基因页：EBF1

Summary？
基因ID 1879年
Symbol EBF1
同义词 COE1 | EBF | O/E-1 | OLF1
描述 早期B细胞因子1
参考 MIM：164343|HGNC：HGNC：3126|Ensembl:ENSG00000164330|HPRD：01256|Vega：Otthumg00000130304
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q34
Pascal P值 0.016
胎儿β -0.488
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0032
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） Psr: 0.00459
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(European-ancestry samples) PSR：0.01718
Literature 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG00251610 5 158527817 EBF1 1.237E-4 -0.38 0.03 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 eQTL type
SNP_A-1919794 0 EBF1 1879年 0.09 反式
rs12104712 CHR2 82644947 EBF1 1879年 0.04 反式
RS7584986 CHR2 184111432 EBF1 1879年 2.686E-4 反式
RS6729020 CHR2 189064719 EBF1 1879年 0.06 反式
RS10491487 CHR5 80323367 EBF1 1879年 0.01 反式
rs1368303 CHR5 147672388 EBF1 1879年 5.325E-4 反式
RS9364293 CHR6 169199078 EBF1 1879年 0.04 反式
SNP_A-2077565 0 EBF1 1879年 0.16 反式
rs6574467 CHR14 79179744 EBF1 1879年 0.15 反式
RS10146003 CHR14 79191170 EBF1 1879年 0.15 反式
RS16955618 CHR15 29937543 EBF1 1879年 0 反式
RS17070739 CHR18 60819382 EBF1 1879年 0.08 反式
rs17085767 CHR18 69839397 EBF1 1879年 3.098E-4 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
彭 0.77 0.72
SLC25A39 0.76 0.72
chid1 0.76 0.70
PEX10 0.76 0.70
PSMD9 0.74 0.70
Creld2 0.74 0.68
C21orf33 0.74 0.72
TUFM 0.73 0.69
ruvbl2 0.73 0.67
taf6l 0.73 0.69
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-ATP8 -0.44 -0.44
AF347015.27 -0.44 -0.42
AF347015.8 -0.43 -0.40
AF347015.21 -0.42 -0.38
AF347015.31 -0.41 -0.38
mt-cyb -0.39 -0.37
MT-CO2 -0.39 -0.38
AF347015.33 -0.39 -0.38
AF347015.2 -0.39 -0.41
AF347015.15 -0.38 -0.38

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 反式cription factor activity IEA -
去：0005515 蛋白质结合 艾达 14594818
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
GO：0045941 转录的正调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Reactome发育生物学 396 292 All SZGR 2.0 genes in this pathway
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 72 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY DN 367 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向DN 260 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌UP 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 All SZGR 2.0 genes in this pathway
riz红细胞分化6小时 40 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BCR ABL1融合的klein目标 45 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kreppel CD99靶向DN 8 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 110 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu IL4信号传导 94 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang由Hoxa9和Meis1 DN永生 24 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
松本自然杀手差分 475 313 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2 DN 830 547 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yamashita在前列腺癌中甲基化 57 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C 47 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUAN PRDM5 TARGETS 79 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D 658 397 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang MLL目标 289 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PECE MAMMARY STEM CELL DN 146 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 520 526 1a HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-129-5p 424 430 1a HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-208 628 634 1a hsa-miR-208 AUAAGACGAGCAAAAAGCUUGU
miR-499 628 634 1a HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa