基因页:ECM1
概括?
基因 | 1893年 |
象征 | ECM1 |
同义词 | urbwd |
描述 | 细胞外基质蛋白1 |
参考 | MIM:602201|HGNC:HGNC:3153|Ensembl:ENSG00000143369|HPRD:03727|Vega:Otthumg0000000012806 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q21 |
Sherlock P值 | 0.211 |
胎儿β | -0.92 |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ECM1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HRCT1 | 0.76 | 0.12 |
SH3TC1 | 0.70 | 0.22 |
IGFBP1 | 0.69 | 0.19 |
AF347015.18 | 0.68 | 0.06 |
C10orf10 | 0.67 | 0.28 |
AC010300.1 | 0.62 | 0.09 |
SDPR | 0.62 | 0.47 |
IL4R | 0.58 | 0.30 |
TMEM204 | 0.57 | 0.08 |
Cldn5 | 0.57 | 0.18 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PIH1D1 | -0.44 | -0.31 |
TCEA2 | -0.44 | -0.33 |
polr3h | -0.43 | -0.31 |
smug1 | -0.43 | -0.27 |
C19orf62 | -0.43 | -0.27 |
CDK5 | -0.43 | -0.29 |
Imp4 | -0.43 | -0.24 |
grpel1 | -0.42 | -0.25 |
snap29 | -0.42 | -0.25 |
KHK | -0.42 | -0.31 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004871 | 信号传感器活性 | 小鬼 | 12761501 | |
去:0004871 | 信号传感器活性 | ISS | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0043123 | I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 | 小鬼 | 12761501 | |
GO:0043123 | I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 | ISS | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005578 | 蛋白质的细胞外基质 | nas | 9367673 | |
去:0005578 | 蛋白质的细胞外基质 | 塔斯 | 9367673 | |
去:0005615 | 细胞外空间 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DAVICIONI圆盾TS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合的TONKS目标维持在红细胞中 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer Pthlh靶向 | 112 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤DN | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Barretts食道和食道癌DN | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AML1 MTG8融合DN的DUNNE目标 | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马恶性皮肤肿瘤 | 16 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Akt1 48hr诱导的XU HGF靶标 | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向DN | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lenaour树突状细胞成熟 | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化新皮层DN | 80 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成DN | 64 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Smarca4目标 | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期16小时 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P7 | 90 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林黑色素瘤复制号码 | 73 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SAGIV CD24目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe Wnt3a靶向 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer肿瘤发生DN | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 | 128 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARSON FOXP3目标 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN | 68 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine乳头状甲状腺癌 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard UV响应集群G24 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ongusaha BRCA1靶向 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO上皮分化模块 | 69 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |