基因页:tor1a
概括?
基因 | 1861年 |
象征 | tor1a |
同义词 | DQ2 | Dyt1 |
描述 | Torsin家庭1成员A |
参考 | MIM:605204|HGNC:HGNC:3098|ENSEMBL:ENSG00000136827|HPRD:06897|Vega:Otthumg00000020794 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9q34 |
Pascal P值 | 0.029 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TOR1A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸(GO期限:7) | 9288096 |
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | 塔斯 | 9288096 | |
GO:0051082 | 展开的蛋白质结合 | 塔斯 | 10814722 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006457 | 蛋白质折叠 | 塔斯 | 9288096 | |
去:0006986 | 对展开蛋白的反应 | 塔斯 | 9288096 | |
GO:0051085 | 伴侣伴侣辅助因子蛋白折叠 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005788 | 内质网腔 | IEA | - | |
去:0005625 | 可溶性部分 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 10814722 | |
去:0005783 | 内质网 | 塔斯 | 10814722 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0031965 | 核膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PIDα突触核蛋白途径 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOH在CHR9Q中与LOH的Lindgren膀胱癌 | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
整合素信号传导 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |