基因页:PHC2
概括?
基因 | 1912年 |
象征 | PHC2 |
同义词 | EDR2 | HPH2 | PH2 |
描述 | 多变性同源物2 |
参考 | MIM:602979|HGNC:HGNC:3183|ENSEMBL:ENSG00000134686|HPRD:10340|Vega:Otthumg00000004133 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p34.3 |
Pascal P值 | 0.129 |
Sherlock P值 | 0.963 |
胎儿β | 0.632 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PHC2 | CHR1 | 33794548 | 一种 | G | NM_004427 NM_198040 |
p.247m> t p.782m> t |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 | ||
PHC2 | CHR1 | 33820513 | C | t | NM_198040 | p.440v> m | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4653081 | CHR1 | 33819829 | PHC2 | 1912年 | 0.03 | 顺式 | ||
RS6678247 | CHR1 | 33823268 | PHC2 | 1912年 | 0.01 | 顺式 | ||
RS942485 | CHR1 | 33855822 | PHC2 | 1912年 | 0.01 | 顺式 | ||
RS4652871 | CHR1 | 33862516 | PHC2 | 1912年 | 0.05 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AFG3L2 | FLJ25993 | AFG3 ATPase家族基因3样2(酵母) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
BMI1 | MGC12685 |PCGF4 |RNF51 | BMI1 Polycomb环形指癌基因 | - | HPRD,Biogrid | 9121482 |
BSDC1 | DKFZP686B09139 |FLJ10276 | 包含1的BSD域 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
FHL3 | MGC19547 |MGC23614 |MGC8696 |Slim2 | 四个半域3 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
LMO3 | dat1 |MGC26081 |rbtn3 |rbtnl2 |Rhom3 |Rhom-3 | Lim域仅3(菱形素状2) | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
MAPKAPK2 | MK2 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶2 | - | HPRD,Biogrid | 15094067 |
MAPKAPK3 | 3pk |MAPKAP3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶3 | 3PK与HPH2相互作用。这种相互作用是基于未指定物种和人类HPH2的P3K之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15563468 |
MCM2 | BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 | 微型鲜体维护复杂组件2 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
MCRS1 | ICP22bp |INO80Q |MCRS2 |MSP58 |P78 | 微球蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 16189514 |
PHC1 | EDR1 |HPH1 |RAE28 | 多性瘤同源物1(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 9121482 |
PHC2 | EDR2 |HPH2 |MGC163502 |PH2 | 多瘤同源物2(果蝇) | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
RPL7 | MGC117326 |Huml7-1 | 核糖体蛋白L7 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SCMH1 | SCML3 | 性梳子上的Midleg同源1(果蝇) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SFMBT1 | DKFZP434L243 |ru1 |SFMBT | 类似于四个MBT域1的SCM。 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D4 | 55 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伦纳德缺氧 | 47 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
兰普早期丰富学习环境 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |