总结吗?
GeneID 1871年
象征 E2F3
同义词 E2F-3
描述 E2F转录因子3
参考 MIM: 600427|HGNC: HGNC: 3115|运用:ENSG00000112242|HPRD: 02693|织女:OTTHUMG00000016389
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 6第22位
帕斯卡假定值 0.069
夏洛克假定值 0.527
胎儿β 0.309
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.033

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg09133386 6 20404188 E2F3 7.39平台以及 -0.018 9.98 e - DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs7270082 chr20 17036184 E2F3 1871年 0.18 反式
rs7274416 chr20 17040352 E2F3 1871年 0.07 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003700 转录因子的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0003700 转录因子的活动 助教 8246996
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 17438371
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006367 从RNA聚合酶II启动子转录起始 助教 8246996
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0007049 细胞周期 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -
去:0005654 核浆 经验值 9190208
去:0005667 转录因子复杂 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
BIRC5 API4 | EPR-1 baculoviral IAP repeat-containing 5 E2F3 (E2F-3)与BIRC5交互(存活素)启动子。 绑定 15271987
CDC2 CDC28A | CDK1 | DKFZp686L20222 | MGC111195 细胞分裂周期2,G1和G2 M E2F3与Cdc2启动子进行交互。 绑定 10766737
CDC25A CDC25A2 细胞分裂周期25同族体(s .非洲酒) E2F3与Cdc25A启动子进行交互。 绑定 10766737
cdc 6 CDC18L | HsCDC18 | HsCDC6 细胞分裂周期6同族体(酵母) E2F3与cdc 6启动子进行交互。 绑定 10766737
CDK3 - - - - - - 细胞周期蛋白依赖性激酶3 - - - - - - HPRD, BioGRID 8846921|11733001
CREBBP 海关与边境保护局| KAT3A | rst 结合蛋白分子 2台混合动力 BioGRID 12748276
EAPP BM036 | C14orf11 | FLJ20578 | MGC4957 E2F-associated磷蛋白质 E2F3与EAPP交互。 绑定 15716352
FHL2 AAG11 | DRAL | SLIM3 四个半LIM域2 2台混合动力 BioGRID 12411495
FHL2 AAG11 | DRAL | SLIM3 四个半LIM域2 FHL2 E2F3与分子表达的基因。的精确分子变异FHL2参与这种交互没有指定。 绑定 12411495
GAB2 KIAA0571 GRB2-associated结合蛋白2 Gab2启动子区域与E2F3交互。 绑定 15574337
JMY FLJ37870 | MGC163496 junction-mediating蛋白质和监管 E2F3与JMY启动子进行交互。 绑定 15706352
首先 FLJ12634 | KIAA0518 | MAD5 | MXD5 马克斯基因相关 2台混合动力 BioGRID 12748276
MSH2 COCA1 | FCC1 | HNPCC | HNPCC1 | LCFS2 傻瓜同族体2,结肠癌,非息肉病性1型(大肠杆菌) E2F3与MSH2启动子进行交互。 绑定 11799067
MT1G MGC12386 | MT1 | MT1K 金属硫蛋白1克 E2F3与MT1G启动子进行交互。 绑定 15735762
MYBL2 B-MYB | BMYB | MGC15600 v-myb成髓细胞瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感)——2 E2F3与B-myb启动子区域。 绑定 10766737
MYBL2 B-MYB | BMYB | MGC15600 v-myb成髓细胞瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感)——2 2台混合动力 BioGRID 12748276
PKIB FLJ23817 | PRKACN2 β蛋白激酶(cAMP-dependent催化)抑制剂 2台混合动力 BioGRID 12748276
PPP1R13B ASPP1 | KIAA0771 | p53BP2-like | p85 蛋白磷酸酶1、监管(抑制剂)13 b亚基 E2F3与PPP1R13B交互(ASPP1)启动子。 绑定 15706352
RNF144A KIAA0161 | RNF144 | UBCE7IP4 无名指蛋白质144 2台混合动力 BioGRID 12411495
RYBP AAP1 | DEDAF | YEAF1 RING1 YY1结合蛋白 亲和力Capture-Western
2台混合动力
BioGRID 12411495
RYBP AAP1 | DEDAF | YEAF1 RING1 YY1结合蛋白 E2F3与RYBP交互。 绑定 12411495
SP1 - - - - - - Sp1转录因子 - - - - - - HPRD 8657141
SPIB SPI-B Spi-B转录因子(Spi-1 / PU。1相关) 2台混合动力 BioGRID 12748276
TEAD3 DTEF-1 | ETFR-1 | TEAD5 | TEF-5 | TEF5 茶域家庭成员3 2台混合动力 BioGRID 12748276
TFDP1 DP1 | DRTF1 | Dp-1 转录因子Dp-1 - - - - - - HPRD 7739537|8755520
TFDP2 DP2 | Dp-2 转录因子Dp-2 (E2F二聚合作伙伴2) - - - - - - HPRD 7739537|8755520
TFE3 RCCP2 | TFEA | bHLHe33 转录因子结合IGHM增强器3 - - - - - - HPRD, BioGRID 12748276
TP53BP2 53 bp2 | ASPP2 | BBP | PPP1R13A | p53BP2 肿瘤蛋白质p53结合蛋白2 E2F3与TP53BP2交互(ASPP2)启动子。 绑定 15706352
TP53INP1 DKFZp434M1317 | FLJ22139 SIP | | TP53DINP1 | TP53INP1A | TP53INP1B | Teap | p53DINP1 肿瘤蛋白质p53诱导核1 E2F3与TP53INP1启动子进行交互。 绑定 15706352
UXT ART-27 广泛表达文字记录 E2F3与UXT染色质。 绑定 11799066
WNK1 KDP | KIAA0344 | PHA2C | PRKWNK1 |相移键控 WNK赖氨酸缺乏蛋白激酶1 2台混合动力 BioGRID 12748276
YY1 三角洲| INO80S | NF-E1 | UCRBP | YIN-YANG-1 YY1转录因子 - - - - - - HPRD 12411495


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG细胞周期 128年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG通路在癌症 328年 259年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG胰腺癌 70年 56 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG神经胶质瘤 65年 56 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG前列腺癌 89年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG黑色素瘤 71年 57 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG膀胱癌 42 33 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG慢性骨髓性白血病 73年 59 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG小细胞肺癌 84年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG非小细胞肺癌 54 47 所有SZGR 2.0基因通路
PID E2F通路 74年 48 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC活性途径 79年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
PID P53下游通路 137年 94年 所有SZGR 2.0基因通路
PID 1 RB通路 65年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞周期 421年 253年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME前切口转录和翻译 29日 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME前切口表达和处理 44 24 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞周期有丝分裂 325年 185年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME G1期 38 23 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME cdc 6与兽人来源复杂 11 5 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME M G1过渡 81年 45 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME有丝分裂G1 G1年代阶段 137年 79年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME有丝分裂M M G1阶段 172年 98年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME有丝分裂G2 G2 M阶段 81年 50 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME组装前的复制的复杂 65年 36 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过切口 103年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME DNA复制 192年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
刘SOX4目标了 137年 94年 所有SZGR 2.0基因通路
森古普塔鼻咽癌起来 294年 178年 所有SZGR 2.0基因通路
王LMO4目标了 372年 227年 所有SZGR 2.0基因通路
多德鼻咽癌DN 1375年 806年 所有SZGR 2.0基因通路
NUNODA反应达沙替尼伊马替尼 29日 20. 所有SZGR 2.0基因通路
奥尔森E2F3 DN的目标 49 33 所有SZGR 2.0基因通路
香港E2F3目标 97年 58 所有SZGR 2.0基因通路
农民乳腺癌顶浆分泌和基底 330年 217年 所有SZGR 2.0基因通路
乳腺癌基底VS LULMINAL农民 330年 215年 所有SZGR 2.0基因通路
与6 p放大GRASEMANN视网膜母细胞瘤 14 14 所有SZGR 2.0基因通路
帕蒂尔肝癌 747年 453年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN 483年 336年 所有SZGR 2.0基因通路
牛津RALA或RALB目标 48 23 所有SZGR 2.0基因通路
SHETH肝癌VS TXNIP PAM1损失 229年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
魏MYCN目标与E箱 795年 478年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼肿瘤分化适度VS差 121年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
科特伊斯衰老触发器 6 5 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH NANOG目标 988年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SOX2目标 734年 436年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES核心九相关 One hundred. 68年 所有SZGR 2.0基因通路
GOTTWEIN KSHV米尔K12 11的目标 63年 45 所有SZGR 2.0基因通路
丁肺癌拷贝数的表达式 One hundred. 62年 所有SZGR 2.0基因通路
任受E2F 61年 40 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 555年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线SCC DN 123年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒18人力资源 178年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
外邦人紫外线高剂量DN 312年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
BRCA1和BRCA2 HEDENFALK乳腺癌 163年 113年 所有SZGR 2.0基因通路
犹太人的紫外响应集群D1 18 13 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线这些DN 318年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染24小时血巨细胞病毒 148年 96年 所有SZGR 2.0基因通路
道格拉斯BMI1目标了 566年 371年 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三乳腺癌基底 648年 398年 所有SZGR 2.0基因通路
BONCI MIR15A MIR16 1的目标 91年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
陆肿瘤血管生成了 25 22 所有SZGR 2.0基因通路
吴肝癌复发 105年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
党MYC目标了 143年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
党受MYC 1103年 714年 所有SZGR 2.0基因通路
黄胚胎干细胞核心 335年 193年 所有SZGR 2.0基因通路
CHANDRAN转移了 221年 135年 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK胶质母细胞瘤颈板 177年 132年 所有SZGR 2.0基因通路
约翰斯通PARVB目标2 DN 336年 211年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应早期晚了 317年 190年 所有SZGR 2.0基因通路
李BMP2 DN的目标 882年 538年 所有SZGR 2.0基因通路
段PRDM5目标 79年 52 所有SZGR 2.0基因通路
RAFFEL VEGFA目标了 9 8 所有SZGR 2.0基因通路
KUMAR病原体负载由巨噬细胞 275年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 1839年 928年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-10 3180年 3186年 m8 hsa-miR-10a UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG
hsa-miR-10b UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU
miR-124/506 418年 424年 m8 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-125/351 1185年 1192年 1、m8 hsa - mir - 125 b大脑 UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA
hsa - mir - 125 a大脑 UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG
mir - 128 2039年 2045年 m8 hsa - mir - 128 a UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
hsa - mir - 128 b UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir - 140 1740年 1747年 1、m8 hsa - mir - 140大脑 AGUGGUUUUACCCUAUGGUAG
miR-141/200a 2603年 2610年 1、m8 hsa - mir - 141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa - mir - 200 a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
hsa - mir - 141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa - mir - 200 a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
mir - 145 2029年 2035年 1 hsa - mir - 145 GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU
miR-148/152 2037年 2043年 m8 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
miR-15/16/195/424/497 2491年 2498年 1、m8 hsa-miR-15a大脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
hsa-miR-16大脑 UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
hsa-miR-15b大脑 UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
hsa - mir - 195深圳 UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
hsa - mir - 424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
hsa - mir - 497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir - 153 1786年 1792年 1 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d 1824年 1831年 1、m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
hsa-miR-20a大脑 UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 106 a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa - mir - 106 b深圳 UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20b深圳 CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 519 d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir - 194 3176年 3182年 1 hsa - mir - 194 UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA
mir - 200 bc / 429 2857年 2863年 m8 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
miR-21 564年 570年 1 hsa-miR-21大脑 UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA
hsa - mir - 590 GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG
miR-24 * 3057年 3064年 1、m8 hsa - mir - 189 GUGCCUACUGAGCUGAUAUCAGU
miR-25/32/92/363/367 272年 278年 m8 hsa-miR-25大脑 CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA
hsa-miR-32 UAUUGCACAUUACUAAGUUGC
hsa - mir - 92 UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG
hsa - mir - 367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
hsa - mir - 92 b深圳 UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC
miR-30-5p 870年 876年 m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
miR-34/449 2730年 2737年 1、m8 hsa-miR-34a大脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
hsa-miR-34c AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
hsa - mir - 449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
hsa - mir - 449 b AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC
mir - 342 1252年 1258年 m8 hsa - mir - 342大脑 UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUC
mir - 370 1111年 1117年 m8 hsa - mir - 370大脑 GCCUGCUGGGGUGGAACCUGG
mir - 378 1429年 1435年 1 hsa - mir - 378 CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU
hsa - mir - 378 CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU
mir - 433 - 3 - p 107年 114年 1、m8 hsa - mir - 433大脑 AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU
mir - 448 1785年 1792年 1、m8 hsa - mir - 448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU
mir - 495 3174年 3180年 1 hsa - mir - 495大脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
mir - 496 3125年 3131年 1 hsa - mir - 496 AUUACAUGGCCAAUCUC
mir - 500 1880年 1886年 m8 hsa - mir - 500 AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG
mir - 503 2492年 2498年 1 hsa - mir - 503 UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG