基因页:E2F2
Summary?
GeneID | 1870年 |
Symbol | E2F2 |
同义词 | E2F-2 |
描述 | E2F转录因子2 |
参考 | MIM:600426|HGNC:HGNC:3114|Ensembl:ENSG00000007968|HPRD:02692|Vega:OTTHUMG00000003223 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 136 |
Pascal P值 | 0.502 |
胎儿β | 2.731 |
DMG | 1(# studies) |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASdb | Genome-wide Association Studies | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg02992252 | 1 | 23857546 | E2F2 | 3.136E-4 | -0.347 | 0.04 | DMG: Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/E2F2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
No co-expressed genes in brain regions
Section IV. Protein-protein interaction annotation
Interactors | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BCAR1 | CAS | CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas | 乳腺癌抗雌激素抵抗1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
BRD2 | D6S113E | DKFZp686N0336 | FLJ31942 | FSH | FSRG1 | KIAA9001 | NAT | RING3 | RNF3 | 包含2的溴结构域 | - | HPRD,Biogrid | 10965846|12145330 |
cdc25a | CDC25A2 | 细胞分裂周期25同源物A(S. Pombe) | E2F2与CDC25A启动子区域相互作用。 | 绑定 | 10766737 |
CDC6 | cdc18l |HSCDC18 |HSCDC6 | 细胞分裂周期6同源物(S. cerevisiae) | E2F2与CDC6启动子区域相互作用。 | 绑定 | 10766737 |
CDK3 | - | 细胞周期蛋白依赖性激酶3 | - | HPRD,Biogrid | 8846921|11733001 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | E2F2 interacts with the E2F1 promoter region. | 绑定 | 10766737 |
E2F4 | E2F-4 | E2F transcription factor 4, p107/p130-binding | E2F4与E2F2启动子相互作用。 | 绑定 | 15861133 |
EAPP | BM036 |C14orf11 |FLJ20578 |MGC4957 | E2F相关的磷蛋白 | E2F2 interacts with EAPP. | 绑定 | 15716352 |
FHL2 | AAG11 |Dral |Slim3 | four and a half LIM domains 2 | Two-hybrid | Biogrid | 12411495 |
FHL2 | AAG11 |Dral |Slim3 | four and a half LIM domains 2 | E2F2与基因FHL2表达的分子相互作用。未指定参与此相互作用的FHL2的精确分子变体。 | 绑定 | 12411495 |
GAB2 | KIAA0571 | GRB2相关的结合蛋白2 | GAB2启动子区域与E2F2相互作用。 | 绑定 | 15574337 |
JMY | FLJ37870 | MGC163496 | 结局和调节蛋白 | E2F2 interacts with the JMY promoter. | 绑定 | 15706352 |
MT1G | MGC12386 |MT1 |MT1K | metallothionein 1G | E2F2与MT1G启动子相互作用。 | 绑定 | 15735762 |
MYBL2 | B-MYB | BMYB | MGC15600 | V-Myb髓细胞增生病毒癌基因同源物(Avian)类似2 | E2F2与B-MYB启动子区域相互作用。 | 绑定 | 10766737 |
PPP1R13B | ASPP1 | KIAA0771 | p53BP2-like | p85 | 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基13B | E2F2与PPP1R13B(ASPP1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15706352 |
RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | E2F-2与PRB相互作用。 | 绑定 | 8246996 |
RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | - | HPRD,Biogrid | 12502741 |
RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | E2F1与PRB相互作用。 | 绑定 | 8246996 |
RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | PRB与E2F-2相互作用。 | 绑定 | 15949438 |
RBL1 | CP107 |MGC40006 |prb1 |P107 | 视网膜母细胞瘤状1(p107) | E2F2与p107启动子区域相互作用。 | 绑定 | 10766737 |
RBL2 | FLJ26459 | P130 | Rb2 | 视网膜母细胞瘤样2(P130) | RBL2(P130)与E2F2启动子相互作用。 | 绑定 | 15861133 |
RNF144A | KIAA0161 |RNF144 |ubce7ip4 | 环手指蛋白144a | Two-hybrid | Biogrid | 12411495 |
RYBP | AAP1 |dedaf |是的 | RING1和YY1结合蛋白 | E2F2 interacts with RYBP. | 绑定 | 12411495 |
RYBP | AAP1 |dedaf |是的 | RING1和YY1结合蛋白 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid |
Biogrid | 12411495 |
setd8 | KMT5A |pr-set7 |set07 |set8 | 含有含有赖氨酸甲基转移酶的固定结构域8 | E2F2与SET 07相互作用。 | 绑定 | 12411495 |
setd8 | KMT5A |pr-set7 |set07 |set8 | 含有含有赖氨酸甲基转移酶的固定结构域8 | Two-hybrid | Biogrid | 12411495 |
SP1 | - | SP1转录因子 | - | HPRD | 8657141|8657142 |9694791 |
刺 | SPI-B | Spi-B transcription factor (Spi-1/PU.1 related) | Two-hybrid | Biogrid | 12748276 |
TFDP1 | DP1 | DRTF1 | Dp-1 | transcription factor Dp-1 | - | HPRD | 7739537|8755520 |
TFDP2 | DP2 | Dp-2 | 转录因子DP-2(E2F二聚体伙伴2) | - | HPRD | 7739537|8755520 |
TP53BP2 | 53bp2 |aspp2 |BBP |ppp1r13a |p53bp2 | 肿瘤蛋白p53结合蛋白,2 | E2F2与TP53BP2(ASPP2)启动子相互作用。 | 绑定 | 15706352 |
TP53INP1 | DKFZp434M1317 | FLJ22139 | SIP | TP53DINP1 | TP53INP1A | TP53INP1B | Teap | p53DINP1 | 肿瘤蛋白p53诱导核蛋白1 | E2F2 interacts with the TP53INP1 promoter. | 绑定 | 15706352 |
uxt | ART-27 | 普遍表达的转录本 | E2F2与UXT染色质相互作用。 | 绑定 | 11799066 |
yy1 | DELTA | INO80S | NF-E1 | UCRBP | YIN-YANG-1 | YY1转录因子 | - | HPRD | 12411495 |