基因页：dusp3

Summary？
基因 1845年
象征 dusp3
Synonyms VHR
Description 双重特异性磷酸酶3
Reference MIM：600183|HGNC：HGNC：3069|ENSEMBL：ENSG00000108861|HPRD：02553|Vega：Otthumg00000180889
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q21
Pascal P值 0.442
Sherlock p-value 6.393E-4
胎儿β -1.705
主持人 Myers' cis & trans
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献：0.0357

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4450223 CHR12 46418660 dusp3 1845年 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MTA1 0.97 0.97
EHMT2 0.97 0.97
RBM10 0.97 0.97
U2AF2 0.97 0.97
DCAF15 0.96 0.96
CXXC1 0.96 0.95
WHSC2 0.96 0.96
daxx 0.96 0.94
ZNF777 0.95 0.96
xab2 0.95 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.78 -0.90
AF347015.27 -0.77 -0.89
MT-CO2 -0.77 -0.90
C5orf53 -0.76 -0.79
AF347015.33 -0.75 -0.87
mt-cyb -0.74 -0.87
S100B -0.73 -0.83
AF347015.8 -0.73 -0.88
FXYD1 -0.71 -0.82
COPZ2 -0.71 -0.79

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0004725 蛋白酪氨酸磷酸酶活性 经验 17322878
GO:0004725 蛋白酪氨酸磷酸酶活性 IEA -
GO:0004725 蛋白酪氨酸磷酸酶活性 TAS 1281549
GO：0016787 水解酶活性 IEA -
去：0016791 phosphatase activity IEA -
去：0008138 蛋白酪氨酸/丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006470 蛋白氨基酸去磷酸化 IEA -
去：0006470 蛋白氨基酸去磷酸化 TAS 1281549
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005654 核质 经验 17322878

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
kegg mapk信号通路 267 205 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NGF的Reactome信号传导 217 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome核事件激酶和转录因子激活 24 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Erk被灭活 12 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME ERK MAPK TARGETS 21 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TLR级联反应组MAP激酶激活 50 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME MAPK TARGETS NUCLEAR EVENTS MEDIATED BY MAP KINASES 30 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 77 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 72 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome先天免疫系统 279 178 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统 933 616 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome收费受体级联 118 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ONKEN UVEAL MELANOMA DN 526 357 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LMO4靶向DN 352 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WANG CLIM2 TARGETS DN 186 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 79 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向 457 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
环氧化物素的浓凋亡 239 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wong IFNA2电阻DN 34 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MOREAUX MULTIPLE MYELOMA BY TACI UP 412 249 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染20小时 240 152 All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LU AGING BRAIN DN 153 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2 DN 830 547 All SZGR 2.0 genes in this pathway
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NAKAMURA METASTASIS 47 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村转移模型 45 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN 57 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BEIER GLIOMA STEM CELL DN 66 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标36hr 221 150 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHANG TLX TARGETS 60HR UP 293 203 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标 108 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G3 UP 188 121 All SZGR 2.0 genes in this pathway
COULOUARN TEMPORAL TGFB1 SIGNATURE DN 138 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
萨森对促性腺营养蛋白的反应 91 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sasson对Forskolin的反应 90 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 3056 3062 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-141/200a 3434 3441 1A，M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
hsa-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu
miR-15/16/195/424/497 2110 2116 M8 HSA-MIR-15Abrain uagcagcacauaugguugug
hsa-miR-16brain UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
HSA-MIR-15Bbrain uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
hsa-miR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
miR-150 2476 2483 1A，M8 HSA-MIR-150 UCUCCCAACCCUUGUACCAGUG
miR-153 428 435 1A，M8 HSA-MIR-153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
miR-370 2999 3005 M8 HSA-MIR-370brain gccugggggguggaaccugg
miR-384 74 80 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-448 429 435 1a hsa-miR-448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU