基因页:DVL1
Summary?
基因ID | 1855年 |
Symbol | DVL1 |
同义词 | drs2 | dvl | dvl1l1 | dvl1p1 |
描述 | 衣衫段极性蛋白1 |
参考 | MIM:601365|HGNC:HGNC:3084|ENSEMBL:ENSG00000107404|HPRD:03220|Vega:Otthumg00000003069 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 136 |
Pascal P值 | 0.58 |
Sherlock P值 | 0.462 |
胎儿β | -0.39 |
支持 | CompositeSet |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.0047 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | Sift | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DVL1 | CHR1 | 1274965 | G | 一个 | NM_004421 NM_004421 |
。 p.351r> w |
拼接 错过 |
Schizophrenia | DNM:Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DVL1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004871 | 信号传感器活性 | IEA | - | |
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14750955 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016055 | Wnt受体信号通路 | IEA | - | |
去:0007242 | 细胞内信号传导级联 | IEA | - | |
去:0009653 | 解剖结构形态发生 | 塔斯 | 8817329 | |
去:0007507 | 心脏发展 | 塔斯 | 8817329 | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | cytoplasm | nas | - | |
去:0005737 | cytoplasm | 塔斯 | 9192851 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ARRB1 | ARB1 |arr1 | 逮捕,beta 1 | - | HPRD,Biogrid | 11742073 |
ATN1 | B37 |D12S755E |Drpla |点头 | 阿特罗蛋白1 | Two-hybrid | Biogrid | 10332026 |
axin1 | Axin |MGC52315 | 轴1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10428961 |
axin1 | Axin |MGC52315 | 轴1 | - | HPRD | 9482734|10330403 |
BRD7 | BP75 |Celtix1 |Nag4 | 含有7的溴结构域 | - | HPRD | 12941796 |
CSNK1D | HCKID | 酪蛋白激酶1,三角洲 | - | HPRD,Biogrid | 11818547 |
CSNK1E | HCKIE | MGC10398 | 酪蛋白激酶1,Epsilon | - | HPRD,Biogrid | 11487578|11818547 |
CSNK2A1 | CK2A1 |CKII | 酪蛋白激酶2,α1多肽 | - | HPRD,Biogrid | 10806215 |
CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA | - | HPRD,Biogrid | 10806215 |
CXXC4 | idax |MGC149872 | CXXC手指4 | - | HPRD | 11113207 |
daam1 | FLJ41657 |KIAA0666 | 变形相关的形态发生1 | - | HPRD | 11779461 |
DAB2 | Doc-2 |DOC2 |FLJ26626 | 残疾同源物2,有丝分裂原反应性磷蛋白(果蝇) | 重构的复合物 | Biogrid | 12805222 |
dixDC1 | CCD1 |KIAA1735 | 包含1的DIX域 | - | HPRD | 15262978 |
DVL1 | DVL |MGC54245 | Dish,DSH同源1(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 10330181 |
DVL3 | KIAA0208 | Dish,DSH同源3(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 10330181 |
EPS8 | - | 表皮生长因子受体途径底物8 | - | HPRD,Biogrid | 10581192 |
frat1 | FLJ97193 | 经常在高级T细胞淋巴瘤中重新排列 | - | HPRD,Biogrid | 10428961 |
GSK3B | - | 糖原合酶激酶3β | - | HPRD | 10428961 |
hecw1 | KIAA0322 |NEDL1 | HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 | - | HPRD,Biogrid | 14684739 |
Smad1 | BSP1 |JV4-1 |JV41 |madh1 |MADR1 | SMAD家庭成员1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12650946 |
Smad2 | JV18 |JV18-1 |madh2 |Madr2 |MGC22139 |MGC34440 |HMAD-2 |HSMAD2 | SMAD家庭成员2 | - | HPRD,Biogrid | 12650946 |
Smad3 | DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 | SMAD家庭成员3 | 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 12650946 |
Smad4 | DPC4 |jip |madh4 | SMAD家庭成员4 | 重构的复合物 | Biogrid | 12650946 |
Smad7 | CRCS3 |FLJ16482 |madh7 |madh8 | SMAD家庭成员7 | 重构的复合物 | Biogrid | 12650946 |
USP13 | ISOT3 |ISOT-3 | 泛素特异性肽酶13(异肽酶T-3) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
vangl1 | lpp2 |MGC5338 |stb2 |STBM2 | vang like 1(van Gogh,果蝇) | - | HPRD | 15456783 |
vangl2 | KIAA1215 | LPP1 | LTAP | MGC119403 | MGC119404 | STB1 | STBM | STBM1 | vang-like 2(van Gogh,果蝇) | - | HPRD | 12490194 |