基因页：DTNA

概括？
基因 1837年
象征 DTNA
同义词 D18S892E | DRP3 | DTN | DTN-A | LVNC1
描述 Dystrobrevin Alpha
参考 MIM：601239|HGNC：HGNC：3057|ENSEMBL：ENSG00000134769|HPRD：03141|Vega：Otthumg00000132309
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q12
Pascal P值 0.033
Sherlock P值 0.951
胎儿β -1.909
主持人 小脑半球
元
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.4164

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HRH2 0.87 0.89
PITPNM2 0.87 0.87
Rhobtb2 0.87 0.86
PIP5K1C 0.86 0.86
OSBP2 0.86 0.88
mgat5b 0.86 0.87
ABR 0.86 0.87
bai2 0.86 0.87
ZDHHC8 0.86 0.85
BAIAP2 0.85 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DBI -0.51 -0.57
AF347015.21 -0.50 -0.43
peci -0.50 -0.54
NSBP1 -0.50 -0.54
GNG11 -0.50 -0.52
Rab13 -0.49 -0.57
AP002478.3 -0.48 -0.49
myl12a -0.48 -0.54
AL139819.3 -0.47 -0.49
C1orf54 -0.47 -0.49

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 11353857
去：0008270 锌离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007274 神经肌肉突触传播 塔斯 神经元，突触（GO期限：7） 9119373
去：0007165 信号转导 塔斯 10767327
去：0006941 条纹肌肉收缩 塔斯 10767327
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0045202 突触 IEA 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） -
去：0005737 细胞质 IEA -
GO：0030054 细胞连接 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
DMD BMD |CMD3B |DXS142 |DXS164 |DXS206 |DXS230 |DXS239 |DXS268 |DXS269 |DXS270 | DXS272 肌营养不良 - HPRD，Biogrid 9356463
DRP2 MGC133255 肌营养不良蛋白相关蛋白2 - HPRD，Biogrid 10767429
DTNBP1 dbnd |DKFZP564K192 |FLJ30031 |HPS7 |MGC20210 |MY031 |Sdy Dystrobrevin结合蛋白1 - HPRD 11316798
KCNJ12 FLJ14167 |irk2 |kcnjn1 |Kir2.2 |Kir2.2V |Hirk |hirk1 |HKIR2.2X |kcnj12x 钾内切割通道，亚家族J，成员12 - HPRD，Biogrid 15024025
SNTA1 SNT1 |tacip1 |DJ1187J4.5 Syntrophin，Alpha 1（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，酸性成分） - HPRD 12206805
SNTA1 SNT1 |tacip1 |DJ1187J4.5 Syntrophin，Alpha 1（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，酸性成分） - HPRD 11069112|12206805 | 12206805
SNTB1 59-DAP |A1b |bsyn2 |DAPA1B |FLJ22442 |MGC111389 |SNT2 |SNT2B1 |提示43 Syntrophin，β1（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，碱性成分1） - HPRD 10545507
SNTB1 59-DAP |A1b |bsyn2 |DAPA1B |FLJ22442 |MGC111389 |SNT2 |SNT2B1 |提示43 Syntrophin，β1（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，碱性成分1） - HPRD 7844150|10545507
|11069112 | 10545507
SNTB2 D16S2531E |EST25263 |SNT2B2 |SNT3 |SNTL Syntrophin，β2（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，碱性成分2） - HPRD 12206805
SNTG1 g1syn |SYN4 Syntrophin，伽马1 - HPRD 10747910
SNTG2 g2syn |MGC133174 |SYN5 Syntrophin，伽马2 - HPRD 10747910
src ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） - HPRD 9701558
同步 MGC149625 |MGC149626 |Sync1 |Syncoilin Syncoilin，中间丝蛋白 - HPRD 11053421
synm DMN |KIAA0353 |syn 同步，中间丝蛋白 - HPRD，Biogrid 11353857
Utrn DMDL |DRP |DRP1 |FLJ23678 乌托芬 - HPRD，Biogrid 9701558|12034776
Utrn DMDL |DRP |DRP1 |FLJ23678 乌托芬 - HPRD 9701558|10767429
|12034776


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型Bii淋巴细胞UP 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MS 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APC和MBD2 DN的Phesse目标 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标 116 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 1146 1152 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1146 1152 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 887 893 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-135 772 778 1a HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-140 931 938 1A，M8 HSA-MIR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-143 2149 2155 M8 HSA-MIR-143脑 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-146 2086 2093 1A，M8 HSA-MIR-146A ugagaacugaauuccaugggug
HSA-MIR-146B脑 ugagaacugaauuccauaggcu
mir-148/152 3149 3155 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-183 940 947 1A，M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-185 2675 2681 1a HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-19 2100 2107 1A，M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-22 213 219 1a HSA-MIR-22脑 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-24 3122 3128 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-27 887 894 1A，M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-299-5p 930 936 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-30-5p 439 445 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-320 1078 1085 1A，M8 HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-365 3317 3323 M8 HSA-MIR-365 uaaugccccuaaaaaauccuuau
mir-376c 3101 3107 1a HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-378 2917 2923 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-410 3577 3583 M8 HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-448 3115 3121 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-9 2065 2071 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga