概括
基因 1912年
象征 PHC2
同义词 EDR2 | HPH2 | PH2
描述 多变性同源物2
参考 MIM:602979|HGNC:HGNC:3183|ENSEMBL:ENSG00000134686|HPRD:10340|Vega:Otthumg00000004133
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p34.3
Pascal P值 0.129
Sherlock P值 0.963
胎儿β 0.632
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
染色质重塑基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
PHC2 CHR1 33794548 一种 G NM_004427
NM_198040
p.247m> t
p.782m> t
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014
PHC2 CHR1 33820513 C t NM_198040 p.440v> m 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4653081 CHR1 33819829 PHC2 1912年 0.03 顺式
RS6678247 CHR1 33823268 PHC2 1912年 0.01 顺式
RS942485 CHR1 33855822 PHC2 1912年 0.01 顺式
RS4652871 CHR1 33862516 PHC2 1912年 0.05 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
AFG3L2 FLJ25993 AFG3 ATPase家族基因3样2(酵母) 两个杂交 Biogrid 16169070
BMI1 MGC12685 |PCGF4 |RNF51 BMI1 Polycomb环形指癌基因 - HPRD,Biogrid 9121482
BSDC1 DKFZP686B09139 |FLJ10276 包含1的BSD域 两个杂交 Biogrid 16169070
FHL3 MGC19547 |MGC23614 |MGC8696 |Slim2 四个半域3 两个杂交 Biogrid 16189514
LMO3 dat1 |MGC26081 |rbtn3 |rbtnl2 |Rhom3 |Rhom-3 Lim域仅3(菱形素状2) 两个杂交 Biogrid 16189514
MAPKAPK2 MK2 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶2 - HPRD,Biogrid 15094067
MAPKAPK3 3pk |MAPKAP3 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶3 3PK与HPH2相互作用。这种相互作用是基于未指定物种和人类HPH2的P3K之间的相互作用进行建模的。 绑定 15563468
MCM2 BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 微型鲜体维护复杂组件2 两个杂交 Biogrid 16169070
MCRS1 ICP22bp |INO80Q |MCRS2 |MSP58 |P78 微球蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 16189514
PHC1 EDR1 |HPH1 |RAE28 多性瘤同源物1(果蝇) - HPRD,Biogrid 9121482
PHC2 EDR2 |HPH2 |MGC163502 |PH2 多瘤同源物2(果蝇) 两个杂交 Biogrid 16189514
RPL7 MGC117326 |Huml7-1 核糖体蛋白L7 两个杂交 Biogrid 16169070
SCMH1 SCML3 性梳子上的Midleg同源1(果蝇) 两个杂交 Biogrid 16169070
SFMBT1 DKFZP434L243 |ru1 |SFMBT 类似于四个MBT域1的SCM。 两个杂交 Biogrid 16189514


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 67 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D4 55 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伦纳德缺氧 47 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
兰普早期丰富学习环境 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因