基因页面:DTNB

总结吗?
GeneID 1838年
象征 DTNB
同义词 - - - - - -
描述 dystrobrevinβ
参考 MIM: 602415|HGNC: HGNC: 3058|运用:ENSG00000138101|HPRD: 09091|织女:OTTHUMG00000152129
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 2 p24
帕斯卡假定值 0.015
夏洛克假定值 0.337
胎儿β -1.237
DMG 2(#研究)

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 2
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 2
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.2064

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg17774001 2 25600752 DTNB 5.48的军医 0.588 0.049 DMG: Wockner_2014
cg17692591 2 25896739 DTNB 9.32 e-11 -0.01 4.49 e - DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
JPH4 0.91 0.92
DMWD 0.89 0.89
FBXO41 0.88 0.91
REXO1 0.87 0.89
C11orf81 0.87 0.88
JPH3 0.87 0.90
SEMA6B 0.86 0.88
MGAT5B 0.86 0.88
AGAP2 0.86 0.88
C19orf26 0.86 0.87
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.56 -0.47
AL139819.3 -0.55 -0.55
GNG11 -0.54 -0.53
AP002478.3 -0.53 -0.52
C1orf54 -0.51 -0.52
MT-CO2 -0.51 -0.43
AF347015.31 -0.50 -0.43
NOSTRIN -0.50 -0.45
AF347015.18 -0.48 -0.37
AF347015.8 -0.48 -0.40

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 助教 9395493
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0045202 突触 国际能源机构 Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
启动 KIAA1446 brain-enriched鸟苷kinase-associated同族体(老鼠) 2台混合动力 BioGRID 16189514
C1orf182 MGC26877 | rp11 - 443 g18.5 | SSTK-IP 染色体1 182年开放阅读框 2台混合动力 BioGRID 16189514
CCDC85B DIPA 卷曲螺旋域包含85 b 2台混合动力 BioGRID 16189514
DMD BMD | CMD3B | DXS142 | DXS164 | DXS206 | DXS230 | DXS239 | DXS268 | DXS269 | DXS270 | DXS272 肌营养不良蛋白 亲和力Capture-Western BioGRID 10545507
DTNBP1 DBND | DKFZp564K192 | FLJ30031 | HPS7 | MGC20210 | My031 | SDY dystrobrevin结合蛋白1 - - - - - - HPRD 11316798
HMG20A FLJ10739 | HMGX1 高机动组20 2台混合动力 BioGRID 16189514
KIF5A D12S1889 | MY050 | NKHC | SPG10 驱动蛋白家族成员5 - - - - - - HPRD, BioGRID 14600269
KIF5B 京族| KNS | KNS1 | UKHC 驱动蛋白家族成员5 b 重新组成复杂 BioGRID 14600269
NUP62 DKFZp547L134 | FLJ20822 | FLJ43869 | IBSN | MGC841 | SNDI | p62 nucleoporin 62 kda 2台混合动力 BioGRID 16189514
PPFIBP2 Cclp1 | DKFZp781K06126 | MGC42541 PTPRF相互作用蛋白结合蛋白2 (liprinβ2) 2台混合动力 BioGRID 16189514
PRTFDC1 FLJ11888 | HHGP phosphoribosyl转移酶域包含1 2台混合动力 BioGRID 16189514
SNTA1 SNT1 | TACIP1 | dJ1187J4.5 syntrophinα1 (dystrophin-associated蛋白A1, 59 kda,酸性组件) 亲和力Capture-Western BioGRID 10545507
SNTG1 G1SYN | SYN4 syntrophin,γ1 - - - - - - HPRD 10747910
SNTG2 G2SYN | MGC133174 | SYN5 syntrophinγ2 - - - - - - HPRD 10747910
TRAF2 德国:45012 |陷阱| TRAP3 TNF receptor-associated因子2 2台混合动力 BioGRID 16189514
UTRN DMDL | DRP | DRP1 | FLJ23678 拉到 - - - - - - HPRD 10545507


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
VECCHI胃癌早期DN 367年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应角化细胞 530年 342年 所有SZGR 2.0基因通路
HATADA甲基化在肺癌 390年 236年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼头部和颈部癌症D 37 14 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒16人力资源 225年 139年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染24小时血巨细胞病毒 148年 96年 所有SZGR 2.0基因通路
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN 181年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
乳腺癌萧述三腔的DN 564年 326年 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三乳腺癌等正常 476年 285年 所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存非最优减积 510年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
SHEDDEN肺癌生存A12好 317年 177年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 143 284年 290年 m8 hsa - mir - 143大脑 UGAGAUGAAGCACUGUAGCUCA