	-0.43	-0.34
ANP32B	-0.42	-0.49
RAB13	-0.41	-0.49
AC010300.1	-0.41	-0.48
AC005921.3	-0.39	-0.55
GPR125	-0.38	-0.36
CWF19L2	-0.38	-0.43
ANP32C	-0.37	-0.39

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0005200	structural constituent of cytoskeleton	塔斯		9887343
GO:0030674	protein binding, bridging	艾达		10908733
Biological process	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0008544	表皮发展	塔斯		9887343
GO:0018149	肽交联	艾达		10908733
GO:0030216	角质形成细胞分化	艾达		10908733
细胞分量	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0001533	蜂蜜的信封	艾达		10908733
GO:0005737	细胞质	IEA		-
GO：0030054	细胞连接	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
Arid3a	BRIGHT \| DRIL1 \| DRIL3 \| E2FBP1	在丰富的交互式域3a（明亮）	-	HPRD	9780002
CASP10	Alps2 \|flice2 \|MCH4	caspase 10, apoptosis-related cysteine peptidase	-	HPRD	15500642
CASP2	CASP-2 \| ICH-1L \| ICH-1L/1S \| ICH1 \| NEDD2	caspase 2, apoptosis-related cysteine peptidase	-	HPRD	15500642
CASP4	ICE(rel)II \| ICEREL-II \| ICH-2 \| Mih1/TX \| TX	caspase 4, apoptosis-related cysteine peptidase	-	HPRD	15500642
CASP6	MCH2	caspase 6, apoptosis-related cysteine peptidase	-	HPRD	15500642
CASP7	CMH-1 \|ICE-LAP3 \|MCH3	caspase 7，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶	-	HPRD	15500642
CASP9	APAF-3 \|apaf3 \|caspase-9c \|ICE-LAP6 \|MCH6	caspase 9，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶	-	HPRD	15500642
CDH5	7B4 \|CD144 \|FLJ17376	钙粘蛋白5，2型（血管内皮）	-	HPRD，Biogrid	9739078
CSTA	STF1 \|STFA	cystatin A (stefin A)	Reconstituted Complex	BioGRID	8999895
des	cmd1i \|CSM1 \|CSM2 \|FLJ12025 \|FLJ39719 \|FLJ41013 \|FLJ41793	desmin	-	HPRD，Biogrid	9261168
DSC1	CDHF1 \| DG2/DG3	desmocollin 1	-	HPRD，Biogrid	9606214
DSP	DPI \| DPII	desmoplakin	-	HPRD，Biogrid	12101406
EVPL	EVPK	环境	-	HPRD	8999895
IKBKE	IKK-i \| IKKE \| IKKI \| KIAA0151 \| MGC125294 \| MGC125295 \| MGC125297	inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase epsilon	-	HPRD	14743216
IVL	-	依赖蛋白	Reconstituted Complex	BioGRID	8999895
JUP	ARVD12 \|ctnng \|dp3 \|dpiii \|PDGB \|PKGB	junction plakoglobin	-	HPRD，Biogrid	9348293
JUP	ARVD12 \|ctnng \|dp3 \|dpiii \|PDGB \|PKGB	junction plakoglobin	Plakoglobin interacts with desmoplakin.	BIND	12426320
KRT1	CK1 \| EHK1 \| K1 \| KRT1A	keratin 1	-	HPRD，Biogrid	9261168
NFKB1	DKFZp686C01211 \| EBP-1 \| KBF1 \| MGC54151 \| NF-kappa-B \| NFKB-p105 \| NFKB-p50 \| p105	nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1	-	HPRD	14743216
NFKB2	LYT-10 \| LYT10	nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100)	-	HPRD	14743216
nfkbib	ikbb \|Trip9	nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, beta	-	HPRD	14743216
PECAM1	CD31 \|PECAM-1	platelet/endothelial cell adhesion molecule	-	HPRD，Biogrid	10801826
PKP1	B6P \| MGC138829	plakophilin 1 (ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome)	-	HPRD，Biogrid	10852826
PKP2	ARVD9	plakophilin 2	-	HPRD，Biogrid	11790773
PKP3	-	plakophilin 3	PKP3 interacts with DSP(DP)	BIND	12707304
PKP3	-	plakophilin 3	两个杂交	BioGRID	12707304
PKP4	FLJ31261 \| FLJ42243 \| p0071	plakophilin 4	p0071 interacts with desmoplakin.	BIND	12426320
PKP4	FLJ31261 \| FLJ42243 \| p0071	plakophilin 4	两个杂交	BioGRID	12615965
relb	i-Rel \|艾尔	v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog B	-	HPRD	14743216
STK24	MST-3 \| MST3 \| MST3B \| STE20 \| STK3	丝氨酸/苏氨酸激酶24（Ste20同源物，酵母）	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
vim	FLJ36605	vimentin	-	HPRD，Biogrid	9261168

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG ARRHYTHMOGENIC RIGHT VENTRICULAR CARDIOMYOPATHY ARVC	76	59	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AJDISS 2PATHWAY	48	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APOPTOTIC CLEAVAGE OF CELLULAR PROTEINS	40	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
细胞粘附蛋白的反应组凋亡裂解	12	6	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡	148	94	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APOPTOTIC EXECUTION PHASE	54	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应	241	146	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗伊伤口血管DN	22	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAEGER METASTASIS DN	258	141	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE NEURAL CREST STEM CELL DN	118	79	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS UP	214	134	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP	443	294	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP	214	144	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK	271	175	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN	79	54	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIDORIKAWA AMPLIFIED IN LIVER CANCER	55	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIGNER ZEB1目标	35	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增	178	108	该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌	747	453	该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良	382	224	该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段	283	177	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS	1062	725	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES	648	385	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN	464	276	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN	546	351	该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分	475	313	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP	131	87	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤	412	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOREAUX B LYMPHOCYTE MATURATION BY TACI UP	92	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova Prox1靶向	28	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION	405	264	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN	830	547	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN	65	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MURAKAMI UV RESPONSE 6HR UP	37	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia延迟对TGFB1的响应	39	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIBA RESPONSE TO TSA DN	23	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MURAKAMI UV RESPONSE 24HR	20	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR DN	160	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向	566	371	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1	528	324	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P2	79	55	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN	220	147	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN	154	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN	249	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP	425	298	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C D DN	252	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6	456	285	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 6	75	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C6的反应	5	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 30MIN DN	150	99	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE M G1	148	95	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP	430	288	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN	315	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标	745	475	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3	824	528	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS UP	169	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：DSP