概括
基因 1893年
象征 ECM1
同义词 urbwd
描述 细胞外基质蛋白1
参考 MIM:602201|HGNC:HGNC:3153|Ensembl:ENSG00000143369|HPRD:03727|Vega:Otthumg0000000012806
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21
Sherlock P值 0.211
胎儿β -0.92
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HRCT1 0.76 0.12
SH3TC1 0.70 0.22
IGFBP1 0.69 0.19
AF347015.18 0.68 0.06
C10orf10 0.67 0.28
AC010300.1 0.62 0.09
SDPR 0.62 0.47
IL4R 0.58 0.30
TMEM204 0.57 0.08
Cldn5 0.57 0.18
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PIH1D1 -0.44 -0.31
TCEA2 -0.44 -0.33
polr3h -0.43 -0.31
smug1 -0.43 -0.27
C19orf62 -0.43 -0.27
CDK5 -0.43 -0.29
Imp4 -0.43 -0.24
grpel1 -0.42 -0.25
snap29 -0.42 -0.25
KHK -0.42 -0.31

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004871 信号传感器活性 小鬼 12761501
去:0004871 信号传感器活性 ISS -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0043123 I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 小鬼 12761501
GO:0043123 I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005578 蛋白质的细胞外基质 nas 9367673
去:0005578 蛋白质的细胞外基质 塔斯 9367673
去:0005615 细胞外空间 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI圆盾TS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合的TONKS目标维持在红细胞中 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤DN 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Barretts食道和食道癌DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AML1 MTG8融合DN的DUNNE目标 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马恶性皮肤肿瘤 16 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Akt1 48hr诱导的XU HGF靶标 14 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肯尼CTNNB1靶向DN 52 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟 114 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期16小时 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P7 90 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤复制号码 73 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SAGIV CD24目标DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer肿瘤发生DN 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 128 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN 68 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard UV响应集群G24 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ongusaha BRCA1靶向 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO上皮分化模块 69 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM糖蛋白 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因