基因页：S1PR1

Summary？
基因 1901年
象征 S1PR1
Synonyms CD363 | CHEDG1 | D1S3362 | ECGF1 | EDG-1 | EDG1 | S1P1
Description sphingosine-1-phosphate receptor 1
Reference MIM：601974|HGNC：HGNC：3165|ENSEMBL：ENSG00000170989|HPRD：03578|Vega：Otthumg0000000010835
基因类型 蛋白质编码
Map location 1p21
pascal p-value 0.064
Sherlock p-value 0.735
胎儿β -1.029
DMG 1(# studies)
主持人 Myers' cis & trans
Support g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

Gene in Data Sources
基因集名称 Method of gene set Description 信息
简历:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 Meta-analysis of gene expression p价值：1.738
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1
Network Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献：0.1709

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

probe 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
CG05053688 1 101702744 S1PR1 8.03e-11 -0.037 4.34e-7 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2068673 CHR12 60333402 S1PR1 1901年 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0001619 溶磷脂和溶物磷脂酸受体活性 IEA -
GO:0004872 受体活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 IEA 大脑（GO期限：7） -
GO:0001525 血管生成 IEA -
去：0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 TAS 8626678
GO:0007193 G蛋白信号传导，腺苷酸环化酶抑制途径 IEA -
去：0007165 信号转导 IEA -
GO:0008284 细胞增殖的阳性调节 IEA -
GO:0030155 regulation of cell adhesion IEA -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005886 质膜 TAS 8626678

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta EDG1途径 27 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID FCER1途径 62 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID S1P S13途径 29 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID S1P S1P1途径 21 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID S1P META途径 21 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID PDGFRB途径 129 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SIGNALING BY GPCR 920 449 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME GPCR DOWNSTREAM SIGNALING 805 368 All SZGR 2.0 genes in this pathway
我REACTOME Gα信号事件 195 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GPCR配体结合 408 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC UP 185 126 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori前BI淋巴细胞DN 77 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard BMYB目标 74 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KIM GERMINAL CENTER T HELPER DN 24 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Radmacher AML预后 78 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血干细胞 254 164 All SZGR 2.0 genes in this pathway
大脑衰老 262 186 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lein星形胶质细胞标记 42 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng由Foxp3绑定 491 310 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ACEVEDO LIVER CANCER UP 973 570 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌Kras DN 435 289 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE EARLY T LYMPHOCYTE DN 57 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VERHAAK GLIOBLASTOMA NEURAL 129 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hirsch细胞转换签名 242 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang MLL目标 289 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durand Stroma S向上 297 194 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ghandhi直接辐照DN 33 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-130/301 259 265 M8 HSA-MIR-130Abrain cagugcaauguaaaaggggau
hsa-miR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130bbrain Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-148/152 260 267 1A，M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152brain UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
miR-155 1127 1133 M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
miR-17-5p/20/93.mr/106/519.d 922 928 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
hsa-miR-20abrain UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-106a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa-miR-106bSZ UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20bSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
miR-181 1019 1026 1A，M8 HSA-MIR-181Abrain AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181Cbrain AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181Dbrain aacauucauuguugucggggguggguu
miR-19 258 264 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir-24 264 271 1A，M8 hsa-miR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-25/32/92/363/367 1256 1262 M8 hsa-miR-25brain Cauugcacuugucucggucuga
hsa-miR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-320 1341 1347 1a hsa-miR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-330 250 256 1a hsa-miR-330brain GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
miR-377 952 958 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-455 1335 1341 1a hsa-miR-455 UAUGUGCCUUUGGACUACAUCG