基因页：SLC26A2

Summary？
基因 1836年
象征 SLC26A2
同义词 D5S1708 | DTD | DTDST | EDM4 | MST153 | MSTP157
描述 solute carrier family 26 member 2
参考 MIM：606718|HGNC：HGNC：10994|ENSEMBL：ENSG00000155850|HPRD：05990|Vega:OTTHUMG00000130054
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q32
Pascal P值 0.244
胎儿beta 0.902
DMG 1(# studies)
耶和华 Myers' cis & trans

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136例对照。 1
GSMA_I Genome scan meta-analysis PSR：0.0032
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） Psr: 0.00459
GSMA_IIE Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) PSR：0.01718

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG20540378 5 149340137 SLC26A2 1.5e-8 -0.007 5.7E-6 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6874540 CHR5 149911669 SLC26A2 1836年 0.13 顺式
RS2273232 CHR5 149912526 SLC26A2 1836年 0.13 顺式
RS17131472 CHR1 91962966 SLC26A2 1836年 0.01 反式
RS1473237 CHR1 191045246 SLC26A2 1836年 0.11 反式
RS2115055 CHR2 119478688 SLC26A2 1836年 0.09 反式
RS2922180 CHR3 125280472 SLC26A2 1836年 7.742e-5 反式
RS2976809 CHR3 125451738 SLC26A2 1836年 3.095E-4 反式
RS16889842 CHR4 9872012 SLC26A2 1836年 0.02 反式
SNP_A-1976228 0 SLC26A2 1836年 0.08 反式
RS2732167 CHR4 88706292 SLC26A2 1836年 0.03 反式
rs313946 CHR4 113975904 SLC26A2 1836年 0 反式
RS10050805 CHR5 30805352 SLC26A2 1836年 0.05 反式
rs17056435 CHR5 158453782 SLC26A2 1836年 0 反式
RS17135501 CHR6 2704474 SLC26A2 1836年 0.01 反式
RS17135521 CHR6 2707631 SLC26A2 1836年 0.01 反式
SNP_A-1787926 0 SLC26A2 1836年 0.01 反式
RS6455226 CHR6 67930295 SLC26A2 1836年 0.05 反式
RS8192621 CHR6 132966206 SLC26A2 1836年 0.03 反式
rs17065063 CHR6 136207301 SLC26A2 1836年 0.17 反式
RS2398707 CHR7 2113428 SLC26A2 1836年 0.16 反式
rs3778951 CHR7 2125319 SLC26A2 1836年 0.16 反式
rs3778957 CHR7 2127710 SLC26A2 1836年 0.16 反式
RS17156987 CHR7 28704217 SLC26A2 1836年 0.2 反式
RS2286089 CHR7 38789903 SLC26A2 1836年 0.09 反式
RS2430483 CHR7 104548631 SLC26A2 1836年 0.03 反式
rs888577 CHR8 239323 SLC26A2 1836年 0.17 反式
RS2515434 CHR8 6374892 SLC26A2 1836年 0.05 反式
RS2442623 CHR8 6376337 SLC26A2 1836年 0.05 反式
RS2515437 CHR8 6377140 SLC26A2 1836年 0.05 反式
rs1960369 CHR8 6379235 SLC26A2 1836年 0.01 反式
RS2515463 CHR8 6384137 SLC26A2 1836年 0.12 反式
RS2919377 CHR8 32573740 SLC26A2 1836年 0.11 反式
rs2253777 CHR9 93467893 SLC26A2 1836年 0.12 反式
RS6478086 CHR9 117273020 SLC26A2 1836年 0.03 反式
RS998410 CHR9 117622673 SLC26A2 1836年 1.521E-5 反式
RS9423711 CHR10 2574802 SLC26A2 1836年 0.17 反式
RS4514358 CHR10 43861923 SLC26A2 1836年 0.04 反式
RS2116478 CHR11 83362424 SLC26A2 1836年 0.05 反式
RS2098090 CHR12 4770747 SLC26A2 1836年 0.09 反式
RS10747972 0 SLC26A2 1836年 0.02 反式
RS995817 CHR12 67557935 SLC26A2 1836年 0 反式
RS11112163 CHR12 105072508 SLC26A2 1836年 0.02 反式
rs9551590 CHR13 29589464 SLC26A2 1836年 0.01 反式
RS9529974 CHR13 72821935 SLC26A2 1836年 0.05 反式
RS11840833 CHR13 94378306 SLC26A2 1836年 0.01 反式
RS17381373 CHR13 109002943 SLC26A2 1836年 0.18 反式
RS10142086 CHR14 35135892 SLC26A2 1836年 0.08 反式
RS1956517 CHR14 37738426 SLC26A2 1836年 0.1 反式
RS10498433 CHR14 52289530 SLC26A2 1836年 0 反式
RS2093759 CHR14 97171024 SLC26A2 1836年 0.09 反式
rs17244419 CHR14 97171074 SLC26A2 1836年 0 反式
RS16976022 CHR15 55454260 SLC26A2 1836年 0.2 反式
RS16976029 CHR15 55455268 SLC26A2 1836年 0.13 反式
RS16977927 CHR17 72154232 SLC26A2 1836年 0.06 反式
RS16940550 CHR18 13442256 SLC26A2 1836年 0.07 反式
RS11873703 CHR18 61448702 SLC26A2 1836年 0 反式
RS9951107 CHR18 74437994 SLC26A2 1836年 0.07 反式
RS1075540 CHR22 25254707 SLC26A2 1836年 0.09 反式
RS6000401 CHR22 37149335 SLC26A2 1836年 0.14 反式
RS5991662 Chrx 43335796 SLC26A2 1836年 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC024909.1 0.98 0.98
CACNB2 0.85 0.86
CNNM1 0.84 0.83
prrt3 0.83 0.85
SLC35F3 0.83 0.84
KCNS2 0.83 0.83
CX3CL1 0.82 0.84
GPR61 0.82 0.85
Egr2 0.82 0.79
纳尔克 0.81 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RBMX2 -0.43 -0.51
SNHG12 -0.42 -0.52
GTF3C6 -0.42 -0.42
exosc8 -0.41 -0.40
RPL38 -0.41 -0.56
RPL37 -0.41 -0.58
RPS20 -0.41 -0.52
RPL23A -0.41 -0.49
RPS13P2 -0.40 -0.43
RPS27A -0.40 -0.49

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0005215 转运蛋白活性 IEA -
去：0008271 secondary active sulfate transmembrane transporter activity IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0008272 硫酸盐转运 TAS 7923357
GO:0006810 运输 IEA -
细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0005624 膜分数 TAS 8528239
去：0016020 membrane IEA -
去：0005887 integral to plasma membrane TAS 8528239

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃SZGR 2.0途径中的基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome SLC介导的跨膜转运 241 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
渡边结肠癌MSI与MSS DN 81 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王攀登目标 269 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌UP 404 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
剑麻结直肠腺瘤DN 291 176 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向DN 459 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4 Fusion靶向G 238 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王食道癌与正常DN 101 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PATIL LIVER CANCER 747 453 All SZGR 2.0 genes in this pathway
威廉姆斯ESR1瞄准 26 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿米特血清反应480 MCF10A 39 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cervera SDHB目标2 114 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHEOK RESPONSE TO MERCAPTOPURINE UP 13 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NELSON RESPONSE TO ANDROGEN UP 86 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Traynor Rett综合DN 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nielsen Schwannoma Up 18 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Xu GH1自分泌目标 268 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 4 307 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE DN 258 160 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh对雌二醇的反应 61 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fujii YBX1靶向DN 202 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR UP 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础 648 398 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN 58 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G23 UP 52 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝母细胞瘤 207 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng对H2O2的响应通过ERCC6 UP 40 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stambolsky对维生素D3的反应 84 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gabriely miR21靶标 289 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS UP 259 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway