基因页：DYRK1A

概括?
基因ID 1859年
Symbol DYRK1A
同义词 dyrk | dyrk1 | hp86 | mnb | mnbh | mrd7
描述 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A
参考 MIM：600855|HGNC:HGNC:3091|ENSEMBL：ENSG00000157540|HPRD：09018|Vega:OTTHUMG00000086657
基因type protein-coding
地图位置 21 q22.13
Pascal P值 0.049
Sherlock P值 0.001
Fetal beta 0.656

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
ANAPC1 0.83 0.87
TUBGCP4 0.83 0.86
ANKRD28 0.82 0.87
CEP68 0.82 0.87
阿达 0.82 0.87
myh10 0.82 0.84
SMG7 0.82 0.87
LIN54 0.82 0.85
VPS13B 0.82 0.84
KIAA0947 0.82 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
FXYD1 -0.66 -0.70
higd1b -0.65 -0.72
MT-CO2 -0.64 -0.70
AF347015.31 -0.64 -0.68
AF347015.21 -0.63 -0.73
TLCD1 -0.62 -0.66
AC021016.1 -0.62 -0.65
AF347015.33 -0.61 -0.64
IFI27 -0.61 -0.67
CST3 -0.61 -0.67

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 ISS -
去：0004715 non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity 艾达 9748265
GO:0016740 transferase activity IEA -
GO:0016301 kinase activity IEA -
GO:0043621 蛋白质自我关联 IEA -
GO:0043621 蛋白质自我关联 ISS -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0007399 神经系统的发展 塔斯 neurite (GO term level: 5) 8769099
GO:0018108 肽基 - 酪氨酸磷酸化 ISS -
GO：0046777 蛋白氨基酸自磷酸化 ISS -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005634 核 ISS -
GO：0016607 核斑点 ISS -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
CCNL2 Ania-6b |CCNM |DKFZP761A1210 |DKFZP762O195 |hcla-iso |HLA-ISO |PCEE |SB138 cyclin L2 - HPRD，Biogrid 14623875
CREB1 CREB | MGC9284 cAMP responsive element binding protein 1 DyRK1A与Creb相互作用并磷酸化。这种相互作用是建立在大鼠中人类dyrk1a和Creb之间的相互作用上建模的。 BIND 15694837
DNM1 DNM Dynamin 1 Reconstituted Complex BioGRID 11877424
植物 DYRK1AP3 | KIAA0273 | PAHX-AP | PAHXAP1 phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein DYRK1A与PAHX-AP1相互作用。 BIND 15694837
植物 DYRK1AP3 | KIAA0273 | PAHX-AP | PAHXAP1 phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein - HPRD 15694837
SFN 是的 stratifin 亲和力捕获ms BioGRID 15778465
SFRS1 ASF | MGC5228 | SF2 | SF2p33 | SRp30a 剪接因子，精氨酸/丝氨酸富含1 Biochemical Activity BioGRID 14623875
SFRS16 扣子|FLJ90109 |Swap2 剪接因子，精氨酸/丝氨酸富含16 Biochemical Activity BioGRID 14623875
SFRS4 SRP75 剪接因子，精氨酸/丝氨酸富4 Biochemical Activity BioGRID 14623875
SFRS5 HRS |SRP40 剪接因子，精氨酸/丝氨酸富含5 Biochemical Activity BioGRID 14623875
WDR68 an11 |han11 WD repeat domain 68 Affinity Capture-Western
Co-purification		 BioGRID 14593110
是的 14-3-3GAMMA 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，伽马多肽 - HPRD 15324660


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
BIOCARTA SHH PATHWAY 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G0和早期G1 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LMO4 TARGETS UP 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 6HR DN 41 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE PAPILLOMA PROGRESSION RISK 74 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特（Smith Tert） 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEOK RESPONSE TO HD MTX DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG GLUCOSE DEPRIVATION DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移 79 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD RESPONSE TO UV SCC DN 123 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D5 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD RESPONSE TO UV NHEK DN 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FINETTI BREAST CANCERS KINOME GRAY 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS PTEN DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan变量早期分化基因DN 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ TRANSLATION VIA FN1 SIGNALING 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
let-7/98 1905 1911 m8 HSA-LET-7A脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
HSA-LET-7B脑 UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E脑 UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU
miR-101 520 527 1A,m8 HSA-MIR-101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
mir-129-5p 2347 2353 1A hsa-miR-129脑 CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC
HSA-MIR-129-5P CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU
mir-137 763 769 m8 hsa-miR-137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir-144 521 527 1A hsa-miR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-145 1421 1428 1A,m8 hsa-miR-145 GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU
miR-148/152 754 761 1A,m8 HSA-MIR-148A UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa-miR-152脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
HSA-MIR-148B UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir-150 1838年 1845年 1A,m8 hsa-miR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 1345 1351 m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
hsa-miR-519d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir-182 330 336 m8 hsa-miR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
miR-192/215 1985 1992 1A,m8 hsa-miR-192 CUGACCUAUGAAUUGACAGCC
HSA-MIR-215 AUGACCUAUGAAUUGACAGAC
mir-193 785 791 m8 hsa-miR-193a Aacuggccuacaaagucccag
hsa-miR-193b AACUGGCCCUCAAAGUCCCGCUUU
miR-203.1 869 875 1A HSA-MIR-203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
miR-204/211 159 165 m8 HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir - 216 93 99 1A HSA-MIR-216 UAAUCUCAGCUGGCAACUGUG
mir - 217 515 522 1A,m8 HSA-MIR-217 UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU
mir-26 144 150 1A hsa-miR-26a脑 Uucaaguaauccaggauaggc
hsa-miR-26bSZ uucaaguaauucaggauagguu
hsa-miR-26a脑 Uucaaguaauccaggauaggc
hsa-miR-26bSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-27 1244 1250 1A hsa-miR-27a脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b脑 uucacaguggcuaaguucugc
miR-30-3p 920 926 1A hsa-miR-30a-3p cuuucagucggauguugcagc
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
miR-330 1067 1074 1A,m8 HSA-MIR-330脑 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
miR-346 903 909 1A HSA-MIR-346脑 ugucugccccgcaugccugccucu
mir-363 69 75 1A hsa-miR-363 AUUGCACGGUAUCCAUCUGUAA
mir-378 2122 2128 1A hsa-miR-378 cuccugacuccaggucugugu
miR-409-5p 1322 1328 1A hsa-miR-409-5p AGGUUACCCGAGCAACUUUGCA
miR-455 1308 1314 1A HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
mir-485-3p 2616 2622 m8 HSA-MIR-485-3P GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU
mir-486 2466 2472 1A hsa-miR-486 UCCUGUACUGAGCUGCCCCGAG
mir-495 17 23 m8 hsa-miR-495脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
mir-496 2688 2694 1A hsa-miR-496 AUUACAUGGCCAAUCUC
miR-544 1203 1209 m8 HSA-MIR-544 AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU
miR-9 1290 1296 m8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga